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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G031880
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 8244069-8247482 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2555 bp · TkA01G031880|TK1151|cDNA

TAAATGTACATCCCCAAAAGCAAAGCCAATAATGTATATGGGTTAATTTATTTCTGAATGAGAAGCAAACAAAGGAAAGGACAAAACCATGCAACTTCAGACTCGTTTGCTTTTTGGTTTTTTGGTTTCATTTTGATGGGTCGCTTGAAAGAGGTCCAAATTTAGGGATACGTTCTGATCCACATCTCTCTCACTTTCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACCGTCTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1620 bp · TkA01G031880|TK1151|CDS

ATGAAGGGCATGTTTTTGGATGACAGTATGTCAAACTTAACATCAGCATCAAATGAAGCAAGCCTATCTTCATCAAGTAACAAGAATGAAGTTAGTACTACCATGTACCCTCCACCACAACAGATGCAACAGTCCTTAGCTTCTGTGCCAATTAATTCCAACAACCAAATACAAACTAATAACAAGAAAAAGAGAAATCTTCCAGGCAATCCAGACCCAGAAGCTGAGGTGATAGCAATGTCTCCGAAATCTCTAATGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

539 aa · TkA01G031880|TK1151|PROTEIN

MKGMFLDDSMSNLTSASNEASLSSSSNKNEVSTTMYPPPQQMQQSLASVPINSNNQIQTNNKKKRNLPGNPDPEAEVIAMSPKSLMATNRFVCEICNKGFQRDQNLQLHRRGHNLPWKLKQKSKLEVIRKKVYVCPEPSCVHHEPARALGDLTGIKKHFSRKHGEKKWKCEKCSKRYAVQSDWKAHSKICGTREYRCDCGTLFSRRDSFITHRAFCGALAGENARSSSSSSLLLSSNQLPLHLPINFPLKTEPQLHHLQQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G031880
TK1151 IDTkA01G031880
OH-1004 IDLXL04_005591
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G031880
位置Chr01:8244069-8247482 (+)
描述Similar to IDD7: Protein indeterminate-domain 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g55110 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g50700 转录因子，作为赤霉素 作用、稳态和信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献
At1g03840 转录因子，调节组织边界和非对称细胞分裂。
DELLA protein functions as a transcriptional activator through the DNA binding of the indeterminate domain family proteins.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1321669111
At5g03150 转录因子，与BIB共同通过快速上调'SCARECROW'（SCR）调控组织边界和不对称细胞分裂，从而控制'SHORT-ROOT'（SHR）的核定位并限制其作用。 暂无已核实直接文献
At4g02670 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005591 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008356 asymmetric cell division 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009937 regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010336 gibberellic acid homeostasis 生物过程
GO:0034504 protein localization to nucleus 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03840
ath:AT1G55110
ath:AT3G13810
ath:AT3G50700
ath:AT4G02670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.981
排名 1 · TkA01G031880 · TK1151
细胞质0.074
排名 2 · TkA01G031880 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA01G031880 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA01G031880 · TK1151
质体0.007
排名 5 · TkA01G031880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04810zf-Sec23_Sec2487-98 aa
PF23250zf_DPOE_287-103 aa
PF17283Zn_ribbon_SprT88-100 aa
PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD90-100 aa
PF00096zf-C2H291-113 aa
PF13894zf-C2H2_491-113 aa
PF23447DUF712891-100 aa
PF22996C2H2-2nd_BIRD-IDD129-163 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G031880PF04810zf-Sec23_Sec2487980.1812.5
TkA01G031880PF23250zf_DPOE_2871030.1912.2
TkA01G031880PF17283Zn_ribbon_SprT881002.88.7
TkA01G031880PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD901002.8e-1556.4
TkA01G031880PF00096zf-C2H2911133.3e-0834.2
TkA01G031880PF13894zf-C2H2_4911130.1513.5
TkA01G031880PF23447DUF7128911002.19.0
TkA01G031880PF22996C2H2-2nd_BIRD-IDD1291631.5e-2280.1
TkA01G031880PF17283Zn_ribbon_SprT1321362.88.7
TkA01G031880PF13894zf-C2H2_41541630.1513.5
TkA01G031880PF23250zf_DPOE_21561790.1912.2
TkA01G031880PF04810zf-Sec23_Sec241631810.1812.5
TkA01G031880PF23447DUF71281631922.19.0
TkA01G031880PF22995C2CH-3rd_BIRD-IDD1671912.8e-1556.4
TkA01G031880PF13894zf-C2H2_41681880.1513.5
TkA01G031880PF17283Zn_ribbon_SprT1681812.88.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H1F5拟南芥sp|Q8H1F5|IDD7_ARATH Protein indeterminate-domain 754.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SCQ6拟南芥sp|Q9SCQ6|IDD2_ARATH Zinc finger protein GAI-ASSOCIATED FACTOR 181.000%Swiss-Prot低置信
Q9ZWA6拟南芥sp|Q9ZWA6|IDD3_ARATH Zinc finger protein MAGPIE85.400%Swiss-Prot低置信
Q700D2拟南芥sp|Q700D2|IDD10_ARATH Zinc finger protein JACKDAW69.700%Swiss-Prot低置信
O22759拟南芥sp|O22759|IDD12_ARATH Protein indeterminate-domain 1283.500%Swiss-Prot低置信

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