基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_028312
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 37335921-37341040
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1437 bp · LXL04_028312|LXL04_028312|OH1004|cDNA
ATGGAGCACAATTGCATTGTTTCCTTTATGCTCTTCGTTGCGATAATTTGTATTTATTGCAGAGTTGAGTGTGTGAAAGCGTCTATAGTAACACAAGAAGTATATTCTAAACGCAGTTTTAGACCAAATATAGATACATCTACTCGCAGGAGAAAACTTATTCAAAAGCAAGCTGGAAGTGTTCGGCAAGATGTATGTGCAGGGACAAAAGGGAGAATGCCCAAAACACAGAAAAGTCCATGCCGCAAATTAGTAGTATG...
CDS
下载 CDS FASTA1437 bp · LXL04_028312|LXL04_028312|OH1004|CDS
ATGGAGCACAATTGCATTGTTTCCTTTATGCTCTTCGTTGCGATAATTTGTATTTATTGCAGAGTTGAGTGTGTGAAAGCGTCTATAGTAACACAAGAAGTATATTCTAAACGCAGTTTTAGACCAAATATAGATACATCTACTCGCAGGAGAAAACTTATTCAAAAGCAAGCTGGAAGTGTTCGGCAAGATGTATGTGCAGGGACAAAAGGGAGAATGCCCAAAACACAGAAAAGTCCATGCCGCAAATTAGTAGTATG...
478 aa · LXL04_028312|LXL04_028312|OH1004|PROTEIN
MEHNCIVSFMLFVAIICIYCRVECVKASIVTQEVYSKRSFRPNIDTSTRRRKLIQKQAGSVRQDVCAGTKGRMPKTQKSPCRKLVVWVPKKDGFIEFVNVNDQSKAIDGFSIAIFCHALQLLPYNVQPIFKPFINESGKSNGSYNDLLEHIEGQACQAAAGDITIRGNRAQHVDFTIPYLNSEVYVLVHGSHKWNEKLWNLLRPFTWGLWVTIVAACLFTGVALGILEYRAANPKFSGPIYTQLIMVIWFPIATFFFQEG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_028312 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_028312 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:37335921-37341040 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to GLR3.1: Glutamate receptor 3.1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006816 calcium ion transport 生物过程 GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程 GO:0009416 response to light stimulus 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0010118 stomatal movement 生物过程 GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程 GO:0070417 cellular response to cold 生物过程 GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程 GO:0071260 cellular response to mechanical stimulus 生物过程 GO:0071311 cellular response to acetate 生物过程 GO:1901701 cellular response to oxygen-containing compound 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G05200 ath:AT2G17260 ath:AT2G32400 ath:AT5G11180 osa:124544569 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.770
细胞质0.104
内质网0.079
溶酶体／液泡0.070
细胞外0.043
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00060.33Lig_chan207-450 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_028312 | PF00060.33 | Lig_chan | 207 | 450 | 9.6e-17 | 61.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q7XJL2 | 拟南芥 | Glutamate receptor 3.1 | 35.396% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SDQ4 | 拟南芥 | Glutamate receptor 3.7 | 34.422% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8GXJ4 | 拟南芥 | Glutamate receptor 3.4 | 31.973% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LFN8 | 拟南芥 | Glutamate receptor 2.6 | 31.678% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q7XP59 | 水稻 | Glutamate receptor 3.1 | 34.606% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |