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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G100660
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 25474362-25476815 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2157 bp · TkA01G100660|TK1151|cDNA

AGGCCAAGGTTTTTAGGTTCAAATCCATTATTTTGTTAAAATGGACGTTTAATGCATTCATATCTCGCAGCCTCTTCCTGTTTTCCCTCTCTTCCCACAATTCCCACCGGAAAATTTGATCCACCCTCCATTCTCCTTCATCTTCTACATATTTTGTCCCATTCAATTTCACATTTCTCTTGAGGAAATTCCACCTCCAATCTTCAACAGTCATGACCTGAGCACCATTTGGGCCCTTGTTTTATACGCCTAAACCATTC...

1455 bp · TkA01G100660|TK1151|CDS

ATGGAATCGGACATCCTGCCTGCGATAAAAATGCTGAAGTCATGTGAATGCGGGTATAATTGTTCTAGCCCTACTGTTAACGGGGCATGTACCCGAACATGGATTCGATCCGTGAAACGAAAACTCGATGAAGTTGAAGTCGAAAGAGAAAAGTTCATGATCTTATGTCCAGAAGTCGCTCACATCGAGATTGAAAACGAGTGCGGTGCGTTACGCGATATGGTTACCAGTCAACAAAAATCGATCCGTGATCTCTCCAC...

484 aa · TkA01G100660|TK1151|PROTEIN

MESDILPAIKMLKSCECGYNCSSPTVNGACTRTWIRSVKRKLDEVEVEREKFMILCPEVAHIEIENECGALRDMVTSQQKSIRDLSTELEEERNAASSAANEAMSMILRLQREKAEIEMEARQFKRFSEQKTNHDQHEIAVLEDLLYKREQTIQSLTCEVQAYKYRMMSYGLTESEAEGEKYVITSSNSIAANSENQFDFLPFEYPPLKCNTNEQHEHEQQQERHIYQESEHETIDHIDKYAFGETPRSLKDIEQRINQL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G100660
TK1151 IDTkA01G100660
OH-1004 IDLXL04_004871
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G100660
位置Chr01:25474362-25476815 (+)
描述Similar to MYOB7: Myosin-binding protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06560 膜锚定肌球蛋白受体,定义了独特的植物特异性运输囊泡区室。
At1g18265 类FLOURY 1蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004871 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005811 lipid droplet 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0030133 transport vesicle 细胞组分
GO:0017022 myosin binding 分子功能
GO:0080115 myosin XI tail binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08800
ath:AT1G70750
ath:AT2G30690
ath:AT5G06560
ath:AT5G16720
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.496
排名 1 · TkA01G100660 · TK1151
细胞核0.334
排名 2 · TkA01G100660 · TK1151
细胞膜0.188
排名 3 · TkA01G100660 · TK1151
高尔基体0.080
排名 4 · TkA01G100660 · TK1151
线粒体0.065
排名 5 · TkA01G100660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04521Viral_P1814-26 aa
PF17675APG6_N30-157 aa
PF28907ZapB_rel61-94 aa
PF04102SlyX65-94 aa
PF04576Zein-binding70-160 aa
PF26095CC_Bre173-122 aa
PF10187FAM192A_Fyv6_N77-152 aa
PF04102SlyX129-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G100660PF04521Viral_P1814262.78.5
TkA01G100660PF17675APG6_N301570.6111.3
TkA01G100660PF28907ZapB_rel61945.38.5
TkA01G100660PF04102SlyX65941.510.2
TkA01G100660PF04576Zein-binding701609.3e-35119.5
TkA01G100660PF26095CC_Bre1731220.4111.7
TkA01G100660PF10187FAM192A_Fyv6_N771527.27.6
TkA01G100660PF04102SlyX1291691.510.2
TkA01G100660PF28907ZapB_rel1361625.38.5
TkA01G100660PF04576Zein-binding2142339.3e-35119.5
TkA01G100660PF10187FAM192A_Fyv6_N2142517.27.6
TkA01G100660PF17675APG6_N2202330.6111.3
TkA01G100660PF26095CC_Bre12382380.4111.7
TkA01G100660PF28907ZapB_rel2502605.38.5
TkA01G100660PF04102SlyX2542611.510.2
TkA01G100660PF26095CC_Bre13624020.4111.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FG14拟南芥sp|Q9FG14|MYOB7_ARATH Myosin-binding protein 743.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LM24拟南芥sp|Q9LM24|FL1L_ARATH Protein FLOURY 1-like48.700%Swiss-Prot低置信

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