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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G145570
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 36876167-36879425 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2202 bp · TkA01G145570|TK1151|cDNA

AAAAGAAGAAAATAGTGAAATGACAATAAAAAGTAAAGAAGTGGAAGGGCCAAATAAAACTTTGCTGCCTCGAAAGAGACATGAGAGCCAAAGATCCAAACCCTAATCAATTTTAGATAAAATTACCAAAACACCCCTGGGCCTCGCACCCTCCACTCTCTCATCATCATCATCAAGGTTCCAGCCTCGCAAGTAACAAAGGTGTTGCTGTCCCTCCGCAGGAGAAACTCCTCCTCACGCGCACGCAACGCGCCGCCCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1272 bp · TkA01G145570|TK1151|CDS

ATGTTTATCAAGGGATACTCAATTGCAAGTGTGGCAGAAATGGGCTGTTGTGGTTGCTTTGGGTTTTCATTTAGAAAAAAGCAGAAAAAGTCCAGGCCAAGAACATACATTGAGAATCACATTTCACAGCAGTTACTCTTAAACGAAGAAGAAGTAGAAGAAGAGGAAGAACACGAAGATGAAGAAGATGATGATAATTGCTCATATGATGATGACATATCCGACACTGAAAAAGAACACCATGATGAATTCAGGAATCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

423 aa · TkA01G145570|TK1151|PROTEIN

MFIKGYSIASVAEMGCCGCFGFSFRKKQKKSRPRTYIENHISQQLLLNEEEVEEEEEHEDEEDDDNCSYDDDISDTEKEHHDEFRNPAKRSEDILLYRTQNGLICREFPVKETHKVVRSEDENGNKMVNEYVRECKIGSGSYGKVVLYKSQVDGKHYAIKAFHKSHLLKLRVAPSETAMTDVLREVLIMKMLNHPNIVNLIEVIDDPNTDHFYMVLEYIEGKWVFEGSGPPGGLGQHVARSYLRDIVSGLMYLHSHNIVH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G145570
TK1151 IDTkA01G145570
OH-1004 IDLXL04_004482
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G145570
位置Chr01:36876167-36879425 (-)
描述Similar to GRIK2: Serine/threonine-protein kinase GRIK2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60550 分别通过磷酸化激活环“Thr-198”和“Thr-176”来激活 SnRK1.1/KIN10 和 SnRK1.2/KIN11。
Geminivirus infection up-regulates the expression of two Arabidopsis protein kinases related to yeast SNF1- and mammalian AMPK-activating kinases.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088476
DNA sequences from Arabidopsis, which encode protein kinases and function as upstream regulators of Snf1 in yeast.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611244200
Arabidopsis protein kinases GRIK1 and GRIK2 specifically activate SnRK1 by phosphorylating its activation loop.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.132787
Cross-phosphorylation between Arabidopsis thaliana sucrose nonfermenting 1-related protein kinase 1 (AtSnRK1) and its activating kinase (AtSnAK) determines their catalytic activities.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m109.079194
At3g45240 分别通过磷酸化激活环“Thr-198”和“Thr-176”来激活 SnRK1.1/KIN10 和 SnRK1.2/KIN11。
Geminivirus infection up-regulates the expression of two Arabidopsis protein kinases related to yeast SNF1- and mammalian AMPK-activating kinases.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088476
DNA sequences from Arabidopsis, which encode protein kinases and function as upstream regulators of Snf1 in yeast.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611244200
Arabidopsis protein kinases GRIK1 and GRIK2 specifically activate SnRK1 by phosphorylating its activation loop.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.132787
Cross-phosphorylation between Arabidopsis thaliana sucrose nonfermenting 1-related protein kinase 1 (AtSnRK1) and its activating kinase (AtSnAK) determines their catalytic activities.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m109.079194

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004482 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0010514 induction of conjugation with cellular fusion 生物过程
GO:0010971 positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0032956 regulation of actin cytoskeleton organization 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0042149 cellular response to glucose starvation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0051523 cell growth mode switching, monopolar to bipolar 生物过程
GO:0051726 regulation of cell cycle 生物过程
GO:0061762 CAMKK-AMPK signaling cascade 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45240
ath:AT5G60550
cel:CELE_C05H8.1
ddi:DDB_G0279405
spo:2538951
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.522
排名 1 · TkA01G145570 · TK1151
细胞核0.375
排名 2 · TkA01G145570 · TK1151
细胞膜0.265
排名 3 · TkA01G145570 · TK1151
高尔基体0.058
排名 4 · TkA01G145570 · TK1151
溶酶体／液泡0.056
排名 5 · TkA01G145570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13095FTA219-55 aa
PF05097DUF68826-74 aa
PF03109ABC1105-164 aa
PF00069Pkinase131-392 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr135-386 aa
PF13095FTA2146-171 aa
PF01163RIO1150-165 aa
PF01636APH170-256 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G145570PF13095FTA219550.006616.9
TkA01G145570PF05097DUF68826740.1412.0
TkA01G145570PF03109ABC11051640.01215.5
TkA01G145570PF00069Pkinase1313921.1e-58199.4
TkA01G145570PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1353861.4e-30107.2
TkA01G145570PF13095FTA21461710.006616.9
TkA01G145570PF01163RIO11501650.2211.9
TkA01G145570PF01636APH1702560.002318.4
TkA01G145570PF01163RIO11812180.2211.9
TkA01G145570PF03109ABC12082880.01215.5
TkA01G145570PF13095FTA22362690.006616.9
TkA01G145570PF14531Kinase-like2373422.5e-0627.7
TkA01G145570PF01163RIO12392830.2211.9
TkA01G145570PF17667Pkinase_fungal2433100.04813.1
TkA01G145570PF07387Seadorna_VP72472800.01115.5
TkA01G145570PF01636APH2582730.002318.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5HZ38拟南芥sp|Q5HZ38|GRIK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase GRIK272.800%Swiss-Prot高置信
Q93V58拟南芥sp|Q93V58|GRIK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase GRIK162.900%Swiss-Prot高置信

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