LXL04_029991 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_029991

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 105104589-105107153 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1080 bp · LXL04_029991|LXL04_029991|OH1004|cDNA

ATGGATCATGAAGCGGATGCCTTCCGGACGGATTTGATGACCATAACTCGGTTTGTGCTGAATGAACAGTCGAAGCATCCGGAGTCACGAGGGGATTTCAGTATCCTGCTCAGTAACATTGTTCTAGGTTGCAAGTTCGTCTGCTCCGCTGTTAACAAGGTCATCTTATTTCCCCCTAATCAATTGCATTCTGTGTTTTTTTACAAGCGGCAGGTTTGGCAAAACTCATTGGACTTGCAGGGGAGACGAATGTGCAGGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1080 bp · LXL04_029991|LXL04_029991|OH1004|CDS

ATGGATCATGAAGCGGATGCCTTCCGGACGGATTTGATGACCATAACTCGGTTTGTGCTGAATGAACAGTCGAAGCATCCGGAGTCACGAGGGGATTTCAGTATCCTGCTCAGTAACATTGTTCTAGGTTGCAAGTTCGTCTGCTCCGCTGTTAACAAGGTCATCTTATTTCCCCCTAATCAATTGCATTCTGTGTTTTTTTACAAGCGGCAGGTTTGGCAAAACTCATTGGACTTGCAGGGGAGACGAATGTGCAGGCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

359 aa · LXL04_029991|LXL04_029991|OH1004|PROTEIN

MDHEADAFRTDLMTITRFVLNEQSKHPESRGDFSILLSNIVLGCKFVCSAVNKVILFPPNQLHSVFFYKRQVWQNSLDLQGRRMCRQGEEQKKLDVLSNEVFVKALVSSGRTSILVSEEDEEAIFVEKSKRGKYCVVFDPLDGSSNIDCGVSIGTIFGIYMIKDGHDACIEDVLQPGKEMLAAGYCMYGSSCTLVLSTGSGVNGFTLDPSLGEFILTHPDIKTPKKGKIYSVNEGNAKNWDGPTAKYVERCKYPTDGSPA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_029991`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_029991

位置 Chr06:105104589-105107153 (+)

描述 Similar to Fructose-1,6-bisphosphatase, cytosolic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0866400`	催化果糖-1,6-二磷酸到果糖-6-磷酸和无机磷酸的第一个不可逆反应，并在蔗糖生物合成和代谢中发挥重要调控作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029991 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程

GO:0005986 sucrose biosynthetic process 生物过程

GO:0006000 fructose metabolic process 生物过程

GO:0006002 fructose 6-phosphate metabolic process 生物过程

GO:0006094 gluconeogenesis 生物过程

GO:0015979 photosynthesis 生物过程

GO:0030388 fructose 1,6-bisphosphate metabolic process 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0042132 fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

bna:106401056

dosa:Os01g0866400

sot:102588954

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.716

排名 1 · LXL04_029991 · OH-1004

细胞核0.339

排名 2 · LXL04_029991 · OH-1004

内质网0.071

排名 3 · LXL04_029991 · OH-1004

线粒体0.061

排名 4 · LXL04_029991 · OH-1004

过氧化物酶体0.060

排名 5 · LXL04_029991 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00316.26FBPase13-54 aa

PF00316.26FBPase86-219 aa

PF18913.6FBPase_C224-352 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_029991	`PF00316.26`	FBPase	13	54	9.4e-72	241.3
LXL04_029991	`PF00316.26`	FBPase	86	219	9.4e-72	241.3
LXL04_029991	`PF18913.6`	FBPase_C	224	352	6.3e-50	169.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q0JHF8`	水稻	Fructose-1,6-bisphosphatase, cytosolic	79.272%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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