TkA01G077160 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G077160

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 19688299-19689841 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA 无可用 cDNA 序列

cDNA

该参考版本没有可用的cDNA序列。

CDS

下载 CDS FASTA

507 bp · TkA01G077160|TK1151|CDS

ATGAGCGGTGTAGGGAAGAAGGTCGCCGATGTGGCGTTCAAGGCATCAAAGTCGATCGATTGGGATGGGATGGCGAAGATGATTGTCACCGACGAGGCTCGCAAGGAATTCTCCTCCCTCCGCCGTGCCTTTGAGGAAGTCAATTCCACTCTCCAGACCAAATTCAGTCAGGAACCAGAACCAATTGACTGGGAGTACTACAGAAAAGGACTTGGATCTCGCATTGTTGATTCGTACAAAGAATATTATGATAGTGTTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

168 aa · TkA01G077160|TK1151|PROTEIN

MSGVGKKVADVAFKASKSIDWDGMAKMIVTDEARKEFSSLRRAFEEVNSTLQTKFSQEPEPIDWEYYRKGLGSRIVDSYKEYYDSVEIPKFVDKTTPEYKPKFDALLVELKEAEQKSLKESERLEKEIADVQDLKKKLSTMTADEYFEKHPELKKKFDDEIRNDYWGY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G077160`
TK1151 ID	TkA01G077160
OH-1004 ID	LXL04_005193
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G077160

位置 Chr01:19688299-19689841 (+)

描述 Similar to At3g52300: ATP synthase subunit d, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g52300`	线粒体膜ATP合酶(F(1)F(0) ATP合酶或复合物V)在膜两侧存在质子梯度的情况下将ADP合成ATP，该质子梯度由呼吸链的电子传递复合物产生。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005193 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0015986 proton motive force-driven ATP synthesis 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分

GO:0009579 thylakoid 细胞组分

GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分

GO:0045259 proton-transporting ATP synthase complex 细胞组分

GO:0003735 structural constituent of ribosome 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G52300

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.899

排名 1 · TkA01G077160 · TK1151

细胞质0.064

排名 2 · TkA01G077160 · TK1151

细胞核0.055

排名 3 · TkA01G077160 · TK1151

质体0.011

排名 4 · TkA01G077160 · TK1151

细胞膜0.010

排名 5 · TkA01G077160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05873Mt_ATP-synt_D15-166 aa

PF05227CHASE316-57 aa

PF29423DUF854628-58 aa

PF06518DUF110430-53 aa

PF20648DUF680930-53 aa

PF28547CHD_PDZ-protease31-48 aa

PF26213TYRAAT1_C32-57 aa

PF24851DUF772546-72 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G077160	`PF05873`	Mt_ATP-synt_D	15	166	1.6e-18	67.7
TkA01G077160	`PF05227`	CHASE3	16	57	0.074	13.7
TkA01G077160	`PF29423`	DUF8546	28	58	0.89	10.8
TkA01G077160	`PF06518`	DUF1104	30	53	1.4	10.0
TkA01G077160	`PF20648`	DUF6809	30	53	1.7	10.2
TkA01G077160	`PF28547`	CHD_PDZ-protease	31	48	0.022	15.7
TkA01G077160	`PF26213`	TYRAAT1_C	32	57	0.23	11.9
TkA01G077160	`PF24851`	DUF7725	46	72	0.055	14.1
TkA01G077160	`PF20648`	DUF6809	84	148	1.7	10.2
TkA01G077160	`PF06518`	DUF1104	86	148	1.4	10.0
TkA01G077160	`PF28547`	CHD_PDZ-protease	90	165	0.022	15.7
TkA01G077160	`PF05227`	CHASE3	106	142	0.074	13.7
TkA01G077160	`PF29423`	DUF8546	109	164	0.89	10.8
TkA01G077160	`PF26213`	TYRAAT1_C	114	138	0.23	11.9
TkA01G077160	`PF24851`	DUF7725	121	161	0.055	14.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FT52`	拟南芥	sp\|Q9FT52\|ATP5H_ARATH ATP synthase subunit d, mitochondrial	85.700%	Swiss-Prot	高置信

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