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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_029280
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 86018427-86021297 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1067 bp · LXL04_029280|LXL04_029280|OH1004|cDNA

GGTATTGGATAGGTGGGGCAATTGTATTGATCATCATTCTCACCATGCTATTGAAGAAATGGGCAGTTTATTTAGACAACAAAGCACAAGCAAGATCATTAGCTAAAGAACAAGGCGATGAGCATCAGAAGAACATTGGTTTATGTTCATTATCTACTACCAAGAGTATTCGAACTTTTGCACTTGAGGAAATCAAAGCAACAACTAGGGATTTTCGAATAAGGATAGGTGTTGGAGCCACATCGTATGTTTATCTAGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1041 bp · LXL04_029280|LXL04_029280|OH1004|CDS

TTGATCATCATTCTCACCATGCTATTGAAGAAATGGGCAGTTTATTTAGACAACAAAGCACAAGCAAGATCATTAGCTAAAGAACAAGGCGATGAGCATCAGAAGAACATTGGTTTATGTTCATTATCTACTACCAAGAGTATTCGAACTTTTGCACTTGAGGAAATCAAAGCAACAACTAGGGATTTTCGAATAAGGATAGGTGTTGGAGCCACATCGTATGTTTATCTAGCTGACCTTGGTGATGGGCGGTTTGGTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

346 aa · LXL04_029280|LXL04_029280|OH1004|PROTEIN

MIIILTMLLKKWAVYLDNKAQARSLAKEQGDEHQKNIGLCSLSTTKSIRTFALEEIKATTRDFRIRIGVGATSYVYLADLGDGRFGAVKRVMEERGGSQKMFLDEVSILLRISHPNLVGLLGFCLDQGEQLLLLEYIPNKSLFDRLHTRKGKSSGTLSWSSRVSIALDIAYALDYLHSVADPPVIHRDVKSSNILLINDDHAKLADFGLCKLGHDTQSAQTPTIIRGSLGYVDTNYLNTGLLSPKSDVYSFGVLLLELIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_029280
TK1151 IDTkA07G296330
OH-1004 IDLXL04_029280
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)70.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.266
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_029280
位置Chr06:86018427-86021297 (-)
描述Similar to CRCK2: Calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g49730 可能的受体样蛋白激酶At1g49730。 暂无已核实直接文献
At4g00330 钙调蛋白结合受体样胞质激酶2。 暂无已核实直接文献
At5g18610 可能作为受体样胞质激酶，参与几丁质诱导的免疫信号转导。
Selective regulation of the chitin-induced defense response by the Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase PBL27.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12535
The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation.2016 · DOI: 10.15252/embj.201694248
At2g30740 类受体胞质激酶（RLCK），通过磷酸化并激活ABA受体以支持其单体化并增强其ABA结合亲和力，从而在脱水响应中触发脱落酸（ABA）信号；反过来，它们抑制作为ABA反应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶（按相似性）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0540900 可能作为双特异性蛋白激酶（可能）。
The Receptor-Like Cytoplasmic Kinase STRK1 Phosphorylates and Activates CatC, Thereby Regulating H2O2 Homeostasis and Improving Salt Tolerance in Rice.2018 · DOI: 10.1105/tpc.17.01000
The zinc finger protein DHHC09 S-acylates the kinase STRK1 to regulate H2O2 homeostasis and promote salt tolerance in rice.2024 · DOI: 10.1093/plcell/koae001
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029280 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010310 regulation of hydrogen peroxide metabolic process 生物过程
GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G49730
ath:AT2G30740
ath:AT4G00330
ath:AT5G18610
dosa:Os04g0540900
osa:4336539
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.704
排名 1 · LXL04_029280 · OH-1004
细胞质0.207
排名 2 · LXL04_029280 · OH-1004
细胞核0.175
排名 3 · LXL04_029280 · OH-1004
内质网0.054
排名 4 · LXL04_029280 · OH-1004
高尔基体0.031
排名 5 · LXL04_029280 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase66-286 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr66-282 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_029280PF00069.32Pkinase662861.3e-37130.4
LXL04_029280PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr662822.2e-35123.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FX99拟南芥Probable receptor-like protein kinase At1g4973034.808%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8VZJ9拟南芥Calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 238.908%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q1PDV6拟南芥Serine/threonine-protein kinase PBL2740.064%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O49339拟南芥Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 838.144%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7XR88水稻Salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 137.333%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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