LXL04_029932 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_029932

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 103547620-103549094 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

654 bp · LXL04_029932|LXL04_029932|OH1004|cDNA

ATGGAATCCTTCTGTTCGTTCTTGGATGGTTGGAGTTACGAATCTCTCACGAATTTCCGTCCAATCTCTCCCGAAGTTCAGACTTTTCTAAAACAGGAATATGCCCTCCTATATTTGTTCTTAATAGCAGAAGCAATCGGGGTTTACTTTCACATCTTATGGAATATCGGAGGGCTTCTCACCACTTTGGCAGCATTAGGATGCATGTTTTGGTTACATTATTCTCCTCCCGATGAAGAGCTAAAAGGGGTCTTACTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

654 bp · LXL04_029932|LXL04_029932|OH1004|CDS

ATGGAATCCTTCTGTTCGTTCTTGGATGGTTGGAGTTACGAATCTCTCACGAATTTCCGTCCAATCTCTCCCGAAGTTCAGACTTTTCTAAAACAGGAATATGCCCTCCTATATTTGTTCTTAATAGCAGAAGCAATCGGGGTTTACTTTCACATCTTATGGAATATCGGAGGGCTTCTCACCACTTTGGCAGCATTAGGATGCATGTTTTGGTTACATTATTCTCCTCCCGATGAAGAGCTAAAAGGGGTCTTACTAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

217 aa · LXL04_029932|LXL04_029932|OH1004|PROTEIN

MESFCSFLDGWSYESLTNFRPISPEVQTFLKQEYALLYLFLIAEAIGVYFHILWNIGGLLTTLAALGCMFWLHYSPPDEELKGVLLIMACNILKGASFSPIINLAIDFDPSIMLTQLTGAAITLACFSIATMLSRRREYIYLGTLVFSSVLIFFWLDVASKIFGGDIALLQFEFYIVLLVFVGWMVVLTQVEIWNEESLEEEEEEEKLKLATNNNVV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_029932`
TK1151 ID	TkA07G360330
OH-1004 ID	LXL04_029932
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	98.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.490 / OH-1004 89.862 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_029932

位置 Chr06:103547620-103549094 (+)

描述 Similar to BI-1: Bax inhibitor 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g47120`	凋亡抑制蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0125300`	凋亡抑制蛋白。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029932 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000038 very long-chain fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程

GO:0002638 negative regulation of immunoglobulin production 生物过程

GO:0006914 autophagy 生物过程

GO:0006983 ER overload response 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0010523 negative regulation of calcium ion transport into cytosol 生物过程

GO:0033119 negative regulation of RNA splicing 生物过程

GO:0034620 cellular response to unfolded protein 生物过程

GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程

GO:0042761 very long-chain fatty acid biosynthetic process 生物过程

GO:0043069 negative regulation of programmed cell death 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G47120

dosa:Os02g0125300

hsa:7009

pon:100173088

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.637

排名 1 · LXL04_029932 · OH-1004

高尔基体0.176

排名 2 · LXL04_029932 · OH-1004

细胞质0.130

排名 3 · LXL04_029932 · OH-1004

细胞核0.124

排名 4 · LXL04_029932 · OH-1004

溶酶体／液泡0.079

排名 5 · LXL04_029932 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01027.27Bax1-I26-193 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_029932	`PF01027.27`	Bax1-I	26	193	3.3e-23	83.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LD45`	拟南芥	Bax inhibitor 1	47.489%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9MBD8`	水稻	Bax inhibitor 1	43.415%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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