基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_031879
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 12516617-12520040
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2775 bp · LXL04_031879|LXL04_031879|OH1004|cDNA
ATGGCGGGGGCTCTGGTTCAATCCACCAGCTTTCCTTCAACGGTTGCTGGAGACCGCAAGATCCGTTCAAAAAGATCCGGCAATACAAAAGGAGAAATTAAGATGATGTATAGCGTACAAACACCTCCAATGACAGTAAGGTCTTTCTCCGGTCTACGAGGAACCAATGCTTTAGACAACTTGGTAAAAAGAGGTCAAGATTTCCATTCAAAGGTTGCAGCAGCCACCTCTGTCCGCAAAGCCAAGCCTTCTCGAATTGC...
CDS
下载 CDS FASTA2775 bp · LXL04_031879|LXL04_031879|OH1004|CDS
ATGGCGGGGGCTCTGGTTCAATCCACCAGCTTTCCTTCAACGGTTGCTGGAGACCGCAAGATCCGTTCAAAAAGATCCGGCAATACAAAAGGAGAAATTAAGATGATGTATAGCGTACAAACACCTCCAATGACAGTAAGGTCTTTCTCCGGTCTACGAGGAACCAATGCTTTAGACAACTTGGTAAAAAGAGGTCAAGATTTCCATTCAAAGGTTGCAGCAGCCACCTCTGTCCGCAAAGCCAAGCCTTCTCGAATTGC...
924 aa · LXL04_031879|LXL04_031879|OH1004|PROTEIN
MAGALVQSTSFPSTVAGDRKIRSKRSGNTKGEIKMMYSVQTPPMTVRSFSGLRGTNALDNLVKRGQDFHSKVAAATSVRKAKPSRIAPKAMFERFTEKAIKVIMLAQEEARRLGHNFVGTEQILLGLIGEGTGIAAKVLKSMGINLKDARVEVEKIIGRGSGFVAVEIPFTPRAKRVLELSLEEARQLGHNYIGSEHLLLGLLREGEGVAARVLENLGADPNNIRTQVIRMVGESAEAVGAGVGGGSSNNKMPTLEEYGT...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_031879 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_031879 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:12516617-12520040 (+) | ||||||
| 描述 | Similar to CD4B: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA homolog CD4B, chloroplastic | ||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程 GO:0034605 cellular response to heat 生物过程 GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程 GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009532 plastid stroma 细胞组分 GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分 GO:0009536 plastid 细胞组分 GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分 | ||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G50920 dosa:Os04g0397100 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.571
细胞质0.232
线粒体0.117
细胞核0.113
细胞膜0.054
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF02861.26Clp_N94-216 aaPF02861.26Clp_N170-240 aaPF13191.13AAA_16274-320 aaPF00004.36AAA297-409 aaPF07728.21AAA_5297-375 aaPF05621.18TniB339-433 aaPF17871.8AAA_lid_9435-536 aaPF02151.26UVR509-544 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_031879 | PF02861.26 | Clp_N | 94 | 216 | 1.9e-53 | 180.7 |
| LXL04_031879 | PF02861.26 | Clp_N | 170 | 240 | 1.9e-53 | 180.7 |
| LXL04_031879 | PF13191.13 | AAA_16 | 274 | 320 | 1.4e-10 | 42.7 |
| LXL04_031879 | PF00004.36 | AAA | 297 | 409 | 1.7e-24 | 87.4 |
| LXL04_031879 | PF07728.21 | AAA_5 | 297 | 375 | 1.3e-19 | 71.3 |
| LXL04_031879 | PF05621.18 | TniB | 339 | 433 | 5e-07 | 30.1 |
| LXL04_031879 | PF17871.8 | AAA_lid_9 | 435 | 536 | 4.3e-35 | 120.5 |
| LXL04_031879 | PF02151.26 | UVR | 509 | 544 | 7e-08 | 32.7 |
| LXL04_031879 | PF00158.33 | Sigma54_activat | 612 | 740 | 3.7e-09 | 37.2 |
| LXL04_031879 | PF07724.21 | AAA_2 | 634 | 808 | 5.6e-72 | 241.9 |
| LXL04_031879 | PF07728.21 | AAA_5 | 639 | 760 | 1.3e-19 | 71.3 |
| LXL04_031879 | PF00004.36 | AAA | 640 | 759 | 1.7e-24 | 87.4 |
| LXL04_031879 | PF10431.16 | ClpB_D2-small | 815 | 895 | 1.5e-24 | 86.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。