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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G141190
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 35845282-35850640 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3311 bp · TkA01G141190|TK1151|cDNA

ACCTGTCGCCTCTCTTCTTCTACACGCCAAGAAGATAGGGAGAGCTCCAAACAGCCTTTTCCGCTTTTTTTCTTTCTGGTTTTCTTGTGGGTTTCACGAGTTGTAAAGTTCGAAAATCGCAGTTTCTGAGCTCTGGGGTCTTTGTGTTTTGGAGGCTCTGAAAGGGTTAAATGAAAAAGGGGAGTTGAATTAGTGAAATTTTGAAGTTTGAACATTTCATGGTAGATTAAAAGTGTGTACGCAGAGAGTTCGATCGAACT...

CDS

下载 CDS FASTA

2535 bp · TkA01G141190|TK1151|CDS

ATGGCGATGGTAGTTCAACATCAACAGCATAAAGAGATGAGCAATAATACCAGCATCACCAAGCACCAGTTGGATAACGGGAAGTATGTCCGGTACACGACGGAGCAAGTTGAAGCTCTAGAAAGAGTTTACGCAGAATGCCCCAAACCCAGTTCTTTGAGGAGGCAACAATTAATCCGAGAATGCCCTATTTTGTCCAACATAGAACCTAAGCAAATCAAAGTCTGGTTTCAAAATCGCAGATGTCGAGAGAAGCAACG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

844 aa · TkA01G141190|TK1151|PROTEIN

MAMVVQHQQHKEMSNNTSITKHQLDNGKYVRYTTEQVEALERVYAECPKPSSLRRQQLIRECPILSNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKESSRLQTVNKKLSAMNKLLMEENDRLQKQVSQLVNENGYMRQQLHTSTDVSCESVVTTPQRSLRDANNPAGLLSIAEETLAEFLSKATGTAVDWVQMPGVKPGPDSVGIFAISQSCSGVAARACGLVSLEPTKIVEILKDRPSWFRDCRNLEVFTMFPAGNGGTIELLYTQI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G141190
TK1151 IDTkA01G141190
OH-1004 IDLXL04_004496
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G141190
位置Chr01:35845282-35850640 (-)
描述Similar to REV: Homeobox-leucine zipper protein REVOLUTA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60690 可能的转录因子参与花序茎中束间纤维和次生木质部分化的调节。
IFL1, a gene regulating interfascicular fiber differentiation in Arabidopsis, encodes a homeodomain-leucine zipper protein.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.11.2139
Alteration of auxin polar transport in the Arabidopsis ifl1 mutants.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.549
Amphivasal vascular bundle 1, a gain-of-function mutation of the IFL1/REV gene, is associated with alterations in the polarity of leaves, stems and carpels.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch051

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Z8L4 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os10g0480200 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XBL9 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os03g0640800 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004496 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009855 determination of bilateral symmetry 生物过程
GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程
GO:0009956 radial pattern formation 生物过程
GO:0010014 meristem initiation 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G60690
dosa:Os03g0640800
dosa:Os10g0480200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.633
排名 1 · TkA01G141190 · TK1151
细胞质0.321
排名 2 · TkA01G141190 · TK1151
细胞膜0.091
排名 3 · TkA01G141190 · TK1151
内质网0.053
排名 4 · TkA01G141190 · TK1151
质体0.037
排名 5 · TkA01G141190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24426HTH_NDX4-26 aa
PF00046Homeodomain7-23 aa
PF05920Homeobox_KN8-26 aa
PF26917Phage_APSE1_p498-31 aa
PF00046Homeodomain28-86 aa
PF05920Homeobox_KN47-83 aa
PF24426HTH_NDX66-84 aa
PF30681ZPR72-133 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G141190PF24426HTH_NDX4260.4111.3
TkA01G141190PF00046Homeodomain7232.6e-1556.7
TkA01G141190PF05920Homeobox_KN8260.1712.5
TkA01G141190PF26917Phage_APSE1_p498318.57.4
TkA01G141190PF00046Homeodomain28862.6e-1556.7
TkA01G141190PF05920Homeobox_KN47830.1712.5
TkA01G141190PF24426HTH_NDX66840.4111.3
TkA01G141190PF30681ZPR721330.007417.3
TkA01G141190PF07765KIP1761190.1512.9
TkA01G141190PF00170bZIP_1801250.001819.1
TkA01G141190PF02183HALZ981220.3611.7
TkA01G141190PF26917Phage_APSE1_p49981238.57.4
TkA01G141190PF05812Herpes_BLRF21131810.0813.8
TkA01G141190PF05920Homeobox_KN1171330.1712.5
TkA01G141190PF01852START1633712.1e-44152.1
TkA01G141190PF24426HTH_NDX5365540.4111.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SE43拟南芥sp|Q9SE43|REV_ARATH Homeobox-leucine zipper protein REVOLUTA78.600%Swiss-Prot高置信
A2Z8L4水稻sp|A2Z8L4|HOX9_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX971.900%Swiss-Prot高置信
Q9AV49水稻sp|Q9AV49|HOX9_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX971.900%Swiss-Prot高置信
A2XBL9水稻sp|A2XBL9|HOX10_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1070.800%Swiss-Prot高置信
Q6AST1水稻sp|Q6AST1|HOX32_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX3271.200%Swiss-Prot高置信

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