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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_027675
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 21636676-21647216 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4086 bp · LXL04_027675|LXL04_027675|OH1004|cDNA

ATGGTGCTCAAAACCTTCGTCCTTTTATCATTTCTTGTAATTGGTGCTCTATCAGCAGATACTAGTTTGGAAGATGAAGTTGACGCTTTGAAACATTTCAAGAACGCAATCACAGACGACCCACTTGGTGCACTCCTGGATTGGGATTCCGATTCGGATTCAATCCATCACTGCAACTGGACCGGAATCCAATGCGATGATTTGTCAAAAAGTGTAGTTTCGATTTCTATTCAGCAAACATACCTCAAAGGCCAAATTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

4086 bp · LXL04_027675|LXL04_027675|OH1004|CDS

ATGGTGCTCAAAACCTTCGTCCTTTTATCATTTCTTGTAATTGGTGCTCTATCAGCAGATACTAGTTTGGAAGATGAAGTTGACGCTTTGAAACATTTCAAGAACGCAATCACAGACGACCCACTTGGTGCACTCCTGGATTGGGATTCCGATTCGGATTCAATCCATCACTGCAACTGGACCGGAATCCAATGCGATGATTTGTCAAAAAGTGTAGTTTCGATTTCTATTCAGCAAACATACCTCAAAGGCCAAATTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1361 aa · LXL04_027675|LXL04_027675|OH1004|PROTEIN

MVLKTFVLLSFLVIGALSADTSLEDEVDALKHFKNAITDDPLGALLDWDSDSDSIHHCNWTGIQCDDLSKSVVSISIQQTYLKGQISPFLGNLSNLQVLDLSYNSFTGNIPSQLAYCTQLTTLSLYTNSLSGSIPLELGKLQNLQELDLGNNSLTGIIPESLCNITSMVLFSLDENKLNGTIPSRIGDLINLQFLGAFNNLLQGSVPSSIGNLKDLQALAFNQNRLSGVIPIEIGKLSNLQTLLLYNNSLSGKIPPEIGN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_027675
TK1151 IDTkA07G085130
OH-1004 IDLXL04_027675
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.745 / OH-1004 86.334
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_027675
位置Chr06:21636676-21647216 (+)
描述Similar to FLS2: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g46330 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。 暂无已核实直接文献
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0618700 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。
Analysis of flagellin perception mediated by flg22 receptor OsFLS2 in rice.2008 · DOI: 10.1094/mpmi-21-12-1635
Rice OsFLS2-Mediated Perception of Bacterial Flagellins Is Evaded by Xanthomonas oryzae pvs. oryzae and oryzicola.2015 · DOI: 10.1016/j.molp.2015.01.012
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027675 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G20140
ath:AT5G46330
dosa:Os04g0618700
osa:4337016
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.825
排名 1 · LXL04_027675 · OH-1004
内质网0.084
排名 2 · LXL04_027675 · OH-1004
细胞质0.072
排名 3 · LXL04_027675 · OH-1004
溶酶体／液泡0.046
排名 4 · LXL04_027675 · OH-1004
细胞核0.033
排名 5 · LXL04_027675 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_224-66 aa
PF23598.2LRR_1485-222 aa
PF13855.13LRR_890-130 aa
PF12799.14LRR_495-132 aa
PF12799.14LRR_4118-157 aa
PF13855.13LRR_8140-178 aa
PF23598.2LRR_14208-319 aa
PF12799.14LRR_4239-275 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_027675PF08263.18LRRNT_224661.1e-1042.2
LXL04_027675PF23598.2LRR_14852222.8e-54184.9
LXL04_027675PF13855.13LRR_8901303.2e-56187.7
LXL04_027675PF12799.14LRR_4951322.8e-44148.8
LXL04_027675PF12799.14LRR_41181572.8e-44148.8
LXL04_027675PF13855.13LRR_81401783.2e-56187.7
LXL04_027675PF23598.2LRR_142083192.8e-54184.9
LXL04_027675PF12799.14LRR_42392752.8e-44148.8
LXL04_027675PF13855.13LRR_82602983.2e-56187.7
LXL04_027675PF23598.2LRR_143253912.8e-54184.9
LXL04_027675PF23598.2LRR_144025372.8e-54184.9
LXL04_027675PF13855.13LRR_84074653.2e-56187.7
LXL04_027675PF13855.13LRR_84314893.2e-56187.7
LXL04_027675PF13855.13LRR_84785363.2e-56187.7
LXL04_027675PF13855.13LRR_85025623.2e-56187.7
LXL04_027675PF23598.2LRR_145456722.8e-54184.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FL28拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS248.633%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO134.230%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FIZ3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO234.919%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LVP0拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393034.987%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q0JA29水稻LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS246.704%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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