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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G010920
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 2961626-2969635 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3973 bp · TkA01G010920|TK1151|cDNA

AAAAATGAAAACCCTAGAAAGACAGAAATTTTGATCTACGGCGAAAAAAAGGGTATTTTTATCACCACAAGAACCCTAATTTGGTCTCGTTTGATCGAATCCTTGTTCTCGAATAGGCAGCTTTCATCATTCATACATGAGAGGAGCCAAGCGTCTCGCCGTATCAGAATCCACTGCAGACACCAACAACTTGTTTAGTAAAAAAATCATGGTAGGACCGCAATTTGATTTTCAACGGGCGGAATCATCTCAACAACAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2082 bp · TkA01G010920|TK1151|CDS

ATGGTAGCTTTCGGGAAAAAGTTAAAGGACAGACAAATCGAAGAATGGCAAGGATATTACATCAACTACAAGCTTATGAAGAAAAAAGTTAAACAATATGCTCGACAAATCGAAACCGGAGGTACCGAACATAGACACGTTCTCAAAGATTTTTCAAGAATGCTCGATACCCAGATTGAAAAGATCGTTCTTTTTTTACTGGAACAACAAGGGATTCTTTCAAGCAGGATAGCCAAGCTTGGAGAGCAACAAGAAACTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

693 aa · TkA01G010920|TK1151|PROTEIN

MVAFGKKLKDRQIEEWQGYYINYKLMKKKVKQYARQIETGGTEHRHVLKDFSRMLDTQIEKIVLFLLEQQGILSSRIAKLGEQQETLQIEFDLVKTADLREAYRDIGRDLLKLLFFVEINAIGLRKILKKFDKRFGYRFTDYYVKTRANHPYSQLQQVFKHVGLGAVVGAISRNLVELEDRQGSYQSIYDQPTRPLQDPVIDTIRAAVDRLSYSTNFLTFLGQHALIMHEDLSMPTEETSDDQRYNFTSLFLNLMNTFLY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G010920
TK1151 IDTkA01G010920
OH-1004 IDLXL04_005865
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G010920
位置Chr01:2961626-2969635 (+)
描述Similar to At4g22990: SPX domain-containing membrane protein At4g22990
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22990 含SPX结构域的膜蛋白 At4g22990。 暂无已核实直接文献
At4g11810 含 SPX 结构域的膜蛋白 At4g11810。 暂无已核实直接文献
At1g63010 含SPX结构域的膜蛋白At1g63010。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Y8U6 含SPX结构域的膜蛋白OsI_21475。 暂无已核实直接文献
Os06g0129400 含SPX结构域的膜蛋白 Os06g0129400。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005865 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程
GO:0055062 phosphate ion homeostasis 生物过程
GO:1905011 transmembrane phosphate ion transport from cytosol to vacuole 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63010
ath:AT4G11810
ath:AT4G22990
dosa:Os04g0573000
osa:4336724
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.362
排名 1 · TkA01G010920 · TK1151
高尔基体0.247
排名 2 · TkA01G010920 · TK1151
细胞质0.222
排名 3 · TkA01G010920 · TK1151
内质网0.198
排名 4 · TkA01G010920 · TK1151
细胞膜0.171
排名 5 · TkA01G010920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03105SPX4-38 aa
PF30150YGR130C_N7-93 aa
PF03105SPX49-94 aa
PF03105SPX105-146 aa
PF07690MFS_1256-636 aa
PF00083Sugar_tr261-421 aa
PF00083Sugar_tr557-587 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G010920PF03105SPX4381.3e-1559.1
TkA01G010920PF30150YGR130C_N7930.2611.6
TkA01G010920PF03105SPX49941.3e-1559.1
TkA01G010920PF03105SPX1051461.3e-1559.1
TkA01G010920PF07690MFS_12566366.6e-1968.7
TkA01G010920PF00083Sugar_tr2614213.2e-0523.7
TkA01G010920PF00083Sugar_tr5575873.2e-0523.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZQ5拟南芥sp|Q93ZQ5|SPXM3_ARATH SPX domain-containing membrane protein At4g2299074.200%Swiss-Prot高置信
Q9T050拟南芥sp|Q9T050|SPXM2_ARATH SPX domain-containing membrane protein At4g1181072.600%Swiss-Prot高置信
Q2V4F9拟南芥sp|Q2V4F9|SPXM1_ARATH SPX domain-containing membrane protein At1g6301072.700%Swiss-Prot高置信
A2Y8U6水稻sp|A2Y8U6|SPXM3_ORYSI SPX domain-containing membrane protein OsI_2147568.500%Swiss-Prot高置信
Q658H5水稻sp|Q658H5|SPXM3_ORYSJ SPX domain-containing membrane protein Os06g012940068.500%Swiss-Prot高置信

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