LXL04_035546 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_035546

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 24363245-24365500 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1560 bp · LXL04_035546|LXL04_035546|OH1004|cDNA

ATGAAGCTATCTTTTTCTCTTTCATCAAAACCCCCAAAACCTACTCTAAAACCATCGCAGGATCAACCATCATCGTCTGCGAAAAAAGAGTTCCTCACGGAGTTCGACCCATCCAAACCCGTAACCGATCCCAATTCCAAAAACTCTTTTGTTATCGCTCCAATTTCCAACGAATGGAGACCTCAAAAAAAGATGAGAAACCTCGATCTCCCCGTCAAATCCGACGACCCCAACCTCCAATTCGAAGTCATGAACCACAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1560 bp · LXL04_035546|LXL04_035546|OH1004|CDS

ATGAAGCTATCTTTTTCTCTTTCATCAAAACCCCCAAAACCTACTCTAAAACCATCGCAGGATCAACCATCATCGTCTGCGAAAAAAGAGTTCCTCACGGAGTTCGACCCATCCAAACCCGTAACCGATCCCAATTCCAAAAACTCTTTTGTTATCGCTCCAATTTCCAACGAATGGAGACCTCAAAAAAAGATGAGAAACCTCGATCTCCCCGTCAAATCCGACGACCCCAACCTCCAATTCGAAGTCATGAACCACAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

519 aa · LXL04_035546|LXL04_035546|OH1004|PROTEIN

MKLSFSLSSKPPKPTLKPSQDQPSSSAKKEFLTEFDPSKPVTDPNSKNSFVIAPISNEWRPQKKMRNLDLPVKSDDPNLQFEVMNHTVEQTDPNITYGLNLRSKKDPSPDSDNPKPDRLQSTSIDNLMLNKLRNDLERLPEDRGMEEFEDISVENFASALLKGYGWVEGRGIGKNAKEDVKVVEYKKRTGKEGLGFVNDIPIPPTKKETNERKESGNGSGSGGDGRRGRSKEEVKVRHGGERRSKDRSHSKRSQSHERQE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_035546`
TK1151 ID	TkA04G124350
OH-1004 ID	LXL04_035546
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.746 / OH-1004 75.530 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_035546

位置 Chr08:24363245-24365500 (-)

描述 Similar to MOS2: Protein MOS2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g33520`	对病原体具有先天和诱导抗性所必需的。	MOS2, a protein containing G-patch and KOW motifs, is essential for innate immunity in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1016/j.cub.2005.09.038
`At5g45560`	与磷脂酰肌醇-4-磷酸（PtdIns(4)P）结合。	暂无已核实直接文献
`At4g19040`	可能负向调控水杨酸介导的抗病反应。	Regulation of plant defense responses in Arabidopsis by EDR2, a PH and START domain-containing protein.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02523.x EDR2 negatively regulates salicylic acid-based defenses and cell death during powdery mildew infections of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1186/1471-2229-7-35

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035546 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程

GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009723 response to ethylene 生物过程

GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程

GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:1900056 negative regulation of leaf senescence 生物过程

GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005681 spliceosomal complex 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G33520

ath:AT4G19040

ath:AT5G45560

dre:368735

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.935

排名 1 · LXL04_035546 · OH-1004

细胞质0.192

排名 2 · LXL04_035546 · OH-1004

线粒体0.021

排名 3 · LXL04_035546 · OH-1004

细胞膜0.014

排名 4 · LXL04_035546 · OH-1004

内质网0.008

排名 5 · LXL04_035546 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12656.13G-patch_2140-197 aa

PF25088.2GPKOW_C279-386 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_035546	`PF12656.13`	G-patch_2	140	197	7.2e-19	68.3
LXL04_035546	`PF25088.2`	GPKOW_C	279	386	7.1e-38	129.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C801`	拟南芥	Protein MOS2	61.688%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q8VZF6`	拟南芥	Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like	91.667%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`F4JSE7`	拟南芥	Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2	89.583%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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