基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_037613
当前版本: OH-1004
染色体: Chr09
坐标: 15813531-15820715
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3582 bp · LXL04_037613|LXL04_037613|OH1004|cDNA
ATGGAGAATTTTTTAGCTCAATTTCAGTCCATCAAAAACTCTTGTAATCGCCTCGTCATTGCAGTTGACGATGTGAATGATGTGTGGCCTCTTGTCAAGGAAGGATTTGAGAAACGGCTTCCATTCAAAAAAGCTATATTGAACAACAAAACCCGTAATCCTGTAACTGTACATAATCTACCAGCTGAATTCATCCTAGCATCAGATCTAAAGGTCCGAAGTCGCTTCATTCCAGATCAACCATTGTTCTGGTTTCGAGA...
CDS
下载 CDS FASTA3582 bp · LXL04_037613|LXL04_037613|OH1004|CDS
ATGGAGAATTTTTTAGCTCAATTTCAGTCCATCAAAAACTCTTGTAATCGCCTCGTCATTGCAGTTGACGATGTGAATGATGTGTGGCCTCTTGTCAAGGAAGGATTTGAGAAACGGCTTCCATTCAAAAAAGCTATATTGAACAACAAAACCCGTAATCCTGTAACTGTACATAATCTACCAGCTGAATTCATCCTAGCATCAGATCTAAAGGTCCGAAGTCGCTTCATTCCAGATCAACCATTGTTCTGGTTTCGAGA...
1193 aa · LXL04_037613|LXL04_037613|OH1004|PROTEIN
MENFLAQFQSIKNSCNRLVIAVDDVNDVWPLVKEGFEKRLPFKKAILNNKTRNPVTVHNLPAEFILASDLKVRSRFIPDQPLFWFREPYATVVLITCEDLDEFKTILKPRLKLTLQNDEKQWFIVFVSKAARHNDQAYKMAQKVYGRVEVDFNSRKRERCCKYDLHGPEGTFWEELEFKIMECIRNSLDRRIQFYEDEIRKLSELRFMPIWSFCNFFMLKESLAFMFEMAHLNEESLREYDELELCYLETVKNPGRLREF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_037613 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_037613 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr09:15813531-15820715 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to TRS130: Trafficking protein particle complex II-specific subunit 130 homolog | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程 GO:0000919 cell plate assembly 生物过程 GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0006891 intra-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0006901 vesicle coating 生物过程 GO:0034498 early endosome to Golgi transport 生物过程 GO:0099022 vesicle tethering 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005769 early endosome 细胞组分 GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G54440 ddi:DDB_G0273209 ddi:DDB_G0273719 dosa:Os12g0554400 hsa:7109 mmu:216131 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.506
细胞核0.330
高尔基体0.151
内质网0.095
细胞膜0.092
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF23036.3TRAPPC10_1st16-205 aaPF30303.1TRAPPC10-Trs130_NTS312-484 aaPF30303.1TRAPPC10-Trs130_NTS484-633 aaPF28381.1Ig_TRS130641-775 aaPF12584.14TRAPPC10_C1081-1161 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_037613 | PF23036.3 | TRAPPC10_1st | 16 | 205 | 1.6e-18 | 67.4 |
| LXL04_037613 | PF30303.1 | TRAPPC10-Trs130_NTS | 312 | 484 | 3.3e-178 | 593.2 |
| LXL04_037613 | PF30303.1 | TRAPPC10-Trs130_NTS | 484 | 633 | 3.3e-178 | 593.2 |
| LXL04_037613 | PF28381.1 | Ig_TRS130 | 641 | 775 | 2.3e-62 | 209.4 |
| LXL04_037613 | PF12584.14 | TRAPPC10_C | 1081 | 1161 | 2.7e-09 | 37.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。