基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_039298
当前版本: OH-1004
染色体: JAJTUU010000010.1
坐标: 723946-729140
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1809 bp · LXL04_039298|LXL04_039298|OH1004|cDNA
ATGAAAGCGAGCATAAATGCAATGGTTCTTGAAGGATTCTGTCACAGGGCTGAAAATGCATATGATAATAATGTAAGATATTCCAAAAAATCGGAAAAACCAGCCAAAAGTCGAAGAAGCCACCGGCGTGGCTCGGCCACTAGACTCTGCCGCTGGCAAAGTTTGCTGCTGGAGTCCCCCATACCGCGACGTTCGCCAGCGGCAAACTCACCAAATTCGCATACCGCTGGCCCGTTACCGATCATACCTTCCAGTCTTAC...
CDS
下载 CDS FASTA1809 bp · LXL04_039298|LXL04_039298|OH1004|CDS
ATGAAAGCGAGCATAAATGCAATGGTTCTTGAAGGATTCTGTCACAGGGCTGAAAATGCATATGATAATAATGTAAGATATTCCAAAAAATCGGAAAAACCAGCCAAAAGTCGAAGAAGCCACCGGCGTGGCTCGGCCACTAGACTCTGCCGCTGGCAAAGTTTGCTGCTGGAGTCCCCCATACCGCGACGTTCGCCAGCGGCAAACTCACCAAATTCGCATACCGCTGGCCCGTTACCGATCATACCTTCCAGTCTTAC...
602 aa · LXL04_039298|LXL04_039298|OH1004|PROTEIN
MKASINAMVLEGFCHRAENAYDNNVRYSKKSEKPAKSRRSHRRGSATRLCRWQSLLLESPIPRRSPAANSPNSHTAGPLPIIPSSLTVFVFLEQTLLNAFKEYDDKNTLALSSTSTSRSFTLKCSARSPSPTASVDHSVKFKEASKDGNLIPLYRSIFSDHLTPVLAYRCLVKEDDRDAPSFLFESVEPGLKASSVGRYSRIGAQPTMEIVAKENMVTVMDHHEGVKTEEFVEDRMVVPRRIMEQWKPQRIDELPDAFCE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_039298 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_039298 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | JAJTUU010000010.1:723946-729140 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ASA2: Anthranilate synthase alpha subunit 2, chloroplastic | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000162 L-tryptophan biosynthetic process 生物过程 GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程 GO:0006325 chromatin organization 生物过程 GO:0007076 mitotic chromosome condensation 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009617 response to bacterium 生物过程 GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程 GO:0010032 meiotic chromosome condensation 生物过程 GO:0010311 lateral root formation 生物过程 GO:0010600 regulation of auxin biosynthetic process 生物过程 GO:0051301 cell division 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G29690 ath:AT3G57060 ath:AT5G05730 dosa:Os03g0826500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.449
细胞质0.361
细胞膜0.118
内质网0.102
线粒体0.060
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12717.14Cnd1352-512 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_039298 | PF12717.14 | Cnd1 | 352 | 512 | 5.1e-51 | 173.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
A0A1I9LM04 | 拟南芥 | Condensin-1 complex subunit CAP-D2 | 78.846% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
P32069 | 拟南芥 | Anthranilate synthase alpha subunit 2, chloroplastic | 64.629% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
P32068 | 拟南芥 | Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic | 60.833% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q94GF1 | 水稻 | Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic | 62.201% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
A2XNK3 | 水稻 | Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic | 62.201% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |