LXL04_030953 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030953

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 125595378-125598340 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1053 bp · LXL04_030953|LXL04_030953|OH1004|cDNA

ATGCTCCGAGCTATTACTCTCAGACGCTTAGTCGCACATACTCCTCGTTCAATCTCATATTGTAGACACCTTGGAACATTAGTTATAGCAGAACATGAAGGTGGTTCACTGACTGGCACTTCCCTGAGTTCAATAGAAGCTTCCAGCAAGTTCTTATGTAAAGACAACTCTTTATCATTGCTATTGGCTGGGACAGGCCCATCTTTACAAGAGGCTGCTACAAAAGCTGCTTCATGTCATCCTTCCATTTCTCAGGTGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1053 bp · LXL04_030953|LXL04_030953|OH1004|CDS

ATGCTCCGAGCTATTACTCTCAGACGCTTAGTCGCACATACTCCTCGTTCAATCTCATATTGTAGACACCTTGGAACATTAGTTATAGCAGAACATGAAGGTGGTTCACTGACTGGCACTTCCCTGAGTTCAATAGAAGCTTCCAGCAAGTTCTTATGTAAAGACAACTCTTTATCATTGCTATTGGCTGGGACAGGCCCATCTTTACAAGAGGCTGCTACAAAAGCTGCTTCATGTCATCCTTCCATTTCTCAGGTGCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

350 aa · LXL04_030953|LXL04_030953|OH1004|PROTEIN

MLRAITLRRLVAHTPRSISYCRHLGTLVIAEHEGGSLTGTSLSSIEASSKFLCKDNSLSLLLAGTGPSLQEAATKAASCHPSISQVLVADSDRFKHSLAEPWAKLIHLVQQKGDYSHIVAASGSFGKNILPRAAALLDVSPITDVIEISEPRTFVRPIYAGNALCTIRYTGSNPCMLTIRSTSFPVSASSDSKTNAAPIHQVDLSSLGEEGTSRHVKQTTQESERPDLGSARVVITGGRALKSAENFKMIEELAEKLGAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030953`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030953

位置 Chr06:125595378-125598340 (-)

描述 Similar to ETFA: Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g50940`	异二聚体电子转移黄素蛋白，可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0835400`	异二聚体电子转移黄素蛋白，可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2XNR6`	异二聚体电子转移黄素蛋白，可接受来自多种线粒体脱氢酶的电子。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030953 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009063 amino acid catabolic process 生物过程

GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程

GO:0033539 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0045251 electron transfer flavoprotein complex 细胞组分

GO:0005507 copper ion binding 分子功能

GO:0009055 electron transfer activity 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G50940

dosa:Os03g0835400

hsa:2108

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.921

排名 1 · LXL04_030953 · OH-1004

细胞质0.126

排名 2 · LXL04_030953 · OH-1004

细胞核0.073

排名 3 · LXL04_030953 · OH-1004

细胞膜0.028

排名 4 · LXL04_030953 · OH-1004

质体0.019

排名 5 · LXL04_030953 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01012.28ETF26-205 aa

PF00766.26ETF_alpha227-307 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030953	`PF01012.28`	ETF	26	205	5.7e-36	124.7
LXL04_030953	`PF00766.26`	ETF_alpha	227	307	1.3e-35	121.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C6I6`	拟南芥	Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial	68.802%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q75LJ3`	水稻	Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial	70.149%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`A2XNR6`	水稻	Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial	70.149%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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