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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G119220
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 30200602-30201903 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

893 bp · TkA01G119220|TK1151|cDNA

TAGCTTTAAAGGTCCGCGGGTCATGACTTGTTCAAGACCTTGCCTCCTTTTTCCAATTTCACTCGGCAACTGTCGCTTTCACCAACACTATAAATAGCCTCACAACAACCAAAGCTCAAAGCATAAAAAACAATGGAAGACGATGATGACGAACACCACCCACCTTCAATATATCGATTCTACCCAACTGAACAAGAACTCATTTCCTTCTATCTCTGGAACAAGCTTCAAGACCTAAGAACACAAGACCTTAATCGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

537 bp · TkA01G119220|TK1151|CDS

ATGGAAGACGATGATGACGAACACCACCCACCTTCAATATATCGATTCTACCCAACTGAACAAGAACTCATTTCCTTCTATCTCTGGAACAAGCTTCAAGACCTAAGAACACAAGACCTTAATCGTGTCATCCCAGTTGTCCATGTCTACGAATACACTCCTTGTCACCTTCCAAGATTGGCTGGTGAGTTATGTCGCCGGGATACTGAGCAATGGTTCTTTTTTGTGCCAAGACAAGAAAGGGAAGCTCAGGGAGGAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

178 aa · TkA01G119220|TK1151|PROTEIN

MEDDDDEHHPPSIYRFYPTEQELISFYLWNKLQDLRTQDLNRVIPVVHVYEYTPCHLPRLAGELCRRDTEQWFFFVPRQEREAQGGRPSRTSAYGYWKATGSPTYVYSSDNKVIGLKKTMVFYEGKGSSVKKTEWKMNEYRLISNTFSVPQLRNELSICRVYVVSGTTRAFDRRPVWG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G119220
TK1151 IDTkA01G119220
OH-1004 IDLXL04_000446
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)57.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.011 / OH-1004 59.930
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G119220
位置Chr01:30200602-30201903 (-)
描述Similar to NAC090: NAC domain-containing protein 90
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g22380 含 NAC 域的蛋白质 90。 暂无已核实直接文献
At3g44350 推测 NAC 结构域含蛋白 61。 暂无已核实直接文献
At2g02450 作为开花抑制因子的转录因子。
Control of flowering time and cold response by a NAC-domain protein in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000642

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0133000 转录激活因子，结合序列特异性DNA基序。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000446 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0045770 positive regulation of asymmetric cell division 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048103 somatic stem cell division 生物过程
GO:0048829 root cap development 生物过程
GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程
GO:1902584 positive regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26870
ath:AT5G22380
dosa:Os03g0133000
gmx:732555
osa:4331520
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.706
排名 1 · TkA01G119220 · TK1151
细胞质0.310
排名 2 · TkA01G119220 · TK1151
细胞膜0.098
排名 3 · TkA01G119220 · TK1151
内质网0.068
排名 4 · TkA01G119220 · TK1151
细胞外0.027
排名 5 · TkA01G119220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365NAM14-142 aa
PF29529KH_YLL032C_4th127-161 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G119220PF02365NAM141422.7e-34119.0
TkA01G119220PF29529KH_YLL032C_4th1271610.2112.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FMR3拟南芥sp|Q9FMR3|NAC90_ARATH NAC domain-containing protein 9061.800%Swiss-Prot高置信
Q9M290拟南芥sp|Q9M290|NAC61_ARATH Putative NAC domain-containing protein 6154.900%Swiss-Prot高置信
Q9ZVP8拟南芥sp|Q9ZVP8|NAC35_ARATH NAC domain-containing protein 3543.000%Swiss-Prot中等置信
Q10S65水稻sp|Q10S65|NAC22_ORYSJ NAC domain-containing protein 2237.500%Swiss-Prot中等置信

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