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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_038459
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 41531964-41533172 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

708 bp · LXL04_038459|LXL04_038459|OH1004|cDNA

ATGAAAACCAGAGATGATAGAAGTCAAGAAACCCCAGATGTTCATAAAAAAGAGTGGTTGAATCTTAGCCTAGGACAAAACGTAGGTGAAAGTTCACATCCAAAACCCATGAAGGTATACACGTGCAACTTCTGTAAGAGAAACTTCTACAACTCACAAGCATTAGGTGGTCATCAGAATGCACACAAGAGGGAGAGAGATGCCGCTAGAAGATTCCATTCACCAAAAACGATTACCAGCTTTTCTAGAAGCTTCTGGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

708 bp · LXL04_038459|LXL04_038459|OH1004|CDS

ATGAAAACCAGAGATGATAGAAGTCAAGAAACCCCAGATGTTCATAAAAAAGAGTGGTTGAATCTTAGCCTAGGACAAAACGTAGGTGAAAGTTCACATCCAAAACCCATGAAGGTATACACGTGCAACTTCTGTAAGAGAAACTTCTACAACTCACAAGCATTAGGTGGTCATCAGAATGCACACAAGAGGGAGAGAGATGCCGCTAGAAGATTCCATTCACCAAAAACGATTACCAGCTTTTCTAGAAGCTTCTGGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

235 aa · LXL04_038459|LXL04_038459|OH1004|PROTEIN

MKTRDDRSQETPDVHKKEWLNLSLGQNVGESSHPKPMKVYTCNFCKRNFYNSQALGGHQNAHKRERDAARRFHSPKTITSFSRSFWGHRSLGVQTHSLGETTTKNGETSVARFVDNGTRYGVSWGQMYHGEETVELKWPGGFYLDSQQVSQPSDQHILDLNLKLVIGVGAFSSGWVGRIRRQPNLRYRVSRGGARDGFKVVVKSRRMKEMKRVSAGSGRWQLPPDGFVEGDIEHP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_038459
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_038459
位置Chr09:41531964-41533172 (+)
描述Similar to ZFP7: Zinc finger protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g24625 在发芽和早期幼苗发育过程中充当脱落酸 信号传导的负调节因子。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At5g25160 在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At5g14010 可能作为细胞增殖的转录抑制因子，调节发育中的雌蕊基底模式元素沿基端-远端轴的相对大小及花的决定性。 暂无已核实直接文献
At1g66140 在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
At1g80730 可能在芽生长发育调控中起作用，位于光形态发生激活的下游（可能）。
The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
Expression analysis of an Arabidopsis C2H2 zinc finger protein gene.1996 · DOI: 10.1007/bf00020477

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038459 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G24625
ath:AT1G66140
ath:AT1G80730
ath:AT5G14010
ath:AT5G25160
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.914
排名 1 · LXL04_038459 · OH-1004
细胞质0.140
排名 2 · LXL04_038459 · OH-1004
细胞膜0.034
排名 3 · LXL04_038459 · OH-1004
内质网0.022
排名 4 · LXL04_038459 · OH-1004
线粒体0.015
排名 5 · LXL04_038459 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39266拟南芥Zinc finger protein 730.973%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q39262拟南芥Zinc finger protein 335.200%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FFX4拟南芥Zinc finger protein KNUCKLES65.000%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q39263拟南芥Zinc finger protein 430.435%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q42485拟南芥Zinc finger protein 170.588%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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