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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G098320
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 24852673-24853454 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

525 bp · TkA01G098320|TK1151|cDNA

ATGGGCGATCATTCATCGGAAAGTACAACTCCACAAGCATCGGATACAACCGAACCTAGGGTTTTTTCCTGCAACTATTGCCAAAGGAAATTCTACAGCTCACAAGCACTAGGAGGCCATCAAAATGCCCACAAAAGAGAGAGAAATCTCGCGAAAAGAGGCCAGCGAATGACCGGTCCCATGATTTCAGCAGCTGCCGCTTTCGGCCATAGTTATATGCACCAACAACAACACCATGATCAGAACTACTGTTCGAGCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

525 bp · TkA01G098320|TK1151|CDS

ATGGGCGATCATTCATCGGAAAGTACAACTCCACAAGCATCGGATACAACCGAACCTAGGGTTTTTTCCTGCAACTATTGCCAAAGGAAATTCTACAGCTCACAAGCACTAGGAGGCCATCAAAATGCCCACAAAAGAGAGAGAAATCTCGCGAAAAGAGGCCAGCGAATGACCGGTCCCATGATTTCAGCAGCTGCCGCTTTCGGCCATAGTTATATGCACCAACAACAACACCATGATCAGAACTACTGTTCGAGCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

174 aa · TkA01G098320|TK1151|PROTEIN

MGDHSSESTTPQASDTTEPRVFSCNYCQRKFYSSQALGGHQNAHKRERNLAKRGQRMTGPMISAAAAFGHSYMHQQQHHDQNYCSSLSSLPLHGYNNNRSLGIQVHSMIHKPSNSMFSSSSSSSPGFKSFYGAKGWSSRPHVDHRNRDPPLGMFLSKRTYLEPLGSTIQQSKSI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G098320
TK1151 IDTkA01G098320
OH-1004 IDLXL04_024394
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.851 / OH-1004 97.790
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G098320
位置Chr01:24852673-24853454 (+)
描述Similar to ZFP3: Zinc finger protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g25160 在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At1g80730 可能在芽生长发育调控中起作用，位于光形态发生激活的下游（可能）。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
Expression analysis of an Arabidopsis C2H2 zinc finger protein gene.1996 · DOI: 10.1007/bf00020477
At1g66140 在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At1g24625 在发芽和早期幼苗发育过程中充当脱落酸 信号传导的负调节因子。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At5g57520 转录因子参与花器官脱落的调节，是种子和长角果发育所必需的。
Stamen abscission zone transcriptome profiling reveals new candidates for abscission control: enhanced retention of floral organs in transgenic plants overexpressing Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN2.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.110908
ZINC FINGER PROTEIN2 suppresses funiculus lignification to ensure seed loading efficiency in Arabidopsis.2025 · DOI: 10.1016/j.devcel.2025.01.021

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024394 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0060860 regulation of floral organ abscission 生物过程
GO:0060862 negative regulation of floral organ abscission 生物过程
GO:0080050 regulation of seed development 生物过程
GO:1901347 negative regulation of secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G24625
ath:AT1G66140
ath:AT1G80730
ath:AT5G25160
ath:AT5G57520
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.957
排名 1 · TkA01G098320 · TK1151
细胞质0.109
排名 2 · TkA01G098320 · TK1151
细胞膜0.033
排名 3 · TkA01G098320 · TK1151
内质网0.024
排名 4 · TkA01G098320 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA01G098320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13912zf-C2H2_621-46 aa
PF13894zf-C2H2_422-44 aa
PF00096zf-C2H222-44 aa
PF13912zf-C2H2_673-80 aa
PF13894zf-C2H2_474-79 aa
PF00096zf-C2H274-78 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G098320PF13912zf-C2H2_621460.0003821.1
TkA01G098320PF13894zf-C2H2_422440.0117.2
TkA01G098320PF00096zf-C2H222440.01716.3
TkA01G098320PF13912zf-C2H2_673800.0003821.1
TkA01G098320PF13894zf-C2H2_474790.0117.2
TkA01G098320PF00096zf-C2H274780.01716.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39262拟南芥sp|Q39262|ZFP3_ARATH Zinc finger protein 350.000%Swiss-Prot高置信
Q42485拟南芥sp|Q42485|ZFP1_ARATH Zinc finger protein 148.400%Swiss-Prot中等置信
Q39263拟南芥sp|Q39263|ZFP4_ARATH Zinc finger protein 453.100%Swiss-Prot中等置信
Q39266拟南芥sp|Q39266|ZFP7_ARATH Zinc finger protein 753.900%Swiss-Prot中等置信
Q39261拟南芥sp|Q39261|ZFP2_ARATH Zinc finger protein 288.900%Swiss-Prot低置信

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