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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_030602
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 119440794-119441682 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

363 bp · LXL04_030602|LXL04_030602|OH1004|cDNA

ATGGTGCGTTTACAGCTTGATCCATTTCTCAGTGAACTAACTAACATGTTTGAGCACACTACAGAAAAAGGATCTGTGTGGGTTACTCTCAAACACTCTTCTGACAAGTCTAAGGTACAGAGAGATAAGATGGAAAGTTCTGGTAAAGAAGTTGAGTTCAAGTGTCTTATTAGAGCAACTGATGGCAAAAAGAACATTTCCACATtgGTTGGAATGAAGGACCATCAACGGTTTCAAGCATCTTATGCTACAATCTTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

363 bp · LXL04_030602|LXL04_030602|OH1004|CDS

ATGGTGCGTTTACAGCTTGATCCATTTCTCAGTGAACTAACTAACATGTTTGAGCACACTACAGAAAAAGGATCTGTGTGGGTTACTCTCAAACACTCTTCTGACAAGTCTAAGGTACAGAGAGATAAGATGGAAAGTTCTGGTAAAGAAGTTGAGTTCAAGTGTCTTATTAGAGCAACTGATGGCAAAAAGAACATTTCCACATTGGTTGGAATGAAGGACCATCAACGGTTTCAAGCATCTTATGCTACAATCTTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

120 aa · LXL04_030602|LXL04_030602|OH1004|PROTEIN

MVRLQLDPFLSELTNMFEHTTEKGSVWVTLKHSSDKSKVQRDKMESSGKEVEFKCLIRATDGKKNISTLVGMKDHQRFQASYATILKARMTSLKKREKKDKRKASDVDKKQQVSKKSAKT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_030602
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_030602
位置Chr06:119440794-119441682 (-)
描述Similar to SRP14: Signal recognition particle 14 kDa protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g43640 信号识别颗粒(SRP)复合物的组成部分，这是一种介导分泌蛋白和膜蛋白共翻译靶向内质网(ER)的核糖核蛋白复合物（通过相似性）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0623700 信号识别颗粒(SRP)复合物的组成部分，这是一种介导分泌蛋白和膜蛋白共翻译靶向内质网(ER)的核糖核蛋白复合物（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030602 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006613 cotranslational protein targeting to membrane 生物过程
GO:0006614 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane 生物过程
GO:0006617 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition 生物过程
GO:0045047 protein targeting to ER 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005786 signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0034774 secretory granule lumen 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0008312 7S RNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G43640
dosa:Os04g0623700
hsa:6727
mcf:101864926
pon:100172315
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.738
排名 1 · LXL04_030602 · OH-1004
细胞质0.275
排名 2 · LXL04_030602 · OH-1004
细胞外0.030
排名 3 · LXL04_030602 · OH-1004
细胞膜0.028
排名 4 · LXL04_030602 · OH-1004
线粒体0.024
排名 5 · LXL04_030602 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02290.21SRP144-93 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_030602PF02290.21SRP144938.3e-2587.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04421拟南芥Signal recognition particle 14 kDa protein69.298%Swiss-Prot强数据库同源证据
O04433水稻Signal recognition particle 14 kDa protein62.385%Swiss-Prot强数据库同源证据

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