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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G083500
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 21301682-21304801 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1752 bp · TkA01G083500|TK1151|cDNA

TTTTACTTTTACGCGCCGACGCGGCCTATGAAGAATTTCGTCGTGTCATTATTTAATAAAGGCGAAGATGAATCCTATGGTTGATTGCTTCCCCTTCTCATTCATTTCATACCATCGTTTCTGGGTTCTTTCAAAAGAATATTTTATTTAATTTTGTCTCCATATGTACTAATTGTTTTCAAACTTTGAAACAAGAGAGAAATTTACTTCGAAAAGTCTAATCTTTCAACATTTTCCTTCACTTCTGTTTGTTATCTTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1056 bp · TkA01G083500|TK1151|CDS

ATGGTTTTCCATTTCCGATGTTTCTCTTTTCCATATGAACAAGATAGAATGCCTCCCGTATCAACCGCATCACACGACAGCACTTTCCATACCGCAAATTCACATTTTGATGCGACACGAATGAACATCCCAGATCTAAACGTAAACAAAAAACTCACAGTTTTCACCCACGCTGAACTTAAATCCGCCACCAAAAACTTTCACGATTCCAACAAACTTGGGGAAGGTGGATTTGCGATCGTATATAAAGGCACAGTAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

351 aa · TkA01G083500|TK1151|PROTEIN

MVFHFRCFSFPYEQDRMPPVSTASHDSTFHTANSHFDATRMNIPDLNVNKKLTVFTHAELKSATKNFHDSNKLGEGGFAIVYKGTVKTKKNRPIDIDVAVKQIKPGQQGYKTWVTEVNVLGEINHENLVKLIGLCNEDGQLLLVYEYMPKKSLDGHLSAKSNARLSWGRRLHIAKDAAKGLEHLHNSKIVFRDFKPSNILLDNNWNAKLSDFGFARDGPQDGRTHVSTMVVGTKGYAAPEYVQTGRLTTKIDVWSYGIFL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G083500
TK1151 IDTkA01G083500
OH-1004 IDLXL04_005035
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.430 / OH-1004 43.899
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G083500
位置Chr01:21301682-21304801 (-)
描述Similar to PCRK1: Serine/threonine-protein kinase PCRK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g09830 参与早期免疫反应的激活。
The receptor-like cytoplasmic kinase PCRK1 contributes to pattern-triggered immunity against Pseudomonas syringae in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1111/nph.13345
Functional characterization of PCRK1, a putative protein kinase with a role in immunity.2015 · DOI: 10.1080/15592324.2015.1063759
At5g03320 与 PCRK1 在对细菌病原体的基础抗性及植物免疫调控中功能冗余。 暂无已核实直接文献
At3g01300 参与几丁质触发的免疫信号传导，是活性氧 产生所必需的。
Tyrosine phosphorylation of the lectin receptor-like kinase LORE regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.15252/embj.2019102856
Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315
At5g15080 参与几丁质触发的免疫信号传导，是活性氧 产生所必需的。
Tyrosine phosphorylation of the lectin receptor-like kinase LORE regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.15252/embj.2019102856
Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315
At1g14370 参与抗病信号传导。
Receptor-like cytoplasmic kinases integrate signaling from multiple plant immune receptors and are targeted by a Pseudomonas syringae effector.2010 · DOI: 10.1016/j.chom.2010.03.007
xopAC-triggered immunity against Xanthomonas depends on Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase genes PBL2 and RIPK.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0073469
The Decoy Substrate of a Pathogen Effector and a Pseudokinase Specify Pathogen-Induced Modified-Self Recognition and Immunity in Plants.2015 · DOI: 10.1016/j.chom.2015.08.004
Ligand-triggered allosteric ADP release primes a plant NLR complex.2019 · DOI: 10.1126/science.aav5868

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005035 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0080142 regulation of salicylic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G09830
ath:AT5G03320
ath:AT5G47070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.627
排名 1 · TkA01G083500 · TK1151
细胞质0.322
排名 2 · TkA01G083500 · TK1151
细胞核0.218
排名 3 · TkA01G083500 · TK1151
高尔基体0.039
排名 4 · TkA01G083500 · TK1151
内质网0.038
排名 5 · TkA01G083500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase67-337 aa
PF03109ABC169-106 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr70-337 aa
PF10707YrbL-PhoP_reg121-205 aa
PF01636APH130-186 aa
PF03109ABC1142-231 aa
PF14531Kinase-like181-302 aa
PF01636APH189-219 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G083500PF00069Pkinase673371e-54186.4
TkA01G083500PF03109ABC1691060.004816.8
TkA01G083500PF07714PK_Tyr_Ser-Thr703371.7e-49169.2
TkA01G083500PF10707YrbL-PhoP_reg1212050.1812.2
TkA01G083500PF01636APH1301860.2311.9
TkA01G083500PF03109ABC11422310.004816.8
TkA01G083500PF14531Kinase-like1813020.0001322.1
TkA01G083500PF01636APH1892190.2311.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SF86拟南芥sp|Q9SF86|PCRK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase PCRK155.300%Swiss-Prot高置信
Q9LZF8拟南芥sp|Q9LZF8|PCRK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase PCRK249.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SRH7拟南芥sp|Q9SRH7|PBL35_ARATH Serine/threonine-protein kinase PBL3544.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LFP7拟南芥sp|Q9LFP7|PBL34_ARATH Serine/threonine-protein kinase PBL3444.600%Swiss-Prot中等置信
O49839拟南芥sp|O49839|PBL2_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL249.700%Swiss-Prot中等置信

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