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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_031287
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 4128727-4131166 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

645 bp · LXL04_031287|LXL04_031287|OH1004|cDNA

ATGGGTGATAATCAGCAGCACAACTATGGTTCAAACATCGGGCATACATCAAGCGCGACTGTGATCCCAGCAAAAAAGAAGCATGTGTCAACTATGATAGCTGAGAAGGCCGTTAAAAAGGTTGCATCGGCTGTAGAAACTTCTTCCTCCGTCGTCGTCTCTCTGTCCCGCGCTTCTTCTGGCGTGGTCCGTAACTCCACTCCGACGGAAACAGGTTTCTGCTCCGACGATTTCCGGCGGACTGCTGTGTTCCTTCCGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

645 bp · LXL04_031287|LXL04_031287|OH1004|CDS

ATGGGTGATAATCAGCAGCACAACTATGGTTCAAACATCGGGCATACATCAAGCGCGACTGTGATCCCAGCAAAAAAGAAGCATGTGTCAACTATGATAGCTGAGAAGGCCGTTAAAAAGGTTGCATCGGCTGTAGAAACTTCTTCCTCCGTCGTCGTCTCTCTGTCCCGCGCTTCTTCTGGCGTGGTCCGTAACTCCACTCCGACGGAAACAGGTTTCTGCTCCGACGATTTCCGGCGGACTGCTGTGTTCCTTCCGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

214 aa · LXL04_031287|LXL04_031287|OH1004|PROTEIN

MGDNQQHNYGSNIGHTSSATVIPAKKKHVSTMIAEKAVKKVASAVETSSSVVVSLSRASSGVVRNSTPTETGFCSDDFRRTAVFLPVCKRQVSYIFGDNPLGMSYVVGYGNNYPKQVHHRGASIAWDHQWHSCAEGSAWLNSSRKSQLPIENIIGGILLCIFLFRDFLPIGMAASSLLANFSNINVHCLILCIKNVHDFFHLVNKVMYHDNGKA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_031287
TK1151 IDTkA08G099970
OH-1004 IDLXL04_031287
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 53.271
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_031287
位置Chr07:4128727-4131166 (-)
描述Similar to KOR2: Endoglucanase 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g65610 内切葡聚糖酶7。 暂无已核实直接文献
At5g49720 纤维素微纤丝形成所需。
KORRIGAN, an Arabidopsis endo-1,4-beta-glucanase, localizes to the cell plate by polarized targeting and is essential for cytokinesis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.7.1137
Temperature-sensitive alleles of RSW2 link the KORRIGAN endo-1,4-beta-glucanase to cellulose synthesis and cytokinesis in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.1.278
An Arabidopsis endo-1,4-beta-D-glucanase involved in cellulose synthesis undergoes regulated intracellular cycling.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.036228
At4g24260 内切葡聚糖酶21。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0736300 内切葡聚糖酶10。 暂无已核实直接文献
Os03g0329500 参与细胞伸长过程中的细胞壁组装。
OsGLU1, a putative membrane-bound endo-1,4-beta-D-glucanase from rice, affects plant internode elongation.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-2972-x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031287 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0030245 cellulose catabolic process 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005769 early endosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65610
ath:AT4G24260
ath:AT5G49720
dosa:Os03g0329500
dosa:Os03g0736300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.332
排名 1 · LXL04_031287 · OH-1004
细胞核0.299
排名 2 · LXL04_031287 · OH-1004
细胞外0.171
排名 3 · LXL04_031287 · OH-1004
细胞膜0.134
排名 4 · LXL04_031287 · OH-1004
内质网0.122
排名 5 · LXL04_031287 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00759.26Glyco_hydro_980-158 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_031287PF00759.26Glyco_hydro_9801588e-1865.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04478拟南芥Endoglucanase 741.053%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q38890拟南芥Endoglucanase 2538.235%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9STW8拟南芥Endoglucanase 2141.304%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q84R49水稻Endoglucanase 1039.583%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
P0C1U4水稻Endoglucanase 942.391%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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