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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G087040
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 22179266-22179664 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

399 bp · TkA01G087040|TK1151|cDNA

ATGGCTGAAGAACAGGAATGGCACAAAGCAAGCAATCACGTCCTCTGCGCGAATAACTGCGGCTTTTTTGGTAGCCCGACGACGCTCAACCTCTGTTCTAAATGCTACAAAGATCATCGCCTGGAAGAACAACATATGTCGAACGCCAAATTAGTCGTTGAAAAAAGCCTCACACCGTCGGAAGTCCCACAACTACCATCATCGGAAACGTCTGCTTCCACAAGCACGGCAGTCTCTCTTTCCGTCGCTACAGATCTAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

399 bp · TkA01G087040|TK1151|CDS

ATGGCTGAAGAACAGGAATGGCACAAAGCAAGCAATCACGTCCTCTGCGCGAATAACTGCGGCTTTTTTGGTAGCCCGACGACGCTCAACCTCTGTTCTAAATGCTACAAAGATCATCGCCTGGAAGAACAACATATGTCGAACGCCAAATTAGTCGTTGAAAAAAGCCTCACACCGTCGGAAGTCCCACAACTACCATCATCGGAAACGTCTGCTTCCACAAGCACGGCAGTCTCTCTTTCCGTCGCTACAGATCTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

132 aa · TkA01G087040|TK1151|PROTEIN

MAEEQEWHKASNHVLCANNCGFFGSPTTLNLCSKCYKDHRLEEQHMSNAKLVVEKSLTPSEVPQLPSSETSASTSTAVSLSVATDLESGVVPASLSPAAVIMLLDLTVDIGGTGYVRESKKEREIKKEKRER

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G087040
TK1151 IDTkA01G087040
OH-1004 IDLXL04_005005
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.364 / OH-1004 44.882
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G087040
位置Chr01:22179266-22179664 (+)
描述Similar to SAP4: Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g36320 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
At1g12440 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
At2g27580 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
At4g12040 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0530300 可能参与环境胁迫反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005005 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0061630 ubiquitin protein ligase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12440
ath:AT2G36320
ath:AT4G12040
ath:AT4G22820
dosa:Os02g0530300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.525
排名 1 · TkA01G087040 · TK1151
细胞质0.461
排名 2 · TkA01G087040 · TK1151
细胞膜0.073
排名 3 · TkA01G087040 · TK1151
线粒体0.045
排名 4 · TkA01G087040 · TK1151
高尔基体0.043
排名 5 · TkA01G087040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01754zf-A2015-41 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G087040PF01754zf-A2015411.9e-1556.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJM6拟南芥sp|Q9SJM6|SAP4_ARATH Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 450.800%Swiss-Prot低置信
Q6NNI8拟南芥sp|Q6NNI8|SAP1_ARATH Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 157.100%Swiss-Prot低置信
Q9ZNU9拟南芥sp|Q9ZNU9|SAP3_ARATH Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 354.400%Swiss-Prot低置信
Q9SZ69拟南芥sp|Q9SZ69|SAP7_ARATH Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 758.100%Swiss-Prot低置信
Q6H754水稻sp|Q6H754|SAP5_ORYSJ Zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein 562.300%Swiss-Prot低置信

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