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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G006280
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 1615295-1618420 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1113 bp · TkA01G006280|TK1151|cDNA

AAAATGTCCCAAAATCTTCAAGTCATTGTTTCTTTTCTTCAACATTGAATCATTGATTACGAATTTACGATACACCTCCGTCTTCCCGGCGCATCTTTTGCTTCTTGTCGCAACTTCCAGTACGACCGGAAGGTTCAAAGATTATGTCACGTTTAATTCAACATAGGTTATCCCTCTCCAGATTCCTCAACACATCAGGTTCAATCGTGAGAGGAAGATATTTATCAACAGAATCTAATAAAATCAATGAACCATTTAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

849 bp · TkA01G006280|TK1151|CDS

ATGTCACGTTTAATTCAACATAGGTTATCCCTCTCCAGATTCCTCAACACATCAGGTTCAATCGTGAGAGGAAGATATTTATCAACAGAATCTAATAAAATCAATGAACCATTTAAAGTTGAAGAAGCTGAAACAGTAAATATTCCACCTCCTCCAGCAGATAAGTTACTTGTTCTTGGTGGAAGTGGCTTTGTTGGCTCACATGTATGCAAAGAAGCATTAAGTCGTGGCTTGTCTGTTGCTAGTCTTAGCAGATCTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

282 aa · TkA01G006280|TK1151|PROTEIN

MSRLIQHRLSLSRFLNTSGSIVRGRYLSTESNKINEPFKVEEAETVNIPPPPADKLLVLGGSGFVGSHVCKEALSRGLSVASLSRSGKSSIPESWAKKVQWHQGDLLSGDSWKEALIGVTSVVSCVGGFGSNSYMYKINGTANINAIRAAVEKGVKRFVYVSAADTGVINYLLQGYYDGKRAAETELVVRYPYGHVILRPGFIYGNRRVGSTEIPLGVIGSPLEMVLRHAKPLTQIPLVGPLLTPPVNVTAVAKVAVRAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G006280
TK1151 IDTkA01G006280
OH-1004 IDLXL04_029100
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.296
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G006280
位置Chr01:1615295-1618420 (-)
描述Similar to At1g32220: Uncharacterized protein At1g32220, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g32220 未表征蛋白 At1g32220，叶绿体型。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029100 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006695 cholesterol biosynthetic process 生物过程
GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0008203 cholesterol metabolic process 生物过程
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005811 lipid droplet 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G32220
bta:616694
sce:YLR290C
spo:2538806
syn:slr0399
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.902
排名 1 · TkA01G006280 · TK1151
质体0.080
排名 2 · TkA01G006280 · TK1151
细胞质0.075
排名 3 · TkA01G006280 · TK1151
细胞核0.047
排名 4 · TkA01G006280 · TK1151
细胞膜0.027
排名 5 · TkA01G006280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08732HIM131-71 aa
PF05368NmrA54-163 aa
PF04321RmlD_sub_bind55-86 aa
PF01370Epimerase57-164 aa
PF010733Beta_HSD57-192 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd57-116 aa
PF02719Polysacc_synt_257-77 aa
PF13460NAD_binding_1060-206 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G006280PF08732HIM131710.3511.2
TkA01G006280PF05368NmrA541631.1e-0939.0
TkA01G006280PF04321RmlD_sub_bind55860.1811.6
TkA01G006280PF01370Epimerase571644.4e-1453.2
TkA01G006280PF010733Beta_HSD571922.3e-1144.0
TkA01G006280PF16363GDP_Man_Dehyd571160.0008919.5
TkA01G006280PF02719Polysacc_synt_257770.3810.6
TkA01G006280PF13460NAD_binding_10602063e-1970.3
TkA01G006280PF07993NAD_binding_460860.1312.1
TkA01G006280PF07993NAD_binding_41341640.1312.1
TkA01G006280PF04321RmlD_sub_bind1351630.1811.6
TkA01G006280PF08732HIM11372110.3511.2
TkA01G006280PF02719Polysacc_synt_21391630.3810.6
TkA01G006280PF07993NAD_binding_41712130.1312.1
TkA01G006280PF04321RmlD_sub_bind1832070.1811.6
TkA01G006280PF010733Beta_HSD1962072.3e-1144.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FVR6拟南芥sp|Q9FVR6|Y1222_ARATH Uncharacterized protein At1g32220, chloroplastic43.600%Swiss-Prot中等置信

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