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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_029859
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 102328683-102331307 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

642 bp · LXL04_029859|LXL04_029859|OH1004|cDNA

ATGGGCTGCTTTCATTCTACTGTTAGAAAACCGGTTCCTGGACATGAAAACCCTACTATTCTTGCTTCTCAAACAGCCTTTAGTGTCAGTGAAGTTGAAGCACTCTTTGAGCTCTTCAAGAGCATAAGCAGTTCTGTAATCGATGATGGATTAATTAACAAGGAAGAATTTCAACTAGCTTTATTCAAGAACAGGAAGAAAGAGAATTTATTTGCAAACAGGATATTTGATCTTTTTGATGTGAAACAAAAGGGTGTTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

642 bp · LXL04_029859|LXL04_029859|OH1004|CDS

ATGGGCTGCTTTCATTCTACTGTTAGAAAACCGGTTCCTGGACATGAAAACCCTACTATTCTTGCTTCTCAAACAGCCTTTAGTGTCAGTGAAGTTGAAGCACTCTTTGAGCTCTTCAAGAGCATAAGCAGTTCTGTAATCGATGATGGATTAATTAACAAGGAAGAATTTCAACTAGCTTTATTCAAGAACAGGAAGAAAGAGAATTTATTTGCAAACAGGATATTTGATCTTTTTGATGTGAAACAAAAGGGTGTTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

213 aa · LXL04_029859|LXL04_029859|OH1004|PROTEIN

MGCFHSTVRKPVPGHENPTILASQTAFSVSEVEALFELFKSISSSVIDDGLINKEEFQLALFKNRKKENLFANRIFDLFDVKQKGVIDFGDFVRALNVFHPNAPQEDKISFCFKLYDMDGTGFIERQEVKQMLIALLCESELKLADDTIEIILDKTFSEADVDQDGKIDKSEWHNFVTKNPSLLKIMTLPYLRDITTTFPSFVFNSEVEEIAT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_029859
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_029859
位置Chr06:102328683-102331307 (+)
描述Similar to CBL9: Calcineurin B-like protein 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g47100 作为钙传感器参与脱落酸 信号传导和应激诱导的 ABA 生物合成途径。
The calcium sensor calcineurin B-like 9 modulates abscisic acid sensitivity and biosynthesis in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.021311
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
Two calcineurin B-like calcium sensors, interacting with protein kinase CIPK23, regulate leaf transpiration and root potassium uptake in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03236.x
The Calcineurin B-like calcium sensors CBL1 and CBL9 together with their interacting protein kinase CIPK26 regulate the Arabidopsis NADPH oxidase RBOHF.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst009
At4g17615 作为钙传感器，参与生长和发育过程中的信号通路以及响应非生物胁迫。
A calcium sensor and its interacting protein kinase are global regulators of abscisic acid signaling in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1016/s1534-5807(02)00229-0
CBL1, a calcium sensor that differentially regulates salt, drought, and cold responses in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012393
The calcium sensor CBL1 integrates plant responses to abiotic stresses.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01892.x
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
Two calcineurin B-like calcium sensors, interacting with protein kinase CIPK23, regulate leaf transpiration and root potassium uptake in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03236.x
The Calcineurin B-like calcium sensors CBL1 and CBL9 together with their interacting protein kinase CIPK26 regulate the Arabidopsis NADPH oxidase RBOHF.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst009
A novel role for Arabidopsis CBL1 in affecting plant responses to glucose and gibberellin during germination and seedling development.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0056412
At5g55990 充当钙传感器。
Arabidopsis protein kinase PKS5 inhibits the plasma membrane H+ -ATPase by preventing interaction with 14-3-3 protein.2007 · DOI: 10.1105/tpc.105.035626
S-acylation-dependent association of the calcium sensor CBL2 with the vacuolar membrane is essential for proper abscisic acid responses.2012 · DOI: 10.1038/cr.2012.71

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0564800 充当钙传感器。 暂无已核实直接文献
Os02g0291000 充当钙传感器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029859 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G17615
ath:AT5G47100
ath:AT5G55990
dosa:Os02g0291000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.460
排名 1 · LXL04_029859 · OH-1004
细胞膜0.335
排名 2 · LXL04_029859 · OH-1004
细胞核0.164
排名 3 · LXL04_029859 · OH-1004
溶酶体／液泡0.141
排名 4 · LXL04_029859 · OH-1004
高尔基体0.111
排名 5 · LXL04_029859 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00036.39EF-hand_173-97 aa
PF13499.13EF-hand_7106-155 aa
PF00036.39EF-hand_1110-135 aa
PF13405.13EF-hand_6111-135 aa
PF00036.39EF-hand_1153-179 aa
PF13202.13EF-hand_5153-177 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_029859PF00036.39EF-hand_173974.5e-2070.3
LXL04_029859PF13499.13EF-hand_71061559.5e-1555.4
LXL04_029859PF00036.39EF-hand_11101354.5e-2070.3
LXL04_029859PF13405.13EF-hand_61111354.1e-1760.9
LXL04_029859PF00036.39EF-hand_11531794.5e-2070.3
LXL04_029859PF13202.13EF-hand_51531771.3e-1453.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LTB8拟南芥Calcineurin B-like protein 985.446%Swiss-Prot强数据库同源证据
O81445拟南芥Calcineurin B-like protein 183.568%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8LAS7拟南芥Calcineurin B-like protein 264.762%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XC27水稻Calcineurin B-like protein 180.282%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q3HRP0水稻Calcineurin B-like protein 762.381%Swiss-Prot强数据库同源证据

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