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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G122070
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 30918875-30924020 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2282 bp · TkA01G122070|TK1151|cDNA

ATTTTCTTGAAGTTTTTTATTCATTCATTGTTTGTCTTCAAACCCCACAAAGAGAAGAAGAAAGGGGATATGTTGCAAGGACAAGATTTGTGTACTAGCCTATATGAGCTTCAAAATCCGTTGATAAGTTAATTTATCATAGAGATAAGGAAACCCTAGCGAACAATCAAACCAGGTTTCTTCATAAAGAAGGTGAAAGAAAGAAGATTAAGACCCCATGAAAGATGAAAAGTTGAAATGCTAAAAGAGAGACAGAAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1509 bp · TkA01G122070|TK1151|CDS

ATGGCGAGTCACCGAGTTGGAGAGACCGGTTTGTCAGACTCAGGACCTTCACACCATCACCATCACCACCAACACCTGCCATACTCTGTTTTTCCTGCCTTTAATCCTCCTAACACCGCCTTCATTAACCAAGAAGGGTCGTCGTTCGATTTTGGGGAGCTAGAAGAAGCTATAGTGCTTCAAGGTTACAACAAGATCCATGGTGATGAAACCAAATTACCTTTATACGCTACAGTACCAAGGCCAGCAGCTACTCTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

502 aa · TkA01G122070|TK1151|PROTEIN

MASHRVGETGLSDSGPSHHHHHHQHLPYSVFPAFNPPNTAFINQEGSSFDFGELEEAIVLQGYNKIHGDETKLPLYATVPRPAATLDMFPSWPMRVHQTPRGSNSSTDSGSAVNVAIPGKPETHSHIEPESPISSNSKKASSNQNQQQEQQHQQAIFRQQLQNLQIPEQNLEMESEGGSPVTTGGSSHSQQALKPFSEKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLETSRIRLTQLEQDLQRARSQGLFMSGGGGGGNLSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G122070
TK1151 IDTkA01G122070
OH-1004 IDLXL04_004690
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.455
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G122070
位置Chr01:30918875-30924020 (+)
描述Similar to TGA9: Transcription factor TGA9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08320 与 TGA10 一起，是花药发育所需的基本亮氨酸拉链转录因子，可能通过花药中 SPL 表达的激活以及通过在早期和中期绒毡层发育中具有功能的基因的调节。
Arabidopsis basic leucine-zipper transcription factors TGA9 and TGA10 interact with floral glutaredoxins ROXY1 and ROXY2 and are redundantly required for anther development.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.159111
Arabidopsis clade IV TGA transcription factors, TGA10 and TGA9, are involved in ROS-mediated responses to bacterial PAMP flg22.2016 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2016.06.019

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0152700 参与防御反应的转录调控因子。 暂无已核实直接文献
Os12g0152900 参与防御反应的转录调控因子。 暂无已核实直接文献
Os01g0859500 参与防御反应的转录调控因子（通过同源性推测）。 暂无已核实直接文献
Os05g0443900 参与防御反应的转录调控因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004690 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048653 anther development 生物过程
GO:0071588 hydrogen peroxide mediated signaling pathway 生物过程
GO:1905623 positive regulation of leaf development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08320
dosa:Os01g0859500
dosa:Os05g0443900
dosa:Os11g0152700
osa:4338933
osa:4349800
zma:541670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.853
排名 1 · TkA01G122070 · TK1151
细胞质0.214
排名 2 · TkA01G122070 · TK1151
细胞膜0.041
排名 3 · TkA01G122070 · TK1151
内质网0.027
排名 4 · TkA01G122070 · TK1151
线粒体0.018
排名 5 · TkA01G122070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03153TFIIA120-218 aa
PF01481Arteri_nucleo138-163 aa
PF07716bZIP_2148-163 aa
PF07716bZIP_2198-240 aa
PF01481Arteri_nucleo198-271 aa
PF00170bZIP_1199-239 aa
PF00535Glycos_transf_2253-315 aa
PF14144DOG1279-353 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G122070PF03153TFIIA1202183.78.1
TkA01G122070PF01481Arteri_nucleo1381630.1213.4
TkA01G122070PF07716bZIP_21481633.1e-0524.6
TkA01G122070PF07716bZIP_21982403.1e-0524.6
TkA01G122070PF01481Arteri_nucleo1982710.1213.4
TkA01G122070PF00170bZIP_11992392.3e-0731.5
TkA01G122070PF00535Glycos_transf_22533150.06413.9
TkA01G122070PF14144DOG12793534.8e-33113.9
TkA01G122070PF03153TFIIA3743893.78.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93XM6拟南芥sp|Q93XM6|TGA9_ARATH Transcription factor TGA960.400%Swiss-Prot高置信
Q53Q70水稻sp|Q53Q70|TGAL4_ORYSJ Transcription factor TGAL450.400%Swiss-Prot高置信
Q2QXL0水稻sp|Q2QXL0|TGL11_ORYSJ Transcription factor TGAL1169.900%Swiss-Prot中等置信
Q5N7C7水稻sp|Q5N7C7|LG2_ORYSJ Transcription factor LG265.800%Swiss-Prot高置信
Q6F2N0水稻sp|Q6F2N0|TGAL5_ORYSJ Transcription factor TGAL554.200%Swiss-Prot高置信

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