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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G099800
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 25252882-25257983 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2977 bp · TkA01G099800|TK1151|cDNA

GTTAAATTCAGTCGAATTCTGTTCTTCCCTCACCATTTCTACTACCTGTATCTAAACCTTATTAAAAACCTAAATCGTTGTTGATTCAATAGCAGATTGTCGTTACCAATGATGCAATTGGCGCCAGAAATACTTCCATTCGACTGAACCACAATCGATTCATGCTCTATCGTATTGGACATCAACGCCAATCACTTCTTCGTCTTCCCTTTCCTTCGTTAAGTCCTTCAACCCTCATTTTAACTAAATCTTCATCATTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2505 bp · TkA01G099800|TK1151|CDS

ATGCTCTATCGTATTGGACATCAACGCCAATCACTTCTTCGTCTTCCCTTTCCTTCGTTAAGTCCTTCAACCCTCATTTTAACTAAATCTTCATCATTAATATCTGCGGAATCACTTGTACTAGAACCTTCAACCACTTTACCAGCTGCAAACGGTTCATTTCCTTCCGATATCCTCTCTCTGTTTAAAGTATTGGGTAGCTCAGGTGTCAAATTACTCGGCGCAAAACATCGCTTTAAAACCCTTGTCTCCAATCTGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

834 aa · TkA01G099800|TK1151|PROTEIN

MLYRIGHQRQSLLRLPFPSLSPSTLILTKSSSLISAESLVLEPSTTLPAANGSFPSDILSLFKVLGSSGVKLLGAKHRFKTLVSNLSSTQVDKIIDYLRSHDPDSAVELFELLKNEYGFKHSRVSHFVIAHILASQRRLKLLRSNFMQMLQEEGSGSGPLLCELLSVNFKDWKANAIVWDMLAFAYSRSNMVNDALSLIDTMKDFNIQPSILTYNSLLYNLRHSHTMWDAYNDIKEAGIQETKQTTSIIIDGLCKQSLLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G099800
TK1151 IDTkA01G099800
OH-1004 IDLXL04_004885
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G099800
位置Chr01:25252882-25257983 (+)
描述Similar to At1g13630: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g13630
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g13630 推定的含重复的五聚肽序列蛋白At1g13630。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004885 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13630
ath:AT5G39710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.793
排名 1 · TkA01G099800 · TK1151
质体0.087
排名 2 · TkA01G099800 · TK1151
细胞核0.056
排名 3 · TkA01G099800 · TK1151
细胞质0.034
排名 4 · TkA01G099800 · TK1151
细胞膜0.010
排名 5 · TkA01G099800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17241Retrotran_gag_481-123 aa
PF23276TPR_2491-135 aa
PF19189Mtf291-115 aa
PF13041PPR_297-115 aa
PF01535PPR97-115 aa
PF12854PPR_1104-111 aa
PF13041PPR_2176-219 aa
PF12854PPR_1177-203 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G099800PF17241Retrotran_gag_4811230.02415.1
TkA01G099800PF23276TPR_24911359e-40136.4
TkA01G099800PF19189Mtf2911150.0001822.0
TkA01G099800PF13041PPR_2971152.5e-135441.2
TkA01G099800PF01535PPR971152.4e-88285.1
TkA01G099800PF12854PPR_11041112.8e-110360.4
TkA01G099800PF13041PPR_21762192.5e-135441.2
TkA01G099800PF12854PPR_11772032.8e-110360.4
TkA01G099800PF01535PPR1782072.4e-88285.1
TkA01G099800PF23276TPR_241782659e-40136.4
TkA01G099800PF13812PPR_31832181.3e-55186.0
TkA01G099800PF12921ATP131842060.01515.9
TkA01G099800PF19189Mtf21852350.0001822.0
TkA01G099800PF17177PPR_long1873502.2e-32112.9
TkA01G099800PF17177PPR_long1922272.2e-32112.9
TkA01G099800PF29070MSC6_N1993323.6e-2383.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMY5拟南芥sp|Q9LMY5|PPR41_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g1363039.800%Swiss-Prot低置信

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