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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G010750
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 2912510-2914848 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1614 bp · TkA01G010750|TK1151|cDNA

GCCGGAGGTACTGCAATCGGTTCCGGTAACGGAAAAGCTTACCCCGGAGAGCTCACATCGAACGTCCTCATCACATGTATGGTTGCCGCCTGCGGTGGTCTGATTTTCGGATACGATATCGGAATTTCAGGCGGTGTGACATCCATGACACCATTCCTGGAGAAATTCTTCCCGGACGTTTACGAAAAGGAATCCACAATTGTTGCTTCGAGTAACCAATACTGCAAGTTCAACAGTACGACATTAACCATGTTCACATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1494 bp · TkA01G010750|TK1151|CDS

ATGGTTGCCGCCTGCGGTGGTCTGATTTTCGGATACGATATCGGAATTTCAGGCGGTGTGACATCCATGACACCATTCCTGGAGAAATTCTTCCCGGACGTTTACGAAAAGGAATCCACAATTGTTGCTTCGAGTAACCAATACTGCAAGTTCAACAGTACGACATTAACCATGTTCACATCTTCCTTATACCTAGCTGCATTAGTAGCTTCATGGGCCGCGTCTGTAATTACTAGGGCTTGTGGCCGGAAAAGCTCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

497 aa · TkA01G010750|TK1151|PROTEIN

MVAACGGLIFGYDIGISGGVTSMTPFLEKFFPDVYEKESTIVASSNQYCKFNSTTLTMFTSSLYLAALVASWAASVITRACGRKSSMLIGGCTFCAGALVNAFAENVAMLIIGRLLLGVGIGFANQSVPLYLSEMAPYKSRGALNMMFQLSITIGILIANAANYGFSKISGGWGWRLSLGGAIVPALIFIIGSLCLPDTPNSLIERGKINEAKERLLKIRGVDNVDEEFNDMVAASEESKKIKHPWLNLLRRKYRPQLTF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G010750
TK1151 IDTkA01G010750
OH-1004 IDLXL04_027185
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)72.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.775 / OH-1004 91.171
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G010750
位置Chr01:2912510-2914848 (-)
描述Similar to STC: Sugar carrier protein C
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11260 主要己糖转运蛋白。
Monosaccharide/proton symporter AtSTP1 plays a major role in uptake and response of Arabidopsis seeds and seedlings to sugars.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00935.x
Functional expression of a plant plasma membrane transporter in Xenopus oocytes.1992 · DOI: 10.1016/0014-5793(92)80431-f
Primary structure, genomic organization and heterologous expression of a glucose transporter from Arabidopsis thaliana.1990 · DOI: 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07500.x
Functional reconstitution of the solubilized Arabidopsis thaliana STP1 monosaccharide-H+ symporter in lipid vesicles and purification of the histidine tagged protein from transgenic Saccharomyces cerevisiae.1994 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1994.6020225.x
Steady-state and presteady-state kinetics of the H+/hexose cotransporter (STP1) from Arabidopsis thaliana expressed in Xenopus oocytes.1994 · DOI: 10.1016/s0021-9258(17)32008-2
At4g21480 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0559700 介导通过糖:质子共转运的果糖主动摄取（可能）。
Molecular cloning, functional characterization and expression analysis of a novel monosaccharide transporter gene OsMST6 from rice (Oryza sativa L.).2008 · DOI: 10.1007/s00425-008-0755-8
Os07g0106200 通过糖：质子协同介导对己糖的主动摄取。
Characterization and expression of monosaccharide transporters (osMSTs) in rice.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd016
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027185 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0015749 monosaccharide transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0015145 monosaccharide transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015293 symporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11260
ath:AT4G21480
dosa:Os07g0106200
dosa:Os07g0559700
osa:4343590
rcu:8275367
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.852
排名 1 · TkA01G010750 · TK1151
细胞质0.111
排名 2 · TkA01G010750 · TK1151
内质网0.042
排名 3 · TkA01G010750 · TK1151
线粒体0.037
排名 4 · TkA01G010750 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA01G010750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00083Sugar_tr2-463 aa
PF07690MFS_151-413 aa
PF07690MFS_1428-440 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G010750PF00083Sugar_tr24638.9e-128427.7
TkA01G010750PF07690MFS_1514131.2e-2384.3
TkA01G010750PF07690MFS_14284401.2e-2384.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P23586拟南芥sp|P23586|STP1_ARATH Sugar transport protein 171.200%Swiss-Prot高置信
O65413拟南芥sp|O65413|STP12_ARATH Sugar transport protein 1270.000%Swiss-Prot高置信
Q6Z401水稻sp|Q6Z401|MST6_ORYSJ Sugar transport protein MST667.500%Swiss-Prot高置信
Q7EZD7水稻sp|Q7EZD7|MST3_ORYSJ Sugar transport protein MST366.400%Swiss-Prot高置信

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