LXL04_039041 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_039041

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 57330813-57335322 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1200 bp · LXL04_039041|LXL04_039041|OH1004|cDNA

ATGGGTTTAAGAAGTCCGCTATGGATGCTGATTGTTTGCAGTCAAGTTATGGTAATTGCAGCCGTGACGGACGGAAATGATGTTGCTGCCCTGAATGCTATGAAGTCTACGTGGAAGAATTTACCACCTAATTGGAAAGGTCCAGATCCATGTGGAACTAAATGGGACGGAATTAACTGTACAACGTCACGTGTAACCTCCTTATTCCTTGCAGGCATGGGGGTGAGAACAAACAACATTGAGGATATAACATCACTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1200 bp · LXL04_039041|LXL04_039041|OH1004|CDS

ATGGGTTTAAGAAGTCCGCTATGGATGCTGATTGTTTGCAGTCAAGTTATGGTAATTGCAGCCGTGACGGACGGAAATGATGTTGCTGCCCTGAATGCTATGAAGTCTACGTGGAAGAATTTACCACCTAATTGGAAAGGTCCAGATCCATGTGGAACTAAATGGGACGGAATTAACTGTACAACGTCACGTGTAACCTCCTTATTCCTTGCAGGCATGGGGGTGAGAACAAACAACATTGAGGATATAACATCACTTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

399 aa · LXL04_039041|LXL04_039041|OH1004|PROTEIN

MGLRSPLWMLIVCSQVMVIAAVTDGNDVAALNAMKSTWKNLPPNWKGPDPCGTKWDGINCTTSRVTSLFLAGMGVRTNNIEDITSLSQLENLDLSNNKGIKAPLPPSLENLKNLKTLILVGCSFSGPIPDTVGSLKQLVFLYVFHILVFLYNIIFINDFLQCLAKLINLSWLDLSDNKLRDPFLSNEIALGLDMLKKARHFHLADNQLSGDIRFELFSSDMSLIHDIQQQSIIRNNPFLDWTCGYSSGTINWKFQVLVEQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_039041`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_039041

位置 Chr09:57330813-57335322 (+)

描述 Similar to At5g49770: Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g49760`	富含亮氨酸的重复受体蛋白激酶，充当细胞外过氧化氢的传感器。	Hydrogen peroxide sensor HPCA1 is an LRR receptor kinase in Arabidopsis.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2032-3
`At5g49770`	可能的富含亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At5g49770。	暂无已核实直接文献
`At3g12145`	在长日照 (LD) 条件下促进开花过渡。	暂无已核实直接文献
`At3g14350`	蛋白质 STRUBBELIG-受体家族 7。	暂无已核实直接文献
`At5g16590`	可能参与生长促进真菌的早期识别。	A leucine-rich repeat protein is required for growth promotion and enhanced seed production mediated by the endophytic fungus Piriformospora indica in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03028.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039041 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009593 detection of chemical stimulus 生物过程

GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程

GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程

GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程

GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G12145

ath:AT3G14350

ath:AT5G16590

ath:AT5G49760

ath:AT5G49770

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.388

排名 1 · LXL04_039041 · OH-1004

细胞外0.211

排名 2 · LXL04_039041 · OH-1004

内质网0.180

排名 3 · LXL04_039041 · OH-1004

细胞质0.153

排名 4 · LXL04_039041 · OH-1004

溶酶体／液泡0.101

排名 5 · LXL04_039041 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_1474-240 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_039041	`PF23598.2`	LRR_14	74	240	6.2e-09	35.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GZ99`	拟南芥	Leucine-rich repeat receptor protein kinase HPCA1	43.243%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LT96`	拟南芥	Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770	40.465%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LH52`	拟南芥	Leucine-rich repeat protein FLOR 1	30.846%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9LUL4`	拟南芥	Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7	32.727%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9FMD7`	拟南芥	Probable inactive receptor kinase At5g16590	33.505%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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