LXL04_036325 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_036325

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 40067107-40068594 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1488 bp · LXL04_036325|LXL04_036325|OH1004|cDNA

ATGGAAGCTGAAGCTCCACTTCATAAACACATCATCATGGTACCATACATGGCACAAGGTCATCTCATACCTTTCCTAGAATTAGCCCACCgaatcctccaccacaacccCATCTTCACCATCACCATCGTCAACACCGCTCTCAACATCAATTACCTCCGTTCCGCCATCGCTAACCGCCCTTCTGCCCCCCACCAAATCAAACTTAAATCCCTCCCCTTCAACAGCTCCGACCACGGCCTCCCTCCAAACTCCGAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1488 bp · LXL04_036325|LXL04_036325|OH1004|CDS

ATGGAAGCTGAAGCTCCACTTCATAAACACATCATCATGGTACCATACATGGCACAAGGTCATCTCATACCTTTCCTAGAATTAGCCCACCGAATCCTCCACCACAACCCCATCTTCACCATCACCATCGTCAACACCGCTCTCAACATCAATTACCTCCGTTCCGCCATCGCTAACCGCCCTTCTGCCCCCCACCAAATCAAACTTAAATCCCTCCCCTTCAACAGCTCCGACCACGGCCTCCCTCCAAACTCCGAGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

495 aa · LXL04_036325|LXL04_036325|OH1004|PROTEIN

MEAEAPLHKHIIMVPYMAQGHLIPFLELAHRILHHNPIFTITIVNTALNINYLRSAIANRPSAPHQIKLKSLPFNSSDHGLPPNSENTDGLPFTQIIKLFHATTALEAPLRGFISDVIVDEGTPPVCIISDVFMGWANEVAKSFGTVNYSFTTGGAYGSAAYCSIWMNLPHRNLTDGGTHEEFPVPGFPESCRFSITQLHQYLIAADGKDEWSTFFQPQISHSLQSKGWLCNTVEEIETMGCETLRNYTKLPVWCIGPLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_036325`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_036325

位置 Chr08:40067107-40068594 (-)

描述 Similar to UGT92A1: UDP-glycosyltransferase 92A1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g12890`	UDP-糖基转移酶92A1。	暂无已核实直接文献
`At2g36750`	参与反式玉米素和二氢玉米素的 O-葡萄糖基化。	N-glucosylation of cytokinins by glycosyltransferases of Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m409569200
`At2g36780`	UDP-糖基转移酶73C3。	暂无已核实直接文献
`At2g36800`	特异性催化油菜素甾醇的 23-O-葡萄糖基化，可能导致其失活。	Detoxification of the Fusarium mycotoxin deoxynivalenol by a UDP-glucosyltransferase from Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m307552200 N-glucosylation of cytokinins by glycosyltransferases of Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m409569200 The UGT73C5 of Arabidopsis thaliana glucosylates brassinosteroids.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0504279102

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036325 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009636 response to toxic substance 生物过程

GO:0010224 response to UV-B 生物过程

GO:0016117 carotenoid biosynthetic process 生物过程

GO:0016131 brassinosteroid metabolic process 生物过程

GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程

GO:0098754 detoxification 生物过程

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0008194 UDP-glycosyltransferase activity 分子功能

GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G36750

ath:AT2G36780

ath:AT2G36800

ath:AT5G12890

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.609

排名 1 · LXL04_036325 · OH-1004

细胞核0.178

排名 2 · LXL04_036325 · OH-1004

过氧化物酶体0.170

排名 3 · LXL04_036325 · OH-1004

质体0.092

排名 4 · LXL04_036325 · OH-1004

内质网0.053

排名 5 · LXL04_036325 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168.1Glyco_transf_N11-261 aa

PF00201.25UDPGT279-462 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_036325	`PF26168.1`	Glyco_transf_N	11	261	1.4e-10	42.2
LXL04_036325	`PF00201.25`	UDPGT	279	462	2.6e-22	80.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LXV0`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 92A1	42.515%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9ZQ99`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 73C1	32.609%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9ZQ96`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 73C3	32.540%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9ZQ94`	拟南芥	UDP-glycosyltransferase 73C5	32.277%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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