LXL04_032981 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_032981

当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 32706391-32709923 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1488 bp · LXL04_032981|LXL04_032981|OH1004|cDNA

ATGCAAACAATGAGAAGAAGTCTAGTCCAATGGCTTCTCATTGCCACCTTCTTCACCTCACGAACCATGTCCATGGGTTCACCCAACAGGACTCCAAGACTTAGCCCTATCGACCAACGTTTACGGGACCCGAACACCGTTTTGGCAAGTGTTTCTAGCGACCATGAAACGTTTTTCTACAACCAGACGCTCGATCACTTCAATTACCAGCCCAAAAGTTACACCACCTTCCCACAACGCTATGTTATCAACTCTAAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1488 bp · LXL04_032981|LXL04_032981|OH1004|CDS

ATGCAAACAATGAGAAGAAGTCTAGTCCAATGGCTTCTCATTGCCACCTTCTTCACCTCACGAACCATGTCCATGGGTTCACCCAACAGGACTCCAAGACTTAGCCCTATCGACCAACGTTTACGGGACCCGAACACCGTTTTGGCAAGTGTTTCTAGCGACCATGAAACGTTTTTCTACAACCAGACGCTCGATCACTTCAATTACCAGCCCAAAAGTTACACCACCTTCCCACAACGCTATGTTATCAACTCTAAATG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

495 aa · LXL04_032981|LXL04_032981|OH1004|PROTEIN

MQTMRRSLVQWLLIATFFTSRTMSMGSPNRTPRLSPIDQRLRDPNTVLASVSSDHETFFYNQTLDHFNYQPKSYTTFPQRYVINSKWWGGAHTNAPIFAYFGAEGPIDQDINILGFFPENAPRFNALLVYIEHRFYGQSNPVGSMADSVKNKNLRGYFNSAQALADYAEVLQHIKKKLHAHNSPIIVIGGSYGGMLASWFRLKYPHIAFGALASSAPILYFDHLTPEDGYYSVVTNDFKEASENCYTTIRKSWDEIQKVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_032981`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`LXL04_032981`
位置	Chr07:32706391-32709923 (-)
描述	Similar to PRCP: Lysosomal Pro-X carboxypeptidase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_032981` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0002003 angiotensin maturation 生物过程 GO:0002155 regulation of thyroid hormone receptor signaling pathway 生物过程 GO:0003085 negative regulation of systemic arterial blood pressure 生物过程 GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0042593 glucose homeostasis 生物过程 GO:0043535 regulation of blood vessel endothelial cell migration 生物过程 GO:0097009 energy homeostasis 生物过程 GO:2000377 regulation of reactive oxygen species metabolic process 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005764 lysosome 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0031982 vesicle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	bta:534927 hsa:29952 hsa:5547 mmu:72461 pon:100172335 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.468

排名 1 · LXL04_032981 · OH-1004

细胞外0.291

排名 2 · LXL04_032981 · OH-1004

细胞质0.131

排名 3 · LXL04_032981 · OH-1004

内质网0.123

排名 4 · LXL04_032981 · OH-1004

细胞膜0.060

排名 5 · LXL04_032981 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05577.19Peptidase_S2862-476 aa

PF12146.16Hydrolase_4153-222 aa

PF00326.28Peptidase_S9162-268 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_032981	`PF05577.19`	Peptidase_S28	62	476	5.6e-76	256.8
LXL04_032981	`PF12146.16`	Hydrolase_4	153	222	8.5e-06	26.0
LXL04_032981	`PF00326.28`	Peptidase_S9	162	268	4.1e-06	27.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情