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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G030080
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 7706013-7710218 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1262 bp · TkA01G030080|TK1151|cDNA

ATGAAACCAGATGGAGTTCTTTTCAGCAATGGACCAGGTGACCCTTCTATGGTTCCTTATGTTGTTAAGATAGTGAAGGGCATAATCGGAAAAGTTGCTGTTTTTGGAATAATCTGTGTGGGACATGAGTTGCTTGGTCAAGCTTTGGGTGGAAAAACATATAAAATGAAGTTTGGTCATCATGGAGGAAAACATCCTGTTCATAACCTTGGAAAGGCCAATGTTGAAATTAGCTCCCATGTCTTGCTTTCCCACAACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1086 bp · TkA01G030080|TK1151|CDS

ATGAAACCAGATGGAGTTCTTTTCAGCAATGGACCAGGTGACCCTTCTATGGTTCCTTATGTTGTTAAGATAGTGAAGGGCATAATCGGAAAAGTTGCTGTTTTTGGAATAATCTGTGTGGGACATGAGTTGCTTGGTCAAGCTTTGGGTGGAAAAACATATAAAATGAAGTTTGGTCATCATGGAGGAAAACATCCTGTTCATAACCTTGGAAAGGCCAATGTTGAAATTAGCTCCCATGTCTTGCTTTCCCACAACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

361 aa · TkA01G030080|TK1151|PROTEIN

MKPDGVLFSNGPGDPSMVPYVVKIVKGIIGKVAVFGIICVGHELLGQALGGKTYKMKFGHHGGKHPVHNLGKANVEISSHVLLSHNKKTSPIKSCAGLAFPRTKKLLLDLMIQTLFRFLSMEGEESLLDSILGADNLEDMEDIDMVDVEEGELLDNNHQIEISQTTSANADTVSQHQQPQSKSNKKHKGKKRNKKKKNGAGPGVMDINRFVLDTCRRLKEPKSYLIWNAVGCLGVPALTDLVKEVDAIQTCGGQKTSDGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G030080
TK1151 IDTkA01G030080
OH-1004 IDLXL04_006793
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 29.917 / OH-1004 28.266
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G030080
位置Chr01:7706013-7710218 (+)
描述Similar to CARA: Carbamoyl-phosphate synthase small chain, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g27740 精氨酸特异性氨甲酰磷酸合酶（CPSase）小亚基。
Analysis of ven3 and ven6 reticulate mutants reveals the importance of arginine biosynthesis in Arabidopsis leaf development.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04425.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0708100 精氨酸特异性氨甲酰磷酸合酶（CPSase）小亚基。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006793 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006207 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process 生物过程
GO:0006526 L-arginine biosynthetic process 生物过程
GO:0006541 glutamine metabolic process 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0044205 'de novo' UMP biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005951 carbamoyl-phosphate synthase complex 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004088 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) activity 分子功能
GO:0004359 glutaminase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ana:alr1155
ath:AT3G27740
dosa:Os02g0708100
syc:syc1970_d
syn:sll1498
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.770
排名 1 · TkA01G030080 · TK1151
细胞质0.258
排名 2 · TkA01G030080 · TK1151
线粒体0.048
排名 3 · TkA01G030080 · TK1151
细胞膜0.041
排名 4 · TkA01G030080 · TK1151
内质网0.033
排名 5 · TkA01G030080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00117GATase1-87 aa
PF13881Rad60-SLD_2148-200 aa
PF10258PHAX_RNA-bd211-290 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G030080PF00117GATase1871.7e-1764.5
TkA01G030080PF13881Rad60-SLD_21482000.05614.3
TkA01G030080PF10258PHAX_RNA-bd2112902.8e-2485.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LVW7拟南芥sp|Q9LVW7|CARA_ARATH Carbamoyl phosphate synthase small chain, chloroplastic56.900%Swiss-Prot低置信
Q6YV23水稻sp|Q6YV23|CARA_ORYSJ Carbamoyl phosphate synthase small chain, chloroplastic56.100%Swiss-Prot低置信

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