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基因概览

LXL04_039960

当前版本: OH-1004 染色体: JAJTUU010000137.1 坐标: 23922-25855 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1047 bp · LXL04_039960|LXL04_039960|OH1004|cDNA

ATGCCTCAACTAGATCAATTCACTTATTTCACACAATTCTTCTGGTCATGCCTTTTCCTCTTTACTTTCTATATTGCCATATGCAATGATGGAGATGGACTACTTGGGATCAGCAGAATTCTAAAACTACGTAACCAACTGCTTTCACACCGTACGAACAACATCCGGAGCAAGGACCCCAACAGTTTGGAAGATATCTTGAGAAAAGGTTTTAGCACCGGTCTATCCTATATGTACTCCAGTTTATTCGAAGTCTCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1047 bp · LXL04_039960|LXL04_039960|OH1004|CDS

ATGCCTCAACTAGATCAATTCACTTATTTCACACAATTCTTCTGGTCATGCCTTTTCCTCTTTACTTTCTATATTGCCATATGCAATGATGGAGATGGACTACTTGGGATCAGCAGAATTCTAAAACTACGTAACCAACTGCTTTCACACCGTACGAACAACATCCGGAGCAAGGACCCCAACAGTTTGGAAGATATCTTGAGAAAAGGTTTTAGCACCGGTCTATCCTATATGTACTCCAGTTTATTCGAAGTCTCCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

348 aa · LXL04_039960|LXL04_039960|OH1004|PROTEIN

MPQLDQFTYFTQFFWSCLFLFTFYIAICNDGDGLLGISRILKLRNQLLSHRTNNIRSKDPNSLEDILRKGFSTGLSYMYSSLFEVSQWCKAVDLLGKRRKITLISCFGEISGSRGMERNILYLISKRDSFSIRIVEWKALQERYTPFQIAPREDRRSERFSRFSIALFLVGRNSTGRERDQAEPLVELCSFLLSSLAPTVEIGGIWPPKGIAVLDPREIPFLNTLIPLSSGAAVTWAHHAILAGKEKRAVYALVATVSLA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_039960`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_039960

位置 JAJTUU010000137.1:23922-25855 (-)

描述 Similar to YMF19: Putative ATP synthase protein YMF19

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: P93303`	这是线粒体 ATP 酶复合物非酶组分（CF(0) 亚基）的一条链。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039960 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006754 ATP biosynthetic process 生物过程

GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分

GO:0045259 proton-transporting ATP synthase complex 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0050897 cobalt ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G07707

rsz:13630173

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.304

排名 1 · LXL04_039960 · OH-1004

质体0.294

排名 2 · LXL04_039960 · OH-1004

细胞质0.123

排名 3 · LXL04_039960 · OH-1004

细胞核0.122

排名 4 · LXL04_039960 · OH-1004

内质网0.102

排名 5 · LXL04_039960 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02326.21YMF192-82 aa

PF06449.16YMF19_C93-127 aa

PF00510.24COX3188-264 aa

PF00510.24COX3270-300 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_039960	`PF02326.21`	YMF19	2	82	5.8e-24	85.5
LXL04_039960	`PF06449.16`	YMF19_C	93	127	8.5e-20	71.0
LXL04_039960	`PF00510.24`	COX3	188	264	3.9e-33	116.1
LXL04_039960	`PF00510.24`	COX3	270	300	3.9e-33	116.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P93303`	拟南芥	ATP synthase protein YMF19	89.683%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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