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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G163310
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 41695811-41702629 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4942 bp · TkA01G163310|TK1151|cDNA

ATAAGTCAAGAGTCAAGACCATTATACACGAATCAGTATCGTAAAGTTTACGCCGTAAACTGACAGGATGAGAATAAAATTTCATTCAAATTTGGTTGCTAATTTCTTACAAAGCTTCCAATACCTCAACTAAGTTCATCAATGTCATGTCATCAACATTCATTCATCCCACCATATCTCGAAGAACACATCAATGAAGGTTAGTCCCACCCTTCTATTCTTCTCCACTATCTTTCTTTTTTCCTCGTCAAGTTGTGCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2442 bp · TkA01G163310|TK1151|CDS

ATGAAGGTTAGTCCCACCCTTCTATTCTTCTCCACTATCTTTCTTTTTTCCTCGTCAAGTTGTGCTGCAATAGACACAATATCCGCAAATCAACGAATCAAAGATGGCCAAACGATCGTTTCCGATGGCGGGATGTACGAACTAGGGTTTTTTAATCCCGGAAAGTCCAGCAATCGTTACCTCGGAATATGGTACAAACAGATATCAATCTTCACGGTCGTGTGGGTTGCTAACAGGGAAACACCAATCAAAGATACATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

813 aa · TkA01G163310|TK1151|PROTEIN

MKVSPTLLFFSTIFLFSSSSCAAIDTISANQRIKDGQTIVSDGGMYELGFFNPGKSSNRYLGIWYKQISIFTVVWVANRETPIKDTSGVLEVSKEGTLLIHSGGNTSIWSSNSTISAMNFNRTANPTAQLLDNGNLVVWDESSTKESPIWESFDYPGNTWLPGMKLGKDFTTGRERYVTSWKSHDDPSLGLYKVWMDINGYPQIFKGERESLVELSRVGPWNGIRFRGFPIEDANPVYFEEFVVTQKEVYLRYKVKTSVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G163310
TK1151 IDTkA01G163310
OH-1004 IDLXL04_025659
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)62.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 79.705 / OH-1004 51.403
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G163310
位置Chr01:41695811-41702629 (-)
描述Similar to At4g27290: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27290 G型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g27290。 暂无已核实直接文献
At4g21380 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At4g27300 G型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 SD1-1。 暂无已核实直接文献
At1g65790 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At1g65800 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025659 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G21380
ath:AT4G27290
ath:AT4G27300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.864
排名 1 · TkA01G163310 · TK1151
内质网0.079
排名 2 · TkA01G163310 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA01G163310 · TK1151
细胞核0.040
排名 4 · TkA01G163310 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA01G163310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin72-182 aa
PF00954S_locus_glycop217-323 aa
PF08276PAN_2345-411 aa
PF00954S_locus_glycop357-386 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr501-767 aa
PF00069Pkinase501-764 aa
PF03109ABC1506-531 aa
PF03109ABC1611-650 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G163310PF01453B_lectin721822.9e-35121.6
TkA01G163310PF00954S_locus_glycop2173232.9e-2692.9
TkA01G163310PF08276PAN_23454112.8e-1866.5
TkA01G163310PF00954S_locus_glycop3573862.9e-2692.9
TkA01G163310PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5017671.4e-46159.6
TkA01G163310PF00069Pkinase5017645.8e-45154.5
TkA01G163310PF03109ABC15065310.0002720.9
TkA01G163310PF03109ABC16116500.0002720.9
TkA01G163310PF01636APH6156470.02315.2
TkA01G163310PF11883DUF34037757970.001719.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81832拟南芥sp|O81832|Y4729_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g2729050.400%Swiss-Prot高置信
O81905拟南芥sp|O81905|SD18_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-843.600%Swiss-Prot中等置信
O81833拟南芥sp|O81833|SD11_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-144.000%Swiss-Prot中等置信
Q39086拟南芥sp|Q39086|SD17_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-743.200%Swiss-Prot中等置信
Q9S972拟南芥sp|Q9S972|SD16_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-642.800%Swiss-Prot中等置信

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