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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_034292
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 94864505-94867752 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2163 bp · LXL04_034292|LXL04_034292|OH1004|cDNA

ATGAGCAAAGTCCTGGTCGGCATATTGAAGTCCGTGGAAGCAAAACTCAAAAAATCACAAACATCCGCTAAAAAAAGGGCAATCCGAATTTTCACAACAATGTCTGTCGCCCACGTGGATGACGACGACAGCGATGCAGAAGTTTACAACACCGAGAAGCTCTTCTGTAATGGCGACATCTATATCGGTCAGTGGGCCACCGACACCCCTCATGGAAACGGCAAATACTTATGGTCCGATGGGTGTATGTACTTAGGCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2163 bp · LXL04_034292|LXL04_034292|OH1004|CDS

ATGAGCAAAGTCCTGGTCGGCATATTGAAGTCCGTGGAAGCAAAACTCAAAAAATCACAAACATCCGCTAAAAAAAGGGCAATCCGAATTTTCACAACAATGTCTGTCGCCCACGTGGATGACGACGACAGCGATGCAGAAGTTTACAACACCGAGAAGCTCTTCTGTAATGGCGACATCTATATCGGTCAGTGGGCCACCGACACCCCTCATGGAAACGGCAAATACTTATGGTCCGATGGGTGTATGTACTTAGGCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

720 aa · LXL04_034292|LXL04_034292|OH1004|PROTEIN

MSKVLVGILKSVEAKLKKSQTSAKKRAIRIFTTMSVAHVDDDDSDAEVYNTEKLFCNGDIYIGQWATDTPHGNGKYLWSDGCMYLGDWNNGKIQGKGKFSWPSGATYEGDFKNGFMDGEGTFTGSVNDTYKGSWVMNNKQGKGIRNCVNGDHYDGEWKRGFHNGQGRYHWENGHQYIGQWKNGKMNGNGTMMWANGNRYDGSWEDGLPKGNGTFHWLDGSFYAGIWSRDQKEQSGKFYPATSDVPHDDWDPNQLFSVEMG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_034292
TK1151 IDTkA07G077870
OH-1004 IDLXL04_034292
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)67.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.444
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_034292
位置Chr07:94864505-94867752 (+)
描述Similar to PIP5K6: Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g07960 磷脂酰肌醇 4-磷酸 5-激酶 6。 暂无已核实直接文献
At3g56960 磷脂酰肌醇 4-磷酸 5-激酶 4。 暂无已核实直接文献
At2g41210 磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶5。 暂无已核实直接文献
At1g77740 具有磷脂酰肌醇（PtdIns）磷酸激酶活性（可能）。
Arabidopsis Rab-E GTPases exhibit a novel interaction with a plasma-membrane phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase.2009 · DOI: 10.1242/jcs.053488
At1g21980 催化磷脂酰肌醇4,5-二磷酸和磷脂酰肌醇3,4-二磷酸的合成。
AtPIP5K1, an Arabidopsis thaliana phosphatidylinositol phosphate kinase, synthesizes PtdIns(3,4)P(2) and PtdIns(4,5)P(2) in vitro and is inhibited by phosphorylation.2001 · DOI: 10.1042/0264-6021:3590583

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034292 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0003006 developmental process involved in reproduction 生物过程
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0007164 establishment of tissue polarity 生物过程
GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0009958 positive gravitropism 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0046488 phosphatidylinositol metabolic process 生物过程
GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0072583 clathrin-dependent endocytosis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21980
ath:AT1G77740
ath:AT2G41210
ath:AT3G07960
ath:AT3G56960
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.414
排名 1 · LXL04_034292 · OH-1004
细胞质0.401
排名 2 · LXL04_034292 · OH-1004
细胞核0.232
排名 3 · LXL04_034292 · OH-1004
高尔基体0.067
排名 4 · LXL04_034292 · OH-1004
内质网0.066
排名 5 · LXL04_034292 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02493.27MORN61-83 aa
PF02493.27MORN84-105 aa
PF02493.27MORN107-126 aa
PF02493.27MORN153-174 aa
PF02493.27MORN176-198 aa
PF02493.27MORN199-220 aa
PF01504.25PIP5K425-714 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_034292PF02493.27MORN61831.5e-36122.8
LXL04_034292PF02493.27MORN841051.5e-36122.8
LXL04_034292PF02493.27MORN1071261.5e-36122.8
LXL04_034292PF02493.27MORN1531741.5e-36122.8
LXL04_034292PF02493.27MORN1761981.5e-36122.8
LXL04_034292PF02493.27MORN1992201.5e-36122.8
LXL04_034292PF01504.25PIP5K4257143.8e-99332.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SFB8拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 663.209%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9M1K2拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 457.270%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SLG9拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 556.371%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8L796拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 250.142%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q56YP2拟南芥Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 150.565%Swiss-Prot强数据库同源证据

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