基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029884
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 102783852-102788759
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2341 bp · LXL04_029884|LXL04_029884|OH1004|cDNA
TGCTTCTTCGCTTCAAGACGGCGTCGCACGTCACCCCAAGGGCCCAACGACCCACCACTCCTAGTAATAAAACCCCATCTAAATCCTCTTCCCTGCATCTATAGTCCCAATTTTGTTAAAAACAGAAGTTTCTTCTACTACACTACACACGATGGGAGGAACATCAACGATCTCAGTTGGCTCCGATGGGGTGGCTATCATCACCATCATCAACCCACCTGTTAATTCACTTTCTCTCGATGGTGCAAAAGGCAAATTTT...
CDS
下载 CDS FASTA2229 bp · LXL04_029884|LXL04_029884|OH1004|CDS
TTGTTAAAAACAGAAGTTTCTTCTACTACACTACACACGATGGGAGGAACATCAACGATCTCAGTTGGCTCCGATGGGGTGGCTATCATCACCATCATCAACCCACCTGTTAATTCACTTTCTCTCGATGGTGCAAAAGGCAAATTTTCTGGTGGTTTTGACATTAGTGCTTTTGGTGGAATGCATGAAGGAAAGGCTATGTCAACAGGACCATCATCAAAACCTGGTTATGTGTCGATCGATATTCTGTCTGACACCCT...
742 aa · LXL04_029884|LXL04_029884|OH1004|PROTEIN
MLKTEVSSTTLHTMGGTSTISVGSDGVAIITIINPPVNSLSLDGAKGKFSGGFDISAFGGMHEGKAMSTGPSSKPGYVSIDILSDTLEAARKPSVAAIDGLALGGGLEIAMACHARIATSTAQLGLPELQLGVIPGFGGTQRLPRLVGLAKALEMMLTSKPVRGLEAHTLGLVDEIVPGDQLLQTARKYALDILERRKPWISTLYKTDKLEPLGEAREILNFARAQARRQAPNLHHPQVCINVIEEGIVSGPRAGLIKEY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029884 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029884 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:102783852-102788759 (+) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to Glyoxysomal fatty acid beta-oxidation multifunctional protein MFP-a | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006635 fatty acid beta-oxidation 生物过程 GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0009845 seed germination 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0005730 nucleolus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005777 peroxisome 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005874 microtubule 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G06860 ath:AT4G29010 bna:106389027 csv:101210295 dosa:Os02g0274100 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
过氧化物酶体0.584
线粒体0.212
细胞质0.176
质体0.068
细胞核0.053
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF16113.11ECH_235-184 aaPF00378.26ECH_142-203 aaPF02737.253HCDH_N303-481 aaPF00725.283HCDH484-577 aaPF00725.283HCDH647-725 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029884 | PF16113.11 | ECH_2 | 35 | 184 | 1.6e-18 | 68.0 |
| LXL04_029884 | PF00378.26 | ECH_1 | 42 | 203 | 6.5e-31 | 108.3 |
| LXL04_029884 | PF02737.25 | 3HCDH_N | 303 | 481 | 1.2e-61 | 208.5 |
| LXL04_029884 | PF00725.28 | 3HCDH | 484 | 577 | 2.9e-27 | 95.7 |
| LXL04_029884 | PF00725.28 | 3HCDH | 647 | 725 | 2.9e-27 | 95.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9ZPI5 | 拟南芥 | Peroxisomal fatty acid beta-oxidation multifunctional protein MFP2 | 70.040% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9ZPI6 | 拟南芥 | Peroxisomal fatty acid beta-oxidation multifunctional protein AIM1 | 54.472% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8W1L6 | 水稻 | Peroxisomal fatty acid beta-oxidation multifunctional protein | 53.805% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |