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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G010910
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 2959103-2960850 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

882 bp · TkA01G010910|TK1151|cDNA

TTACCTGTTATGATTATGGGAGCTTTTATTCCTGGACTGAGAAGAAAATACCCCCTACGTGAATATTTTTCTGCTGCTCTTCTTGTTGTTGGATTGATTCTGTTCACGTTAGCAGATGCCAGTAGTTCCCCAAATTTTAGTATTATTGGTGTGGTGATGGTTTCTGGAGCCCTAGTTATGGATTCCTTTTGGATGGAAATGCTATTCTGCTCAACAGTGGTGGGAACGCCTTTCTTGATTCCACCAATGGTGTTAACAGG...

627 bp · TkA01G010910|TK1151|CDS

ATGATTATGGGAGCTTTTATTCCTGGACTGAGAAGAAAATACCCCCTACGTGAATATTTTTCTGCTGCTCTTCTTGTTGTTGGATTGATTCTGTTCACGTTAGCAGATGCCAGTAGTTCCCCAAATTTTAGTATTATTGGTGTGGTGATGGTTTCTGGAGCCCTAGTTATGGATTCCTTTTGGATGGAAATGCTATTCTGCTCAACAGTGGTGGGAACGCCTTTCTTGATTCCACCAATGGTGTTAACAGGAGAATTATT...

208 aa · TkA01G010910|TK1151|PROTEIN

MIMGAFIPGLRRKYPLREYFSAALLVVGLILFTLADASSSPNFSIIGVVMVSGALVMDSFWMEMLFCSTVVGTPFLIPPMVLTGELFRAWDACFEHPYVYGVLVFEAMATFVGQVSVLSLIALFGAATTALVTTARKAVTLLLSYIIFTKPMSEQHVAGLILITAGIMMKMLPDHKIPQTLRLSDAIVKSFPRDEKNEDSDEENRTLV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G010910
TK1151 IDTkA01G010910
OH-1004 IDLXL04_005867
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.830
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G010910
位置Chr01:2959103-2960850 (+)
描述Similar to UTR4: UDP-galactose/UDP-glucose transporter 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12600 糖转运蛋白,参与从细胞质向高尔基体和/或内质网转运核苷酸-糖。 暂无已核实直接文献
At4g23010 参与将 UDP-半乳糖从细胞质运输到高尔基体的糖转运蛋白。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_005867 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006478 peptidyl-tyrosine sulfation 生物过程
GO:0046963 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate transport 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0072334 UDP-galactose transmembrane transport 生物过程
GO:1902558 5'-adenylyl sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005459 UDP-galactose transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12600
ath:AT4G23010
hsa:51000
mmu:108652
pon:100173180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

高尔基体0.624
排名 1 · TkA01G010910 · TK1151
内质网0.214
排名 2 · TkA01G010910 · TK1151
细胞质0.188
排名 3 · TkA01G010910 · TK1151
细胞膜0.086
排名 4 · TkA01G010910 · TK1151
溶酶体/液泡0.058
排名 5 · TkA01G010910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08449UAA1-172 aa
PF00892EamA11-33 aa
PF03151TPT12-38 aa
PF00892EamA51-169 aa
PF03151TPT62-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G010910PF08449UAA11722.2e-40139.4
TkA01G010910PF00892EamA11332.9e-0628.3
TkA01G010910PF03151TPT12380.007316.4
TkA01G010910PF00892EamA511692.9e-0628.3
TkA01G010910PF03151TPT621690.007316.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDX3拟南芥sp|Q9LDX3|UTR4_ARATH UDP-galactose/UDP-glucose transporter 465.200%Swiss-Prot高置信
Q29Q28拟南芥sp|Q29Q28|UTR2_ARATH UDP-galactose/UDP-glucose transporter 264.900%Swiss-Prot高置信

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