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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_029145
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 81853731-81855846 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1980 bp · LXL04_029145|LXL04_029145|OH1004|cDNA

ATGGAGTGGTTCCTGGAAGAGTTTCAACATCTTAAAATCCAACTCGAAGAGATAAAGTCAGCCACAGACAATTTTAATAGCAGCAAAGTCATCGGAAAAGGTGGGTTTGGGGTGGTTCACGAAGGAGTGCTCTCACACTCCAAGAAGCAAAACACGGTTGCTTTTAAACGGCTAGATCGTAGACATGGGCAAGGCGATCCTGAGTTCTGGAAAGAGATCCTTATGCTTTCCCGTTACACGCACAAAAATCTCATATCACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1980 bp · LXL04_029145|LXL04_029145|OH1004|CDS

ATGGAGTGGTTCCTGGAAGAGTTTCAACATCTTAAAATCCAACTCGAAGAGATAAAGTCAGCCACAGACAATTTTAATAGCAGCAAAGTCATCGGAAAAGGTGGGTTTGGGGTGGTTCACGAAGGAGTGCTCTCACACTCCAAGAAGCAAAACACGGTTGCTTTTAAACGGCTAGATCGTAGACATGGGCAAGGCGATCCTGAGTTCTGGAAAGAGATCCTTATGCTTTCCCGTTACACGCACAAAAATCTCATATCACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

659 aa · LXL04_029145|LXL04_029145|OH1004|PROTEIN

MEWFLEEFQHLKIQLEEIKSATDNFNSSKVIGKGGFGVVHEGVLSHSKKQNTVAFKRLDRRHGQGDPEFWKEILMLSRYTHKNLISLLGFCDEDGEKILVYEFASNGSLDQHLSSTSLTWKQRLKICVGAAMGLCYLHDPKETQQRVIHRDIKSSNILLDENWNAKISDMGLSKIGPANQQHTFLVSNVVGTFGYVDPMYVEMSILTKESDVYSFGVVLFEVLCGRLCFENNNNHFQNLVPMWKKSFKHKKLDEIVFQDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_029145
TK1151 IDTkA07G279330
OH-1004 IDLXL04_029145
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)77.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.504
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_029145
位置Chr06:81853731-81855846 (-)
描述Similar to ITN1: Ankyrin repeat-containing protein ITN1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12360 参与耐盐胁迫。
ITN1, a novel gene encoding an ankyrin-repeat protein that affects the ABA-mediated production of reactive oxygen species and is involved in salt-stress tolerance in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03614.x
At3g04690 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0837000 参与耐盐胁迫。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029145 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04690
ath:AT3G12360
ath:AT3G46290
ath:AT5G28680
dosa:Os01g0837000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.513
排名 1 · LXL04_029145 · OH-1004
细胞质0.371
排名 2 · LXL04_029145 · OH-1004
细胞核0.252
排名 3 · LXL04_029145 · OH-1004
内质网0.046
排名 4 · LXL04_029145 · OH-1004
线粒体0.039
排名 5 · LXL04_029145 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase26-295 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr28-297 aa
PF24521.3Ank_KRIT1341-449 aa
PF12796.14Ank_2344-452 aa
PF24521.3Ank_KRIT1389-485 aa
PF00023.37Ank429-453 aa
PF12796.14Ank_2430-518 aa
PF13637.13Ank_4430-477 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_029145PF00069.32Pkinase262954.5e-43148.3
LXL04_029145PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr282972.1e-42145.9
LXL04_029145PF24521.3Ank_KRIT13414493.5e-1453.5
LXL04_029145PF12796.14Ank_23444521.5e-38132.0
LXL04_029145PF24521.3Ank_KRIT13894853.5e-1453.5
LXL04_029145PF00023.37Ank4294532.4e-35119.3
LXL04_029145PF12796.14Ank_24305181.5e-38132.0
LXL04_029145PF13637.13Ank_44304773.7e-2691.3
LXL04_029145PF13637.13Ank_44675143.7e-2691.3
LXL04_029145PF00023.37Ank4935162.4e-35119.3
LXL04_029145PF13606.13Ank_34935171.1e-2793.4
LXL04_029145PF13857.13Ank_54935354e-2691.5
LXL04_029145PF13637.13Ank_44985483.7e-2691.3
LXL04_029145PF12796.14Ank_25245891.5e-38132.0
LXL04_029145PF13857.13Ank_55556024e-2691.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C7A2拟南芥Ankyrin repeat-containing protein ITN162.798%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SR05拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR147.315%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 143.750%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q3E8W4拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR247.651%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
A2CIR5水稻Ankyrin repeat-containing protein NPR452.500%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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