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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G031810
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 8221525-8227562 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2618 bp · TkA01G031810|TK1151|cDNA

GTGTTCAGCAGCCTACGAACCCTTTTCAACGAACAATTGGATTACGATTTCCTGAAACAACATAAAAATCCAATCTTTTGTTTCCCCTTCAAGACATCTCTCCCCCATCTCCCGTAAACCCACCAATTTCTCGCTTAAAGCTCGCAGCCCTTCGAATCAAGCATCTATTTGGTCATTTCTATTCGAGGAAGAAAGGGCGAGACAAAGATCTGACCTTCGATTTAAAAGCGAAGGAGAAAGATGGGCCTAAAACGCCTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2103 bp · TkA01G031810|TK1151|CDS

ATGGGCCTAAAACGCCTTCTTACCCAGGTCTCAAGGCCACAATCACAAGTCAAGCTTCTAAAAAGCTTGTATACCAGATCATACAATACTTCTCAAAACATTGCATCTGATGCAGTTTACAAGGTGCCAGGTGGACAAAGAAGGTTTCAGTCAAGCTATGGGGGTGGTTTTGCACGAAGAATGCGTGAACGCGATGCAGATAGAGCAAATGAGGCATCATTTAGGGAAGTTTACAGAAATGACCCTGAAGCTGTCATAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

700 aa · TkA01G031810|TK1151|PROTEIN

MGLKRLLTQVSRPQSQVKLLKSLYTRSYNTSQNIASDAVYKVPGGQRRFQSSYGGGFARRMRERDADRANEASFREVYRNDPEAVIRQFESQPYLHSNPSALKEYVKALVKVDRLDESELLKTVQRGMTGSSGKSAYDEEMIGSGYSALKNVGKSTKEGLLGTAAAPIHMVATEGGHLKEQIWRTVRALGMTFLLMSGVGALIEDRGITKGLGLHDEVQPSMESSTKFSDVKGVDEAKAELEEIVYYLRDPKRFTRLGGK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G031810
TK1151 IDTkA01G031810
OH-1004 IDLXL04_005592
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G031810
位置Chr01:8221525-8227562 (+)
描述Similar to FTSH4: ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26140 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
At5g53170 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。
FtsH11 protease plays a critical role in Arabidopsis thermotolerance.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02855.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0574500 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
Os01g0574400 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005592 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0006515 protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010304 PSII associated light-harvesting complex II catabolic process 生物过程
GO:0030150 protein import into mitochondrial matrix 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0033619 membrane protein proteolysis 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:0045041 protein import into mitochondrial intermembrane space 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26140
ath:AT5G53170
dosa:Os01g0574400
dosa:Os01g0574500
sce:YPR024W
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.932
排名 1 · TkA01G031810 · TK1151
细胞质0.072
排名 2 · TkA01G031810 · TK1151
细胞核0.058
排名 3 · TkA01G031810 · TK1151
质体0.030
排名 4 · TkA01G031810 · TK1151
细胞膜0.029
排名 5 · TkA01G031810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06068TIP49210-298 aa
PF24389ORC-CDC6-like242-282 aa
PF13481AAA_25257-281 aa
PF02367TsaE259-288 aa
PF06414Zeta_toxin260-285 aa
PF13191AAA_16261-286 aa
PF12775AAA_7263-330 aa
PF00158Sigma54_activat263-283 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G031810PF06068TIP492102986.3e-0626.3
TkA01G031810PF24389ORC-CDC6-like2422820.01315.0
TkA01G031810PF13481AAA_252572810.001718.7
TkA01G031810PF02367TsaE2592880.2112.3
TkA01G031810PF06414Zeta_toxin2602850.1112.7
TkA01G031810PF13191AAA_162612862.9e-0525.3
TkA01G031810PF12775AAA_72633300.02314.9
TkA01G031810PF00158Sigma54_activat2632830.1312.7
TkA01G031810PF07728AAA_52643751.3e-0629.2
TkA01G031810PF05496RuvB_N2643333.3e-0524.4
TkA01G031810PF01695IstB_IS212642860.0215.2
TkA01G031810PF00004AAA2653941.8e-47161.8
TkA01G031810PF13401AAA_222652930.0002622.0
TkA01G031810PF20720nSTAND32653530.001219.2
TkA01G031810PF13521AAA_282652910.003318.4
TkA01G031810PF01078Mg_chelatase2652830.003717.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80983拟南芥sp|O80983|FTSH4_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial77.300%Swiss-Prot高置信
Q9FGM0拟南芥sp|Q9FGM0|FTSHB_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial51.800%Swiss-Prot高置信
Q8LQJ8水稻sp|Q8LQJ8|FTSH5_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 5, mitochondrial75.100%Swiss-Prot高置信
Q8LQJ9水稻sp|Q8LQJ9|FTSH4_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial77.500%Swiss-Prot高置信

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