基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_032197
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 18532164-18535169
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1821 bp · LXL04_032197|LXL04_032197|OH1004|cDNA
ATGTATCGGTTCGCTGCAGCATTAACTTCCTCCATCAAGCAATCCACATCAAGGAAGCTGGTATCTGGTAGAATCATCTGGACCAGAAACTATGTTGCAAAGGATATCGAGTTTGGATCTAGGGCTCGCGCTGCCATGCTGGTAGGTGTAAACCAGCTTGCTGATGCTGTAAAGGTCACCATGGGACCAAAGGTAACTTTCTCCAGCCTCCAGCCTCCACTTTCTTCCCCGAAATTCAATCAAAGCATTCTCTCACTCTT...
CDS
下载 CDS FASTA1821 bp · LXL04_032197|LXL04_032197|OH1004|CDS
ATGTATCGGTTCGCTGCAGCATTAACTTCCTCCATCAAGCAATCCACATCAAGGAAGCTGGTATCTGGTAGAATCATCTGGACCAGAAACTATGTTGCAAAGGATATCGAGTTTGGATCTAGGGCTCGCGCTGCCATGCTGGTAGGTGTAAACCAGCTTGCTGATGCTGTAAAGGTCACCATGGGACCAAAGGTAACTTTCTCCAGCCTCCAGCCTCCACTTTCTTCCCCGAAATTCAATCAAAGCATTCTCTCACTCTT...
606 aa · LXL04_032197|LXL04_032197|OH1004|PROTEIN
MYRFAAALTSSIKQSTSRKLVSGRIIWTRNYVAKDIEFGSRARAAMLVGVNQLADAVKVTMGPKVTFSSLQPPLSSPKFNQSILSLLCSNQGRNVIIEQSYGSPKVTKDGVTVAKSINFEEKAKNVGANLVKQVASATNSAAGDGTTCATVLTQAIFTEGCKSVAAGVNVMDLRSGINMAVDAVITDLKSRAVMISTPEEITQVATISANGEREIGELIARAMEKVGKEGVITVADGNTLFNELEVVEGMKLGRGYISPY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_032197 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_032197 |
|---|---|
| 位置 | Chr07:18532164-18535169 (+) |
| 描述 | Similar to At3g13860: Chaperonin CPN60-like 2, mitochondrial |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000373 Group II intron splicing 生物过程 GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0042026 protein refolding 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分 GO:0003723 RNA binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G13860 ath:AT3G23990 zma:542707 zma:542736 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
线粒体0.877
细胞质0.096
细胞核0.051
质体0.044
细胞膜0.019
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00118.30Cpn60_TCP191-581 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_032197 | PF00118.30 | Cpn60_TCP1 | 91 | 581 | 7.8e-60 | 203.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。