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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G094600
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 23894208-23898526 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2128 bp · TkA01G094600|TK1151|cDNA

TGTCACGTCCTCCATTTCAAATTGAGCTTCACCCATTTCAAAATCCATCCAAAGATCAAAACTAGTCCAGGATTTAACCCTAATTTCCAGGAAAGGCAGGGCTTTTAAGCACACGCATGTCGTATTTACGCAGACAAAATACACATTGCACATTCCTCCTTTTGTCTCTTCTCTCTTGACTCCTTTTATGTCCAACAGCTGTAGATAGCTTCTTGGGCGAGCGCGCCCAAAACTCATATTGGGATTCCTTTTCAAAAACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1572 bp · TkA01G094600|TK1151|CDS

ATGGCCGGTGAAATCGCAGCGTCTCATAGGAGAGACCCCATCAAGAATACAGTTGGGAATGCTGCTGTACAACGGAGAAGACATCATGCTGTTTCAGTGGCGAAAGAAAGAAGAGAAGCGATGTTCAGAACCAAGCGATTGTGTACGGAAGGATTTAGCAACGACATGGATGTTCATGTCGCCATCAATGGCGACATGATGATTGAAGAGGAGCCATCAGTTCTAGAAGCTCAAACGTCTTCTGCTGTCGAAGAACTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

523 aa · TkA01G094600|TK1151|PROTEIN

MAGEIAASHRRDPIKNTVGNAAVQRRRHHAVSVAKERREAMFRTKRLCTEGFSNDMDVHVAINGDMMIEEEPSVLEAQTSSAVEELKLAIASKGIDTVQKKVNALRELRRLLSRSDFPFVEIALKSGAIPLLSQCLSFGSQDEQLLEAAWCLTNIAAGKPEETKSLVPTLPLLIAHLGDKSSLSVGEQCAWALGNVGGESEELRDLLLSQGALIPLARMMLQDKGTTVITASWALSNLIKGPHSEAATELIKIDGVVDAI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G094600
TK1151 IDTkA01G094600
OH-1004 IDLXL04_004952
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.558 / OH-1004 96.558
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G094600
位置Chr01:23894208-23898526 (+)
描述Similar to IMPA9: Importin subunit alpha-9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03070 结合常规核定位信号（NLS）基序，并介导蛋白穿过核膜的核内导入（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At4g16143 与传统的 NLS 基序结合并介导核蛋白跨核膜的输入。
SWO1 modulates cell wall integrity under salt stress by interacting with importin ɑ in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1007/s44154-021-00010-5

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0158000 特异性直接结合含有简单或双组分核定位信号 (NLS) 基序的底物。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004952 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006606 protein import into nucleus 生物过程
GO:0006607 NLS-bearing protein import into nucleus 生物过程
GO:0006612 protein targeting to membrane 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0031144 proteasome localization 生物过程
GO:0051170 import into nucleus 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G16143
ath:AT5G03070
dosa:Os01g0158000
sce:YNL189W
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.527
排名 1 · TkA01G094600 · TK1151
细胞核0.511
排名 2 · TkA01G094600 · TK1151
细胞膜0.060
排名 3 · TkA01G094600 · TK1151
高尔基体0.047
排名 4 · TkA01G094600 · TK1151
内质网0.045
排名 5 · TkA01G094600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24768ARM_ARMC596-149 aa
PF00514Arm98-116 aa
PF30746TMCO699-505 aa
PF13646HEAT_2103-120 aa
PF00514Arm123-157 aa
PF13646HEAT_2127-167 aa
PF13646HEAT_2141-207 aa
PF13513HEAT_EZ146-196 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G094600PF24768ARM_ARMC5961490.0002221.4
TkA01G094600PF00514Arm981169.7e-30102.3
TkA01G094600PF30746TMCO6995052.6e-1970.0
TkA01G094600PF13646HEAT_21031205.4e-0627.3
TkA01G094600PF00514Arm1231579.7e-30102.3
TkA01G094600PF13646HEAT_21271675.4e-0627.3
TkA01G094600PF13646HEAT_21412075.4e-0627.3
TkA01G094600PF13513HEAT_EZ1461968.8e-1039.6
TkA01G094600PF00514Arm1701959.7e-30102.3
TkA01G094600PF24768ARM_ARMC51842760.0002221.4
TkA01G094600PF00514Arm2012389.7e-30102.3
TkA01G094600PF13513HEAT_EZ2262388.8e-1039.6
TkA01G094600PF08324PUL2312660.02914.4
TkA01G094600PF00514Arm2482849.7e-30102.3
TkA01G094600PF13646HEAT_22542945.4e-0627.3
TkA01G094600PF03092BT12713660.01814.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KF65拟南芥sp|F4KF65|IMPA9_ARATH Importin subunit alpha-962.800%Swiss-Prot高置信
F4JL11拟南芥sp|F4JL11|IMPA2_ARATH Importin subunit alpha-229.800%Swiss-Prot低置信
Q9FYP9水稻sp|Q9FYP9|IMAP2_ORYSJ Importin subunit alpha-252.300%Swiss-Prot高置信

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