基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_034075
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 79922275-79934779
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1464 bp · LXL04_034075|LXL04_034075|OH1004|cDNA
ATGAAATCTTCAAATCGCTGTTCAGTTATCATCGTCGGAGCCGGAATTTCAGGCATATCGGCAGCGAAGGTATTGGCCCAGAATGGTGTGGAGGACATTTTGATACTTGAGGCGTCGGATAGTGTCGGTGGAAGAATAAAAAAGCACAATTTCGGAAACATATCCGTGGAGCTCGGTGCCGGTTGGATCGCCGGTGTTGGTGGAAAAGAACCTAATCCTGTTTGGGAGTTAGCTGCTCAATCCGGTCTTCGTACATGCTT...
CDS
下载 CDS FASTA1464 bp · LXL04_034075|LXL04_034075|OH1004|CDS
ATGAAATCTTCAAATCGCTGTTCAGTTATCATCGTCGGAGCCGGAATTTCAGGCATATCGGCAGCGAAGGTATTGGCCCAGAATGGTGTGGAGGACATTTTGATACTTGAGGCGTCGGATAGTGTCGGTGGAAGAATAAAAAAGCACAATTTCGGAAACATATCCGTGGAGCTCGGTGCCGGTTGGATCGCCGGTGTTGGTGGAAAAGAACCTAATCCTGTTTGGGAGTTAGCTGCTCAATCCGGTCTTCGTACATGCTT...
487 aa · LXL04_034075|LXL04_034075|OH1004|PROTEIN
MKSSNRCSVIIVGAGISGISAAKVLAQNGVEDILILEASDSVGGRIKKHNFGNISVELGAGWIAGVGGKEPNPVWELAAQSGLRTCFSDYSNARYNIYDRSGEIFPSGVAGDTYKKAVESAIEKLRTDQDSLLAADVSDVPKLSTIPKTPIELAIDFILHDFEMAEVEPISTYVDFGEREFLVADERGYEYLLYKMAEEFLFTSDGKILDNRLKLNTVVRELQHSRDGVTVRTEDGCVYEANYVILSVSIGVLQSPLISF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_034075 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_034075 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:79922275-79934779 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to PAO1: Polyamine oxidase 1 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006598 polyamine catabolic process 生物过程 GO:0046203 spermidine catabolic process 生物过程 GO:0046208 spermine catabolic process 生物过程 GO:1903602 thermospermine catabolic process 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0048046 apoplast 细胞组分 GO:0046592 polyamine oxidase activity 分子功能 GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能 GO:0052897 N8-acetylspermidine:oxygen oxidoreductase (propane-1,3-diamine-forming) activity 分子功能 GO:0052900 spermine oxidase (propane-1,3-diamine-forming) activity 分子功能 GO:0052901 spermine oxidase activity 分子功能 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G13700 dosa:Os09g0368200 dosa:Os09g0368500 zma:541983 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.386
过氧化物酶体0.173
细胞外0.156
细胞核0.119
线粒体0.082
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01494.26FAD_binding_37-36 aaPF01266.31DAO9-106 aaPF13450.13NAD_binding_811-77 aaPF01593.31Amino_oxidase16-432 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_034075 | PF01494.26 | FAD_binding_3 | 7 | 36 | 4.2e-06 | 27.0 |
| LXL04_034075 | PF01266.31 | DAO | 9 | 106 | 6.7e-09 | 36.5 |
| LXL04_034075 | PF13450.13 | NAD_binding_8 | 11 | 77 | 3.5e-12 | 47.1 |
| LXL04_034075 | PF01593.31 | Amino_oxidase | 16 | 432 | 2.7e-67 | 228.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FNA2 | 拟南芥 | Polyamine oxidase 1 | 76.794% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
A0A0P0XM10 | 水稻 | Polyamine oxidase 6 | 46.696% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q0J290 | 水稻 | Polyamine oxidase 7 | 45.561% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |