基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G013270
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 3427218-3429575
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2277 bp · TkA01G013270|TK1151|cDNA
ATGGGTCGGATTTCGATTTTGATTTACACTATCTTCTATGTTTCAATAGCAAATTCTATTCAGCTTGATAATACCAAAACCTTCATAGTCAGGATTCAAAACGACTTGAAACCATCTGTTTTCACCGATGTAGAACATTGGTATAAGAACAAATTCAACACCATCGAAGATAACCAAGACTTTCTTCATGTCTACAAGACTGTTTTCCATGGCTTTTCAACAAGATTAAGTCCTCAAGAAGCTCAAGAACTGGAAACCCA...
CDS
下载 CDS FASTA2277 bp · TkA01G013270|TK1151|CDS
ATGGGTCGGATTTCGATTTTGATTTACACTATCTTCTATGTTTCAATAGCAAATTCTATTCAGCTTGATAATACCAAAACCTTCATAGTCAGGATTCAAAACGACTTGAAACCATCTGTTTTCACCGATGTAGAACATTGGTATAAGAACAAATTCAACACCATCGAAGATAACCAAGACTTTCTTCATGTCTACAAGACTGTTTTCCATGGCTTTTCAACAAGATTAAGTCCTCAAGAAGCTCAAGAACTGGAAACCCA...
758 aa · TkA01G013270|TK1151|PROTEIN
MGRISILIYTIFYVSIANSIQLDNTKTFIVRIQNDLKPSVFTDVEHWYKNKFNTIEDNQDFLHVYKTVFHGFSTRLSPQEAQELETHPSVMAVLPDETLKLHTTRSIQFLGLDSNEPNTLLKESDYGSNAIIGILDTGISPESSSFHDQDLGPIPSDWKGECMEGEHFTKNLCNKKIIGARYFTAGYDASIGETNGSTQIKSSRDTDGHGTHTASTAAGRVVSNASLFGYAQGVAVGVAPKARIAVYKICWGENCRESDI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G013270 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G013270 |
| OH-1004 ID | LXL04_005843 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 94.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 96.174 / OH-1004 24.926覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G013270 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:3427218-3429575 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to SBT: Subtilisin-like protease | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0009609 response to symbiotic bacterium 生物过程 GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程 GO:0036377 arbuscular mycorrhizal association 生物过程 GO:0005615 extracellular space 细胞组分 GO:0048046 apoplast 细胞组分 GO:0004252 serine-type endopeptidase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | 暂无功能描述 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.596
溶酶体／液泡0.116
细胞膜0.110
细胞质0.083
内质网0.069
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF05922Inhibitor_I927-102 aaPF21864MORF_dom63-101 aaPF00082Peptidase_S8127-573 aaPF21864MORF_dom236-253 aaPF02225PA381-447 aaPF21864MORF_dom605-621 aaPF17766fn3_6647-752 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G013270 | PF05922 | Inhibitor_I9 | 27 | 102 | 1.8e-14 | 54.9 |
| TkA01G013270 | PF21864 | MORF_dom | 63 | 101 | 0.0056 | 17.2 |
| TkA01G013270 | PF00082 | Peptidase_S8 | 127 | 573 | 3.9e-48 | 164.9 |
| TkA01G013270 | PF21864 | MORF_dom | 236 | 253 | 0.0056 | 17.2 |
| TkA01G013270 | PF02225 | PA | 381 | 447 | 9.7e-10 | 39.2 |
| TkA01G013270 | PF21864 | MORF_dom | 605 | 621 | 0.0056 | 17.2 |
| TkA01G013270 | PF17766 | fn3_6 | 647 | 752 | 1.5e-25 | 90.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LUM3 | 拟南芥 | sp|Q9LUM3|SBT15_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.5 | 48.900% | Swiss-Prot | 中等置信 |
O49607 | 拟南芥 | sp|O49607|SBT16_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.6 | 50.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
O65351 | 拟南芥 | sp|O65351|SBT17_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.7 | 48.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9FLI4 | 拟南芥 | sp|Q9FLI4|SBT13_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.3 | 44.400% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9LVJ1 | 拟南芥 | sp|Q9LVJ1|SBT14_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.4 | 47.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |