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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_031207
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 2457996-2460267 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2124 bp · LXL04_031207|LXL04_031207|OH1004|cDNA

ATGGAAAAGAATGAAGGGTACAAGTCTACTGAGCAAAAAGAATCAGAAAATCCAGATCCATCATTAAGGATTTCCACATCTCCAAAATCACCAAGATCCCCAAAAACTCGTCATGGCAACAAAGGGAGCCCAGTCAAAGGAATCAGCCCACGAAAAAACGACCGCCATTCCCATTCCGGAACCGACGGCCGTCCCAAAAAAGGTGGTTGTGGCGGGAAGGGAACATGGGGCGGATTACTTGATACGGATGATAATCACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2124 bp · LXL04_031207|LXL04_031207|OH1004|CDS

ATGGAAAAGAATGAAGGGTACAAGTCTACTGAGCAAAAAGAATCAGAAAATCCAGATCCATCATTAAGGATTTCCACATCTCCAAAATCACCAAGATCCCCAAAAACTCGTCATGGCAACAAAGGGAGCCCAGTCAAAGGAATCAGCCCACGAAAAAACGACCGCCATTCCCATTCCGGAACCGACGGCCGTCCCAAAAAAGGTGGTTGTGGCGGGAAGGGAACATGGGGCGGATTACTTGATACGGATGATAATCACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

707 aa · LXL04_031207|LXL04_031207|OH1004|PROTEIN

MEKNEGYKSTEQKESENPDPSLRISTSPKSPRSPKTRHGNKGSPVKGISPRKNDRHSHSGTDGRPKKGGCGGKGTWGGLLDTDDNHFVDNNDPNYTSSEENDKTAVKKVCPRFEEYKKKAAVIVEEYFATDDVVSTANELKDLEMASYSYYFVKKLISMAMDRHDKEKEMAAVLLSSLYADVIDPRQVYKGFRKLVESADDLIVDIPDTVDVLALFVARAVVDDILPPAFLNKESDALPVGSKGIDVIKRADKGYLSAPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_031207
TK1151 IDTkA08G094180
OH-1004 IDLXL04_031207
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 54.455
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_031207
位置Chr07:2457996-2460267 (-)
描述Similar to MRF2: MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g22730 参与雷帕霉素靶点（TOR）调控的翻译控制，尤其在能量缺乏条件下。 暂无已核实直接文献
At5g63190 参与雷帕霉素 靶标调节的翻译控制，尤其是在能量不足的条件下。
MRF Family Genes Are Involved in Translation Control, Especially under Energy-Deficient Conditions, and Their Expression and Functions Are Modulated by the TOR Signaling Pathway.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00563
At4g24800 参与雷帕霉素靶标 调节的翻译控制，尤其是在能量不足的条件下。
EIN2 regulates salt stress response and interacts with a MA3 domain-containing protein ECIP1 in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02363.x
At3g48390 参与雷帕霉素靶点（TOR）调控的翻译控制，尤其在能量缺乏条件下。
MRF Family Genes Are Involved in Translation Control, Especially under Energy-Deficient Conditions, and Their Expression and Functions Are Modulated by the TOR Signaling Pathway.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00563

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031207 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006417 regulation of translation 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0090549 response to carbon starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G22730
ath:AT4G24800
ath:AT5G63190
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.616
排名 1 · LXL04_031207 · OH-1004
细胞核0.341
排名 2 · LXL04_031207 · OH-1004
细胞膜0.126
排名 3 · LXL04_031207 · OH-1004
高尔基体0.076
排名 4 · LXL04_031207 · OH-1004
溶酶体／液泡0.062
排名 5 · LXL04_031207 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02847.24MA3117-227 aa
PF02847.24MA3281-390 aa
PF02847.24MA3415-525 aa
PF02847.24MA3584-692 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_031207PF02847.24MA31172271.6e-104344.5
LXL04_031207PF02847.24MA32813901.6e-104344.5
LXL04_031207PF02847.24MA34155251.6e-104344.5
LXL04_031207PF02847.24MA35846921.6e-104344.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80548拟南芥MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 264.984%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q94BR1拟南芥MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 154.204%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8W4Q4拟南芥MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 351.920%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9STL9拟南芥MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 452.787%Swiss-Prot强数据库同源证据

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