LXL04_030963 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030963

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 125732249-125733155 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

411 bp · LXL04_030963|LXL04_030963|OH1004|cDNA

ATGCTTGAGAAAGGTGCCAAGTCTAGAGTTGTGCAAGTAGACTCTCAAGAAACATGGAATCTCATCACATCTAAACTTATGTATCAAGATTCTCCGATAATAGTGAATTTTACAGCAACATGGTGCATGCCCGCAACAGCAATGGAGCCATTATTTGAAGAACAAGCTTTGATACATAAAGACGCCCTGTTCTTATCCGTTGATGTGGATGAGGCGAAGGGgttgatgaagaagatgaaaatAAGAGCTATGCCCACGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

411 bp · LXL04_030963|LXL04_030963|OH1004|CDS

ATGCTTGAGAAAGGTGCCAAGTCTAGAGTTGTGCAAGTAGACTCTCAAGAAACATGGAATCTCATCACATCTAAACTTATGTATCAAGATTCTCCGATAATAGTGAATTTTACAGCAACATGGTGCATGCCCGCAACAGCAATGGAGCCATTATTTGAAGAACAAGCTTTGATACATAAAGACGCCCTGTTCTTATCCGTTGATGTGGATGAGGCGAAGGGGTTGATGAAGAAGATGAAAATAAGAGCTATGCCCACGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

136 aa · LXL04_030963|LXL04_030963|OH1004|PROTEIN

MLEKGAKSRVVQVDSQETWNLITSKLMYQDSPIIVNFTATWCMPATAMEPLFEEQALIHKDALFLSVDVDEAKGLMKKMKIRAMPTFIMMTCNKKREWVVMDKVVGANPNEIKKRIAAFIHFIRKQIKNNVEVLVN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030963`
TK1151 ID	TkA07G441660
OH-1004 ID	LXL04_030963
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030963

位置 Chr06:125732249-125733155 (-)

描述 Similar to CXXS1: Thioredoxin-like protein CXXS1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g11530`	具有低二硫键还原酶活性，但具有高效的蛋白质二硫键异构酶活性。	AtCXXS: atypical members of the Arabidopsis thaliana thioredoxin h family with a remarkably high disulfide isomerase activity.2008 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2008.01093.x
`At3g51030`	硫醇-二硫氧化还原酶，参与多种胞质酶的氧化还原调控。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0629500`	类硫氧还蛋白CXXS1。	暂无已核实直接文献
`Os03g0800700`	可能的硫醇-二硫氧化还原酶，可能参与多种胞质酶的氧化还原调节。	暂无已核实直接文献
`Os07g0190800`	可能的硫醇-二硫氧化还原酶，可能参与多种胞质酶的氧化还原调节。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030963 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0043085 positive regulation of catalytic activity 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0003756 protein disulfide isomerase activity 分子功能

GO:0008047 enzyme activator activity 分子功能

GO:0015035 protein-disulfide reductase activity 分子功能

GO:0016671 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G11530

ath:AT3G51030

dosa:Os03g0800700

dosa:Os04g0629500

dosa:Os07g0190800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.534

排名 1 · LXL04_030963 · OH-1004

细胞核0.333

排名 2 · LXL04_030963 · OH-1004

线粒体0.137

排名 3 · LXL04_030963 · OH-1004

内质网0.094

排名 4 · LXL04_030963 · OH-1004

细胞膜0.082

排名 5 · LXL04_030963 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00085.27Thioredoxin24-117 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030963	`PF00085.27`	Thioredoxin	24	117	7.3e-16	58.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8LDI5`	拟南芥	Thioredoxin-like protein CXXS1	47.009%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`P29448`	拟南芥	Thioredoxin H1	36.036%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q0J9V5`	水稻	Thioredoxin-like protein CXXS1	39.316%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q851R5`	水稻	Thioredoxin H2-2	34.711%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q6Z4I3`	水稻	Thioredoxin H2-1	33.333%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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