基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029253
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 85027499-85033736
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3279 bp · LXL04_029253|LXL04_029253|OH1004|cDNA
ATGCAAGTCTCATGGATGGTATCTGTGGATTATGTGGTGCTATTGGAGGAGTTccagATATGGCGGTGCCAGGTAAGCATGGATCATCGCCATTTAACTGCAGACACTCCACTtgggggtattttggtcaaaacGGTTCTTGATTTGGATCAAAATGCATCCATTACTGAACTTTTAGGCTCAAGAATGAGTTCTTCCGAAATATCCTCACAATTCCATGCAGGAGTGGTTCCTCAAATTCTCGgctttcttttcttctt...
CDS
下载 CDS FASTA3279 bp · LXL04_029253|LXL04_029253|OH1004|CDS
ATGCAAGTCTCATGGATGGTATCTGTGGATTATGTGGTGCTATTGGAGGAGTTCCAGATATGGCGGTGCCAGGTAAGCATGGATCATCGCCATTTAACTGCAGACACTCCACTTGGGGGTATTTTGGTCAAAACGGTTCTTGATTTGGATCAAAATGCATCCATTACTGAACTTTTAGGCTCAAGAATGAGTTCTTCCGAAATATCCTCACAATTCCATGCAGGAGTGGTTCCTCAAATTCTCGGCTTTCTTTTCTTCTT...
1092 aa · LXL04_029253|LXL04_029253|OH1004|PROTEIN
MQVSWMVSVDYVVLLEEFQIWRCQVSMDHRHLTADTPLGGILVKTVLDLDQNASITELLGSRMSSSEISSQFHAGVVPQILGFLFFFFFNGASGTTFTFINYCEFTIWPGILGTPDFNLTGFELTKGNSHSFQTPDVWRGTFWGRTGCNFNGSGNISCTTGDCGTGKMDCNGNTYTKPVTIVEFAVKQFQGLDFYDVSLVDGFNLPILVKATGGSGSGLRSCAKTGCADDLNQRCPPELTLTGGGACRSACQTFGSPEYC...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029253 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029253 |
|---|---|
| 位置 | Chr06:85027499-85033736 (-) |
| 描述 | Similar to CES101: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase CES101 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0006955 immune response 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0009620 response to fungus 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0048544 recognition of pollen 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G11300 ath:AT1G11330 ath:AT1G67520 ath:AT3G16030 ath:AT4G21390 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.833
内质网0.083
细胞质0.075
细胞核0.044
溶酶体／液泡0.035
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00314.23Thaumatin101-312 aaPF01453.31B_lectin364-467 aaPF08276.18PAN_2596-653 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr772-977 aaPF00069.32Pkinase772-972 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029253 | PF00314.23 | Thaumatin | 101 | 312 | 2.1e-69 | 234.1 |
| LXL04_029253 | PF01453.31 | B_lectin | 364 | 467 | 4.3e-24 | 85.7 |
| LXL04_029253 | PF08276.18 | PAN_2 | 596 | 653 | 3.9e-06 | 27.6 |
| LXL04_029253 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 772 | 977 | 3.3e-48 | 165.0 |
| LXL04_029253 | PF00069.32 | Pkinase | 772 | 972 | 1e-43 | 150.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LW83 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase CES101 | 40.421% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O81906 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B120 | 38.975% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O64793 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67520 | 40.952% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SXB8 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11330 | 37.697% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SXB4 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11300 | 38.983% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |