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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G132610
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 33569448-33569954 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

507 bp · TkA01G132610|TK1151|cDNA

ATGGACGCAGCTGATTTGCTAGCGAAATACACACACTATTGCCAAGTTTGCGGTAAAGGGTTCAAGAGAGATGCGAATTTAAGGATGCATATGAGAGCCCATGGGGATGAATACAAGTCCAATGCAGCTCTAGCGAATCCCATGGCGTCAAATGGTGGCAAAAAGATGAAACCAGCAAGGAAATATTCTTGCCCGCAAGAAGGGTGTAGATGGAACCGTAAGCATGAGAAGTTTCAGCCATTGAAGTCGATGGTTTGCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

507 bp · TkA01G132610|TK1151|CDS

ATGGACGCAGCTGATTTGCTAGCGAAATACACACACTATTGCCAAGTTTGCGGTAAAGGGTTCAAGAGAGATGCGAATTTAAGGATGCATATGAGAGCCCATGGGGATGAATACAAGTCCAATGCAGCTCTAGCGAATCCCATGGCGTCAAATGGTGGCAAAAAGATGAAACCAGCAAGGAAATATTCTTGCCCGCAAGAAGGGTGTAGATGGAACCGTAAGCATGAGAAGTTTCAGCCATTGAAGTCGATGGTTTGCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

168 aa · TkA01G132610|TK1151|PROTEIN

MDAADLLAKYTHYCQVCGKGFKRDANLRMHMRAHGDEYKSNAALANPMASNGGKKMKPARKYSCPQEGCRWNRKHEKFQPLKSMVCMKNHYKRSHCPKMYSCKRCQQKQFSVLSDLRTHEKHCGDVKWRCSCGTTFSRKDKLMGHVGLFMGHTPVDMDTSSSNKFQRS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G132610
TK1151 IDTkA01G132610
OH-1004 IDLXL04_004581
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.500
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G132610
位置Chr01:33569448-33569954 (-)
描述Similar to STOP2: Protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g22890 可能的转录因子。
STOP2 activates transcription of several genes for Al- and low pH-tolerance that are regulated by STOP1 in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1093/mp/sst116
At1g34370 可能的转录因子。
Zinc finger protein STOP1 is critical for proton tolerance in Arabidopsis and coregulates a key gene in aluminum tolerance.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0700117104
Aluminum-activated citrate and malate transporters from the MATE and ALMT families function independently to confer Arabidopsis aluminum tolerance.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03696.x
STOP1 regulates multiple genes that protect arabidopsis from proton and aluminum toxicities.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.134700
STOP2 activates transcription of several genes for Al- and low pH-tolerance that are regulated by STOP1 in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1093/mp/sst116

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0871200 可能参与铝耐受的概率转录因子。 暂无已核实直接文献
Os12g0170400 转录激活因子，调控参与铝（Al）耐受性的基因表达。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004581 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0010044 response to aluminum ion 生物过程
GO:0010447 response to acidic pH 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0071453 cellular response to oxygen levels 生物过程
GO:0071472 cellular response to salt stress 生物过程
GO:1900037 regulation of cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34370
ath:AT5G22890
ath:AT5G60470
dosa:Os01g0871200
dosa:Os12g0170400
osa:4324940
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · TkA01G132610 · TK1151
细胞质0.100
排名 2 · TkA01G132610 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA01G132610 · TK1151
线粒体0.012
排名 4 · TkA01G132610 · TK1151
内质网0.011
排名 5 · TkA01G132610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00096zf-C2H212-34 aa
PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD12-32 aa
PF13894zf-C2H2_412-34 aa
PF13912zf-C2H2_612-34 aa
PF12171zf-C2H2_jaz12-32 aa
PF23108Zf-C2H2_ZNF45112-35 aa
PF23115zf-C2H2_STOP2_3rd13-19 aa
PF12874zf-met13-32 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G132610PF00096zf-C2H212342e-0628.6
TkA01G132610PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD12322.3e-0627.9
TkA01G132610PF13894zf-C2H2_412340.0001123.3
TkA01G132610PF13912zf-C2H2_612340.0002121.9
TkA01G132610PF12171zf-C2H2_jaz12320.0003121.5
TkA01G132610PF23108Zf-C2H2_ZNF45112350.05613.9
TkA01G132610PF23115zf-C2H2_STOP2_3rd13192.3e-2279.4
TkA01G132610PF12874zf-met13320.003618.3
TkA01G132610PF22992C2CH-4th_BIRD-IDD16236.1e-0626.7
TkA01G132610PF23118zf-C2H2_STOP2_C17311.5e-1970.0
TkA01G132610PF21816Zap1_zf117310.02315.1
TkA01G132610PF26176zf_C2H2_17_218320.01615.9
TkA01G132610PF23165zf-C2H2_FBX4126310.3211.2
TkA01G132610PF23115zf-C2H2_STOP2_3rd62962.3e-2279.4
TkA01G132610PF00096zf-C2H262712e-0628.6
TkA01G132610PF26176zf_C2H2_17_262690.01615.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WT24拟南芥sp|Q0WT24|STOP2_ARATH Protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 274.500%Swiss-Prot高置信
Q9C8N5拟南芥sp|Q9C8N5|STOP1_ARATH Protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 158.700%Swiss-Prot高置信
Q943I6水稻sp|Q943I6|STOP1_ORYSJ Zinc finger protein STOP1 homolog63.900%Swiss-Prot高置信
Q2QX40水稻sp|Q2QX40|ART1_ORYSJ Zinc finger protein STAR360.500%Swiss-Prot高置信

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