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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G089830
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 22827422-22830660 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

910 bp · TkA01G089830|TK1151|cDNA

CACACACACATACACAAACTAGTCTTTTCTACTAGCTAGGTTAAACTCTTTGCACAAAGGAAACTGCAACTTTGGAAACAACAAGGTGATCATATAGCATGGACTGGAATGGTGCGAATCCCAAACCATTTGCTCCTCGACCTGCAGGACAAAGCTCCTTCGCCTTTCTCTATAACTACAACAACGATCACTACGTATACCCACCTGCAGGATTGGGGGAGATGAAGCATTTGATGGAAATGAACCAAAATGAGTACGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

732 bp · TkA01G089830|TK1151|CDS

ATGGACTGGAATGGTGCGAATCCCAAACCATTTGCTCCTCGACCTGCAGGACAAAGCTCCTTCGCCTTTCTCTATAACTACAACAACGATCACTACGTATACCCACCTGCAGGATTGGGGGAGATGAAGCATTTGATGGAAATGAACCAAAATGAGTACGAAAACATAAATCAAGAGAAGAAGAAAAGATTAACAAATGAACAATTAGAGGCACTTGAGAACACTTTCCAGGAAGAGAAGAAACTTGACCCCGATACCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

243 aa · TkA01G089830|TK1151|PROTEIN

MDWNGANPKPFAPRPAGQSSFAFLYNYNNDHYVYPPAGLGEMKHLMEMNQNEYENINQEKKKRLTNEQLEALENTFQEEKKLDPDTKMKLSRELGLQPRQIAVWFQNRRARWKTKQLECLYDTLKQEFEAVSREKQKLQEEVLALRSILKEQVSKRQGGGSSTGYTHISGEETVESTSVATIRTTTNNNHHHHHPLKASQHQAAIAKTGAMTAVDSNYVLNYNPATSTPIPSFSNWAVLPSDP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G089830
TK1151 IDTkA01G089830
OH-1004 IDLXL04_005067
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)72.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G089830
位置Chr01:22827422-22830660 (+)
描述Similar to ATHB-51: Putative homeobox-leucine zipper protein ATHB-51
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03790 推测的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g36610 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g15150 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XD08 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os03g0170600 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005067 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010434 bract formation 生物过程
GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0048826 cotyledon morphogenesis 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69780
ath:AT2G36610
ath:AT5G03790
ath:AT5G65310
dosa:Os03g0188900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.979
排名 1 · TkA01G089830 · TK1151
细胞质0.071
排名 2 · TkA01G089830 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA01G089830 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA01G089830 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA01G089830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07798CCDC90-like41-93 aa
PF27247MJ167344-75 aa
PF07225NDUF_B447-68 aa
PF02183HALZ52-66 aa
PF00046Homeodomain60-113 aa
PF14357DUF440466-92 aa
PF05920Homeobox_KN84-111 aa
PF27247MJ1673108-180 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G089830PF07798CCDC90-like41930.01515.9
TkA01G089830PF27247MJ167344750.003818.0
TkA01G089830PF07225NDUF_B447680.01615.8
TkA01G089830PF02183HALZ52661.5e-0525.8
TkA01G089830PF00046Homeodomain601132.2e-1866.5
TkA01G089830PF14357DUF440466923.79.0
TkA01G089830PF05920Homeobox_KN841110.0001522.3
TkA01G089830PF27247MJ16731081800.003818.0
TkA01G089830PF07225NDUF_B41121560.01615.8
TkA01G089830PF02183HALZ1151491.5e-0525.8
TkA01G089830PF14357DUF44041151543.79.0
TkA01G089830PF00046Homeodomain1241302.2e-1866.5
TkA01G089830PF07798CCDC90-like1251570.01515.9
TkA01G089830PF05920Homeobox_KN1912070.0001522.3
TkA01G089830PF27247MJ16731932130.003818.0
TkA01G089830PF07225NDUF_B41952230.01615.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZR0拟南芥sp|Q9LZR0|ATB51_ARATH Putative homeobox-leucine zipper protein ATHB-5154.100%Swiss-Prot中等置信
Q4PSR7拟南芥sp|Q4PSR7|ATB22_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-2259.300%Swiss-Prot低置信
Q00466拟南芥sp|Q00466|HAT7_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT766.200%Swiss-Prot低置信
A2XD08水稻sp|A2XD08|HOX21_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX2155.800%Swiss-Prot低置信
Q8S7W9水稻sp|Q8S7W9|HOX21_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX2155.800%Swiss-Prot低置信

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