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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_032653
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 27112085-27133607 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4770 bp · LXL04_032653|LXL04_032653|OH1004|cDNA

ATGCATACTATTCAGACCGAGTCCGTTTTTTCTTGTGGGAAGCAGGAGATATGGAGCGGTCAGTGCTTTGTACCAAAAATGGTGTTTCATTGCCGATGTTTCTCGTTCGATGAAGAGGAATATATCGAATATGAAATTGAATCCCAAACTCAAACAAAATCGACCTCAGCTCAAACCTATTATACTGCTTCGTCAGCATTCTCAAACATGGCCGGAAAACCAAATGATTTGAAGACTTTCACACACGCTGAGCTAAAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

4770 bp · LXL04_032653|LXL04_032653|OH1004|CDS

ATGCATACTATTCAGACCGAGTCCGTTTTTTCTTGTGGGAAGCAGGAGATATGGAGCGGTCAGTGCTTTGTACCAAAAATGGTGTTTCATTGCCGATGTTTCTCGTTCGATGAAGAGGAATATATCGAATATGAAATTGAATCCCAAACTCAAACAAAATCGACCTCAGCTCAAACCTATTATACTGCTTCGTCAGCATTCTCAAACATGGCCGGAAAACCAAATGATTTGAAGACTTTCACACACGCTGAGCTAAAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1589 aa · LXL04_032653|LXL04_032653|OH1004|PROTEIN

MHTIQTESVFSCGKQEIWSGQCFVPKMVFHCRCFSFDEEEYIEYEIESQTQTKSTSAQTYYTASSAFSNMAGKPNDLKTFTHAELKTATNNFCSESKIGEGRHGSVYKGMIKSLDHPSDKIPVAVPKDWLVNILGEVDHPNLVKLLGYCLEDNERGKKQLLLVYKYMTNKSVRDHLSTKSETPLSWTRRLKVAHDAALGLAYLHEGLDFEIPYRDFGSSKILLDDEWNAMLSGLWGKKTYAAPEYILTGQVSSKSDVWSY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_032653
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_032653
位置Chr07:27112085-27133607 (-)
描述Similar to PCRK1: Serine/threonine-protein kinase PCRK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g09830 参与早期免疫反应的激活。
The receptor-like cytoplasmic kinase PCRK1 contributes to pattern-triggered immunity against Pseudomonas syringae in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1111/nph.13345
Functional characterization of PCRK1, a putative protein kinase with a role in immunity.2015 · DOI: 10.1080/15592324.2015.1063759
At5g03320 与 PCRK1 在对细菌病原体的基础抗性及植物免疫调控中功能冗余。 暂无已核实直接文献
At5g15080 参与几丁质触发的免疫信号传导，是活性氧 产生所必需的。
Tyrosine phosphorylation of the lectin receptor-like kinase LORE regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.15252/embj.2019102856
Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315
At3g01300 参与几丁质触发的免疫信号传导，是活性氧 产生所必需的。
Tyrosine phosphorylation of the lectin receptor-like kinase LORE regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.15252/embj.2019102856
Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315
At3g28690 参与几丁质诱导的免疫信号传导，并且对于活性氧（ROS）的生成是必需的。
Tyrosine phosphorylation of the lectin receptor-like kinase LORE regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.15252/embj.2019102856
Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032653 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0010088 phloem development 生物过程
GO:0010492 maintenance of shoot apical meristem identity 生物过程
GO:0031663 lipopolysaccharide-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0080142 regulation of salicylic acid biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G09830
ath:AT5G03320
ath:AT5G15080
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.378
排名 1 · LXL04_032653 · OH-1004
细胞质0.298
排名 2 · LXL04_032653 · OH-1004
细胞核0.250
排名 3 · LXL04_032653 · OH-1004
内质网0.104
排名 4 · LXL04_032653 · OH-1004
线粒体0.066
排名 5 · LXL04_032653 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr95-341 aa
PF00069.32Pkinase95-341 aa
PF00501.35AMP-binding496-584 aa
PF00501.35AMP-binding568-655 aa
PF00069.32Pkinase962-1248 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr964-1249 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_032653PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr953411.4e-70238.3
LXL04_032653PF00069.32Pkinase953413.5e-69233.8
LXL04_032653PF00501.35AMP-binding4965842.1e-2073.6
LXL04_032653PF00501.35AMP-binding5686552.1e-2073.6
LXL04_032653PF00069.32Pkinase96212483.5e-69233.8
LXL04_032653PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr96412491.4e-70238.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SF86拟南芥Serine/threonine-protein kinase PCRK167.784%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LZF8拟南芥Serine/threonine-protein kinase PCRK264.781%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LFP7拟南芥Serine/threonine-protein kinase PBL3450.000%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SRH7拟南芥Serine/threonine-protein kinase PBL3548.737%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4J0D2拟南芥Serine/threonine-protein kinase PBL3654.259%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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