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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G001340
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 317593-325065 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4010 bp · TkA01G001340|TK1151|cDNA

TAAAATCTTGGCCGTTAATCAATTTGCATTAAGACAAAAGTAGCCAGCTTTCAAGATGTGGATGTATGCGACAAAATATATTAAATTATGGGCACTTTTATATAGATTAATTCAACGATGTTTCGGGGAATGTACGTAGTTGTTGAGACGTCGACTCCCAAAATTAAAGGTAAAGGATGCATATATTATATATATGCGATGGAACTTATCGCATCAACTCTTTAAGATTCTTTTGCTTTCAGTACTTGTGCTTATAGTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

4233 bp · TkA01G001340|TK1151|CDS

ATGATGTCGTCGATTCTTGAAGAACTGAATCACCTTAGAATTCCACTCGAAGACATAAAACAAGCAACCAACAATTTTGATCGCGGAAATGTGATTGGGCCCGGGGGTTACGGGATGGTGTATGCAGGAGTGCTTTTACACTCAAATGTCTCCACCAAGATTGCAGCAAGGCGACTTGATCGGAGCATAAGCTATGGAGAAAAACATTTCTTAAATGAGATCAGAGTGCTTACTTTATACAAACATGTTAACATTGACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1410 aa · TkA01G001340|TK1151|PROTEIN

MMSSILEELNHLRIPLEDIKQATNNFDRGNVIGPGGYGMVYAGVLLHSNVSTKIAARRLDRSISYGEKHFLNEIRVLTLYKHVNIDDSFMGFCDENDERILVQEFVAYKGLDKFLNNSKLKWLNRLQICLGAARGLDYLHNGLQGHTVIHRHIISRNIVLDTNWQPRITRLTHSILDHEIHHTIDEGIIGKTAYIDPTFLQTGIVTKESDIYSFGVVLFEVLCGRLAYERKENEEQYLGPLATLLYETGKLDEIIDPFLR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G001340
TK1151 IDTkA01G001340
OH-1004 IDLXL04_008501
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.787 / OH-1004 99.929
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G001340
位置Chr01:317593-325065 (+)
描述Similar to HERK1: Receptor-like protein kinase HERK 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008501 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G46290
ath:AT5G39000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.523
排名 1 · TkA01G001340 · TK1151
细胞膜0.334
排名 2 · TkA01G001340 · TK1151
细胞核0.291
排名 3 · TkA01G001340 · TK1151
内质网0.052
排名 4 · TkA01G001340 · TK1151
高尔基体0.040
排名 5 · TkA01G001340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase27-294 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr29-296 aa
PF12895ANAPC3222-270 aa
PF17792ThiD2274-321 aa
PF13663DUF4148281-299 aa
PF12895ANAPC3298-319 aa
PF00069Pkinase355-369 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr358-663 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G001340PF00069Pkinase272941.8e-83280.7
TkA01G001340PF07714PK_Tyr_Ser-Thr292964.3e-103344.8
TkA01G001340PF12895ANAPC32222700.1712.9
TkA01G001340PF17792ThiD22743210.009917.0
TkA01G001340PF13663DUF41482812990.05514.5
TkA01G001340PF12895ANAPC32983190.1712.9
TkA01G001340PF00069Pkinase3553691.8e-83280.7
TkA01G001340PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3586634.3e-103344.8
TkA01G001340PF00069Pkinase3976611.8e-83280.7
TkA01G001340PF01636APH4735320.00716.9
TkA01G001340PF12895ANAPC35956090.1712.9
TkA01G001340PF13663DUF41486446670.05514.5
TkA01G001340PF17792ThiD26757030.009917.0
TkA01G001340PF07714PK_Tyr_Ser-Thr6929614.3e-103344.8
TkA01G001340PF00069Pkinase6979591.8e-83280.7
TkA01G001340PF13663DUF41489499650.05514.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FID8拟南芥sp|Q9FID8|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g3900040.100%Swiss-Prot低置信
Q9FID9拟南芥sp|Q9FID9|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g3899039.200%Swiss-Prot低置信
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970038.500%Swiss-Prot低置信
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 139.100%Swiss-Prot低置信
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR240.300%Swiss-Prot低置信

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